Mechanisms of RNA quality control in the nucleus

V předkládané práci sleduji několik aspektů kontroly kvality RNA v kvasinkách a v savčích buňkách. První část dizertace se zabývá mechanizmy fungujícími v jádře kvasinky Saccharomyces cerevisiae, zejména proteinovými komplexy, které se účastní terminace transkripce a zpracování nekódujících RNA pomo...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Hroššová, Dominika (Autor práce)
Další autoři: Vaňáčová, Štěpánka, 1972- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2014
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/328850/prif_d/
Obálka
LEADER 07517ctm a22013457a 4500
001 MUB01000991081
003 CZ BrMU
005 20141106094645.0
008 140326s2014 xr ||||| |||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-12-14 
035 |a (ISMU-VSKP)159611 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 577.113.8  |2 MRF 
080 |a 577.21  |2 MRF 
100 1 |a Hroššová, Dominika  |% UČO 328850  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
242 1 0 |a Mechanizmy jaderné kontroly kvality RNA  |y cze 
245 1 0 |a Mechanisms of RNA quality control in the nucleus  |h [rukopis] /  |c Dominika Hroššová 
260 |c 2014 
300 |a 188 s. :  |b il. 
500 |a Vedoucí práce: Štěpánka Vaňáčová 
502 |a Dizertace (Ph.D.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2014 
520 2 |a V předkládané práci sleduji několik aspektů kontroly kvality RNA v kvasinkách a v savčích buňkách. První část dizertace se zabývá mechanizmy fungujícími v jádře kvasinky Saccharomyces cerevisiae, zejména proteinovými komplexy, které se účastní terminace transkripce a zpracování nekódujících RNA pomocí RNA polymerázy II. Charakterizuji RNA-vazebné vlastnosti komplexu NNS (Nrd1, Nab3 a Sen1) a molekulové mechanizmy aktivace NNS RNA polymerázou II. V druhé části práce se soustředím na lidský protějšek komplexu NNS, a to komplex NEXT (Nuclear Exosome Targeting), a na kontrolu kvality RNA a na degradaci v cytoplazmě savčích buněk. Popisuji RNA-vazebné vlastnosti podjednotky RBM7 komplexu NEXT a poukazuji na její úlohu ve zpracování a degradaci snRNA. Třetí část usiluje o charakterizaci role uridylovaného 3' konce RNA. Při hledání faktorů působících na netemplátovém oligo(U) 3' konci jsme identifikovali 3'-exonukleázu DIS3L2. Naše experimenty ukazují, že DIS3L2 je nukleáza, která selekti  |% cze 
520 2 9 |a In this thesis I am providing an insight into several aspects of RNA quality control in yeast and in mammalian cells. The first part of the dissertation concerns mechanisms operating in the nucleus of budding yeast Saccharomyces cerevisiae, in particular protein complexes acting during transcription termination and processing of noncoding RNAs by RNA polymerase II. I was involved in the characterization of the RNA-binding properties of the NNS (Nrd1, Nab3 and Sen1) complex and the molecular basis of NNS recruitment by RNA polymerase II. The second part of the thesis work is focused on the NNS-like complex in human cells, called NEXT (Nuclear Exosome Targeting) and on the RNA quality control and degradation in mammalian cytoplasm. Briefly, we have characterized the RNA-binding properties of the RBM7 subunit of the NEXT and point to its role in snRNA processing and degradation. The third part describes our attempts to characterize the role of 3’terminal RNA uridylation. Our search for f  |9 eng 
650 0 7 |a DIS3L2  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a exozómy  |2 czmesh 
650 0 7 |a jaderná RNA  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a NEXT komplex  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a RNA (nukleové kyseliny)  |7 ph125167  |2 czenas 
650 0 7 |a RNA-polymerasa II  |2 czmesh 
650 0 7 |a terminace genetické transkripce  |2 czmesh 
650 0 7 |a úprava a degradace RNA  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a uridylace  |2 CZ-BrMU 
650 0 9 |a Exosomes  |2 eczenas 
650 0 9 |a NEXT complex  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a nuclear RNA  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a ribonucleic acids  |2 eczenas 
650 0 9 |a RNA processing and degradation  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a Transcription Termination, Genetic  |2 eczenas 
650 0 9 |a uridylation  |2 eCZ-BrMU 
650 0 2 |a RNA Polymerase II 
655 7 |a disertace  |7 fd132024  |2 czenas 
658 |a Biochemie (čtyřleté)  |b Biomolekulární chemie  |c PřF D-BCH4 BIOM (BIOM)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Vaňáčová, Štěpánka,  |d 1972-  |7 mub2010613414  |% UČO 105562  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Národní centrum pro výzkum biomolekul  |7 kn20100614011  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/328850/prif_d/ 
CAT |c 20140326  |l MUB01  |h 0420 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20140401  |l MUB01  |h 1457 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140417  |l MUB01  |h 1230 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140428  |l MUB01  |h 1333 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140428  |l MUB01  |h 1350 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20140829  |l MUB01  |h 1425 
CAT |c 20140911  |l MUB01  |h 1613 
CAT |c 20140912  |l MUB01  |h 1107 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141104  |l MUB01  |h 1320 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20141106  |l MUB01  |h 0946 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20150107  |l MUB01  |h 1127 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1451 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1412 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20151203  |l MUB01  |h 1045 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0449 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20161212  |l MUB01  |h 1547 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170829  |l MUB01  |h 0007 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180828  |l MUB01  |h 0911 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181106  |l MUB01  |h 0732 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 1433 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190228  |l MUB01  |h 1419 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190605  |l MUB01  |h 1343 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190620  |l MUB01  |h 0746 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 0849 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1211 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1218 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200123  |l MUB01  |h 1134 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200123  |l MUB01  |h 1137 
CAT |c 20200306  |l MUB01  |h 1847 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200323  |l MUB01  |h 1958 
CAT |a FUKSOVAX  |b 02  |c 20200924  |l MUB01  |h 1319 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 1125 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 1127 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201112  |l MUB01  |h 0515 
CAT |c 20201214  |l MUB01  |h 1118 
CAT |c 20210121  |l MUB01  |h 1011 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210217  |l MUB01  |h 2156 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210525  |l MUB01  |h 1148 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210525  |l MUB01  |h 1148 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1008 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1956 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1228 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210819  |l MUB01  |h 1812 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220324  |l MUB01  |h 2121 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220811  |l MUB01  |h 2150 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220929  |l MUB01  |h 2118 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221004  |l MUB01  |h 0159 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221220  |l MUB01  |h 0136 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230228  |l MUB01  |h 0105 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230314  |l MUB01  |h 2357 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2352 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2354 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2355 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230730  |l MUB01  |h 2154 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230910  |l MUB01  |h 2311 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231013  |l MUB01  |h 0910 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231110  |l MUB01  |h 0959 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231212  |l MUB01  |h 0014 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240313  |l MUB01  |h 0025 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240415  |l MUB01  |h 0036 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240415  |l MUB01  |h 0911 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240519  |l MUB01  |h 0019 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240613  |l MUB01  |h 2039 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240701  |l MUB01  |h 2141 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240729  |l MUB01  |h 2338 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-12-14 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-12362  |5 3285007222  |8 20141111  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20141111  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-12362  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD