Structural and functional characterization of human IMPDH proteins

Inosine-monofosfát dehydrogenasa 1 (IMPDH1) je převážně cytoplazmatický protein zodpovědný za syntézu nukleotidu guaninu de novo. Nedávné studie ukázaly lokalizaci IMPDH1 v jádře buňky, kde je schopna vázat nukleové kyseliny a v případě kvasinek Saccharomyces cerevisiae pravděpodobně interaguje s RN...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Herudek, Jan (Autor práce)
Další autoři: Vaňáčová, Štěpánka, 1972- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2013
Témata:
CLIPS (programovací jazyk)
ChIP
IMPDH
jádro
metabolismus purinů
RNA (nukleové kyseliny)
RNA-polymerasa II
RNA-vázající protein
transkripce
CLIPS
purine metabolism
ribonucleic acids
RNA-binding protein
transcription
RNA Polymerase II
diplomové práce
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/324384/prif_m/
Obálka
LEADER 05423ctm a22008417a 4500
001 MUB01000865086
003 CZ BrMU
005 20130723114431.0
008 130629s2013 xr ||||| |||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-10-05 
035 |a (ISMU-VSKP)229575 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 003.035  |2 MRF 
080 |a 004.438CLIPS  |2 MRF 
080 |a 577.113.8  |2 MRF 
080 |a 577.21  |2 MRF 
100 1 |a Herudek, Jan  |% UČO 324384  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
242 1 0 |a Strukturní a funkční charakterizace RNA vazebné domény lidských proteinů IMPDH  |y cze 
245 1 0 |a Structural and functional characterization of human IMPDH proteins  |h [rukopis] /  |c Jan Herudek 
260 |c 2013 
300 |a 91 l. :  |b il. 
500 |a Vedoucí práce: Štěpánka Vaňáčová 
502 |a Diplomová práce (Mgr.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2013 
520 2 |a Inosine-monofosfát dehydrogenasa 1 (IMPDH1) je převážně cytoplazmatický protein zodpovědný za syntézu nukleotidu guaninu de novo. Nedávné studie ukázaly lokalizaci IMPDH1 v jádře buňky, kde je schopna vázat nukleové kyseliny a v případě kvasinek Saccharomyces cerevisiae pravděpodobně interaguje s RNA polymerasou II. Tyto poznatky indikují novou roli tohoto proteinu v buněčném jádře. IMPDH1 vytváří stabilní homotetramer s katalytickým místem pro cytoplazmatickou syntézu GTP a navíc obsahuje cystathionine-β-synthasovou subdoménu (CBS), která je umístěna vně tetrameru. Subdoména CBS navíc obsahuje několik polymorfismů, které korelují s výskytem očního onemocnění Retinitis pigmentosa. Cílem této práce je s využitím strukturních a funkčních nástrojů studovat roli proteinu IMPDH1 v jádře lidských buněk a charakterizovat afinitu subdomény CBS k RNA a DNA. Základními metodami studia jsou Chromatinová Imunoprecipitace (ChIP) spojená s kvantitativní PCR analýzou specifických genomových oblastí,  |% cze 
520 2 9 |a Inosine monophosphate dehydrogenase 1 (IMPDH1) is a predominantly cytoplasmic protein which catalyzes the rate limiting step of the de novo synthesis of guanine nucleotides. However, recent studies showed that IMPDH1 also localizes to the nucleus where it binds nucleic acids and potentially interacts with RNA polymerase II in yeast cells. This suggested an additional role for this protein in the nucleus. IMPDH1 assembles into a homotetramer to form a catalytically active site important for its cytoplasmic function in GTP synthesis. In addition to that it contains the nucleic acids-binding cystathionine β-synthase subdomain (CBS) that protrudes outside the tetramer. Interestingly, mutations in CBS strongly correlate with the occurrence of Retinitis pigmentosa, the inherited eye disease. In vitro, these CBS mutations lower the affinity of IMPDH1 to nucleic acids. By combination of structural and functional approaches, we aim to investigate the nuclear role of IMPDH and the DNA and RNA bi  |9 eng 
650 0 7 |a CLIPS (programovací jazyk)  |7 ph117433  |2 czenas 
650 0 7 |a ChIP  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a IMPDH  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a jádro  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a metabolismus purinů  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a RNA (nukleové kyseliny)  |7 ph125167  |2 czenas 
650 0 7 |a RNA-polymerasa II  |2 czmesh 
650 0 7 |a RNA-vázající protein  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a transkripce  |7 ph120106  |2 czenas 
650 0 9 |a CLIPS  |2 eczenas 
650 0 9 |a purine metabolism  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a ribonucleic acids  |2 eczenas 
650 0 9 |a RNA-binding protein  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a transcription  |2 eczenas 
650 0 2 |a RNA Polymerase II 
655 7 |a diplomové práce  |7 fd132022  |2 czenas 
658 |a Biochemie  |b Biomolekulární chemie  |c PřF N-BCH BIOM (BIOM)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Vaňáčová, Štěpánka,  |d 1972-  |7 mub2010613414  |% UČO 105562  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Přírodovědecká fakulta  |7 kn20010709281  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/324384/prif_m/ 
CAT |c 20130629  |l MUB01  |h 0422 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20130723  |l MUB01  |h 1144 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20130724  |l MUB01  |h 1630 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20140401  |l MUB01  |h 1457 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20140829  |l MUB01  |h 1425 
CAT |c 20140911  |l MUB01  |h 1612 
CAT |c 20140912  |l MUB01  |h 1106 
CAT |c 20150703  |l MUB01  |h 1224 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1450 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1412 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0409 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20161212  |l MUB01  |h 1547 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170829  |l MUB01  |h 0007 
CAT |a BATCH-UPD  |b 02  |c 20180818  |l MUB01  |h 0028 
CAT |c 20200306  |l MUB01  |h 1847 
CAT |a FUKSOVAX  |b 02  |c 20200924  |l MUB01  |h 1319 
CAT |c 20201005  |l MUB01  |h 1143 
CAT |c 20210121  |l MUB01  |h 1011 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1005 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1953 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1222 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230314  |l MUB01  |h 2357 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240415  |l MUB01  |h 0911 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-10-05 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-2013-K-9117  |5 3285005818  |8 20130725  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20130725  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-2013-K-9117  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD 

Podobné jednotky