Příprava multiproteinových komplexů mezi CTD a CID pro měření pomocí SAXS
Největší podjednotka eukaryotické RNA polymerasy II (RNAPII) obsahuje neobvyklou C-terminální doménu (CTD) tvořenou tandemovými repeticemi heptapeptidu Tyr1-Ser2-Pro3-Thr4-Ser5-Pro6-Ser7. CTD podléhá v průběhu transkripce dynamické fosforylaci. Takto modifikovaná CTD je in vivo rozpoznávaná proteino...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Angličtina |
| Vydáno: |
2013
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/376272/prif_b/ |
| Shrnutí: | Největší podjednotka eukaryotické RNA polymerasy II (RNAPII) obsahuje neobvyklou C-terminální doménu (CTD) tvořenou tandemovými repeticemi heptapeptidu Tyr1-Ser2-Pro3-Thr4-Ser5-Pro6-Ser7. CTD podléhá v průběhu transkripce dynamické fosforylaci. Takto modifikovaná CTD je in vivo rozpoznávaná proteinovými faktory zapojenými ve zpracování RNA či regulaci transkripce. Prostřednictvím těchto interakcí dochází k funkčnímu propojení zpracování RNA a regulace transkripce s transkripcí samotnou. Několik faktorů, které se podílejí na zpracování 5' a 3' konce či terminaci transkripce, rozpoznává CTD fosforylované na určitém serinu prostřednictví CTD-interakční domény (CID). Interakce CID s CTD o dvou repeticích jsou strukturně dobře popsány, nicméně informace o efektech těchto interakcí na strukturu CTD v plné délce chybí. Pro účely strukturního studia homogenně fosforylované CTD byl v naší laboratoři vyvinut systém mimikující fosforylaci pomocí substituce serinu kyselinou glutamovou. Zde proka The largest subunit of eukaryotic RNA polymerase II (RNAPII) possesses unusual C- terminal domain (CTD), which consists of multiple tandem repeats of consensus sequence Tyr1-Ser2-Pro3-Thr4-Ser5-Pro6-Ser7. During the transcription cycle CTD is dynamically phosphorylated. The CTD phosphorylation is specifically recognized in vivo by protein factors involved in RNA processing and transcription regulation. These protein-protein interactions functionally link RNA processing and transcription regulation with transcription. Several of the RNA processing factors that facilitate both 5’ and 3’ processing and transcription termination specifically recognize CTD phosphorylated at certain serine by their CTD-interacting domains (CIDs). Interactions of CIDs with two repeats of CTD are structurally well described, but the effects of the interactions on the full length CTD structure is not understood. To prepare large amounts of homogeneously modified CTD for structural studies a system using serin |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Richard Štefl |
| Fyzický popis: | 50 s. : il. |