Určení vztahu mezi sekvencemi v blízkosti klastrovaných miRNA a jejich expresí

Cílem této diplomové práce bylo naleznout faktory, které mohou regulovat expresi miRNA, a určit jejich vliv za využití dat ze sekvenátorů příští generace. Jako nejlepší model byly vybrány klastrované miRNA, protože sdílí společnou transkripční část, a jejich finální množství je regulováno až později...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Oppelt, Jan (Autor práce)
Další autoři: Svobodová Vařeková, Radka, 1977- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2013
Témata:
fyzika klastrů
genová exprese
Illumina
miRNA (nukleová kyselina)
sekvenování DNA
cluster physics
DNA sequencing
gene expression
microRNA
MicroRNAs
diplomové práce
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/323639/prif_m/
Obálka
LEADER 07024ctm a22012617a 4500
001 MUB01000865152
003 CZ BrMU
005 20130904095922.0
008 130629s2013 xr ||||| |||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-10-05 
035 |a (ISMU-VSKP)243934 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 539.196  |2 MRF 
080 |a 575.117  |2 MRF 
080 |a 577.113.8  |2 MRF 
080 |a 577.21  |2 MRF 
080 |a 577.212.3  |2 MRF 
100 1 |a Oppelt, Jan  |% UČO 323639  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
242 1 0 |a Determination of relationship between sequences in the vicinity of clustered miRNA and their expression  |y eng 
245 1 0 |a Určení vztahu mezi sekvencemi v blízkosti klastrovaných miRNA a jejich expresí  |h [rukopis] /  |c Jan Oppelt 
260 |c 2013 
300 |a 95 l. :  |b il. +  |e 2 CD-ROM. 
500 |a Vedoucí práce: Radka Svobodová Vařeková 
502 |a Diplomová práce (Mgr.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2013 
520 2 |a Cílem této diplomové práce bylo naleznout faktory, které mohou regulovat expresi miRNA, a určit jejich vliv za využití dat ze sekvenátorů příští generace. Jako nejlepší model byly vybrány klastrované miRNA, protože sdílí společnou transkripční část, a jejich finální množství je regulováno až později. V průběhu práce jsem úspěšně vypracoval a aplikoval vhodný postup pro získání informací o genové expresi miRNA z hrubých sekvenačních dat. Použil jsem 31 vhodných veřejně dostupných osekvenovaných vzorků lidských buněčných linií a vytvořil jsem miRNA klustery. Získaná data byla použita k identifikaci vlivu stanovených parametrů v blízkosti miRNA genů na jejich expresi. Výsledkem této práce je objasnění zákonitostí exprese klastrovaných miRNA. Získaná fakta nám mohou pomoci pochopit jakým způsobem je regulována hladina miRNA v organismu  |% cze 
520 2 9 |a The aim of this diploma thesis was to find the factors, which can regulate the miRNA expression and determine their relationship using the next-generation sequencing data. I chose clustered miRNAs as the best model because they share the transcription stage and their final levels are regulated later on. During the work, I have successfully developed and applied a suitable workflow for the miRNA expression analysis from a raw sequencing data. I have used 31 suitable publicly available sequenced samples of human cell lines and created miRNA clusters. I used obtained data for the identification of relationships between defined parameters in the vicinity of miRNA genes on their expression. The result of this work is the clarification of expression regularities of the clustered miRNA. Obtained facts can help us to understand how the level of miRNA in organism is regulated.  |9 eng 
650 0 7 |a fyzika klastrů  |7 ph624219  |2 czenas 
650 0 7 |a genová exprese  |7 ph338530  |2 czenas 
650 0 7 |a Illumina  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a miRNA (nukleová kyselina)  |7 ph716203  |2 czenas 
650 0 7 |a sekvenování DNA  |7 ph187962  |2 czenas 
650 0 9 |a cluster physics  |2 eczenas 
650 0 9 |a DNA sequencing  |2 eczenas 
650 0 9 |a gene expression  |2 eczenas 
650 0 9 |a microRNA  |2 eczenas 
650 0 2 |a MicroRNAs 
655 7 |a diplomové práce  |7 fd132022  |2 czenas 
658 |a Biochemie  |b Biomolekulární chemie  |c PřF N-BCH BIOM (BIOM)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Svobodová Vařeková, Radka,  |d 1977-  |7 mub2010609307  |% UČO 4056  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Národní centrum pro výzkum biomolekul  |7 kn20100614011  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/323639/prif_m/ 
CAT |c 20130629  |l MUB01  |h 0422 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20130724  |l MUB01  |h 1139 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20130904  |l MUB01  |h 0959 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20140212  |l MUB01  |h 1326 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140417  |l MUB01  |h 1230 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140428  |l MUB01  |h 1333 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140428  |l MUB01  |h 1350 
CAT |c 20140911  |l MUB01  |h 1612 
CAT |c 20140912  |l MUB01  |h 1106 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141104  |l MUB01  |h 1320 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20150107  |l MUB01  |h 1127 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1451 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1412 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20151203  |l MUB01  |h 1045 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0410 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20180806  |l MUB01  |h 1723 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180828  |l MUB01  |h 0911 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181106  |l MUB01  |h 0732 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 1433 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190228  |l MUB01  |h 1419 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190605  |l MUB01  |h 1343 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190620  |l MUB01  |h 0746 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 0849 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1211 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1218 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200123  |l MUB01  |h 1134 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200123  |l MUB01  |h 1137 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200323  |l MUB01  |h 1958 
CAT |c 20201005  |l MUB01  |h 1143 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 1125 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 1127 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201112  |l MUB01  |h 0515 
CAT |a PTICHAX  |b 02  |c 20210131  |l MUB01  |h 1332 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210217  |l MUB01  |h 2156 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210525  |l MUB01  |h 1148 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210525  |l MUB01  |h 1148 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1005 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1953 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1222 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210819  |l MUB01  |h 1812 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220324  |l MUB01  |h 2121 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220811  |l MUB01  |h 2150 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220929  |l MUB01  |h 2118 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221004  |l MUB01  |h 0159 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221220  |l MUB01  |h 0136 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230228  |l MUB01  |h 0105 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230314  |l MUB01  |h 2021 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2352 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2354 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2355 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230730  |l MUB01  |h 2154 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230910  |l MUB01  |h 2311 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231013  |l MUB01  |h 0910 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231110  |l MUB01  |h 0959 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231212  |l MUB01  |h 0014 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240202  |l MUB01  |h 2101 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240313  |l MUB01  |h 0025 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240415  |l MUB01  |h 0036 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240519  |l MUB01  |h 0019 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240613  |l MUB01  |h 2039 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240701  |l MUB01  |h 2141 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240729  |l MUB01  |h 2338 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-10-05 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-2013-K-9126  |5 3285005827  |8 20130725  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20130725  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-2013-K-9126  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD 

Podobné jednotky