Identifikace promotorů Treponema pallidum rozpoznávaných různými sigma faktory

Sigma faktor je disociabilní podjednotkou bakteriální RNA polymerázy a je stěžejní pro iniciaci transkripce. V bakteriích je přítomno několik sigma faktorů a každý má svou cílovou skupinu genů, u kterých řídí transkripci. Treponema pallidum subsp. pallidum, původce syfilis, má pět sigma faktorů, cíl...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Cavallin, Ivana (Autor práce)
Další autoři: Šmajs, David, 1969- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Čeština
Vydáno: 2013
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/269841/prif_m/
Obálka
LEADER 05132ctm a22007937a 4500
001 MUB01000864456
003 CZ BrMU
005 20231030122544.0
008 130626s2013 xr ||||| |||||||||||cze d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-10-05 
035 |a (ISMU-VSKP)207547 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD004 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 579.834.1  |2 MRF 
080 |a 575.117  |2 MRF 
100 1 |a Cavallin, Ivana  |7 mub20231205766  |% UČO 269841  |4 dis 
242 1 0 |a Identification of Treponema pallidum sigma factor-dependent promoters  |y eng 
245 1 0 |a Identifikace promotorů Treponema pallidum rozpoznávaných různými sigma faktory  |h [rukopis] /  |c Ivana Poštulková 
260 |c 2013 
300 |a 56 l. 
500 |a Vedoucí práce: David Šmajs 
502 |a Diplomová práce (Mgr.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2013 
520 2 |a Sigma faktor je disociabilní podjednotkou bakteriální RNA polymerázy a je stěžejní pro iniciaci transkripce. V bakteriích je přítomno několik sigma faktorů a každý má svou cílovou skupinu genů, u kterých řídí transkripci. Treponema pallidum subsp. pallidum, původce syfilis, má pět sigma faktorů, cílové geny však nejsou známy. Jelikož nelze kultivovat T. pallidum in vitro, pro studium treponemálních genů byla využita Escherichia coli, která nese čtyři sigma faktory homologické k treponemálním. Práce sledovala expresi genů obsažených v genomové knihovně T. pallidum a expresi z promotorů získaných klonováním treponemální DNA. Studium exprese probíhalo v kmenech E. coli deficientních pro sigma faktory a při nadprodukci treponemálních sigma faktorů za využití qRT-PCR a luminiscence. Byla potvrzena transkripce genu polA sigma faktorem RpoE, která byla již dříve nalezena u T. pallidum.  |% cze 
520 2 9 |a Sigma factor is a dissociable subunit of bacterial RNA polymerase and is vital for transcription iniciation. There are several sigma factors present in bacteria and each one has its own set of target genes where it controls transcription. Treponema pallidum subsp. pallidum, the causative agent of syphilis, possesses five sigma factors. However, target genes remain unknown. As T. pallidum is nonculturable in vitro, Escherichia coli was exploited to study T. pallidum genes. E. coli bears four sigma factors which are homologous to the sigma factors of T. pallidum. The thesis examined gene expression of T. pallidum genes from a genomic library and expression from promoters gained by cleavage of treponemal DNA. Expression studies were conducted in E. coli sigma factor-deficient strains and during sigma factor overexpression using qRT-PCR and luminescence measurements. Transcription of the polA gene by RpoE was confirmed as stated formely for T. pallidum.  |9 eng 
650 0 7 |a DNA řízené RNA-polymerasy  |2 czmesh 
650 0 7 |a genová exprese  |7 ph338530  |2 czenas 
650 0 7 |a genetická transkripce  |2 czmesh 
650 0 7 |a Treponema pallidum  |2 czmesh 
650 0 9 |a gene expression  |2 eczenas 
650 0 2 |a DNA-Directed RNA Polymerases 
650 0 2 |a Transcription, Genetic 
650 0 2 |a Treponema pallidum 
655 7 |a diplomové práce  |7 fd132022  |2 czenas 
655 9 |a master's theses  |2 eczenas 
658 |a Experimentální biologie  |b Molekulární biologie a genetika  |c PřF N-EXB BIMG (BIMG)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Šmajs, David,  |d 1969-  |7 xx0061318  |% UČO 1116  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav experimentální biologie  |7 mzk2008412438  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/269841/prif_m/ 
CAT |c 20130626  |l MUB01  |h 0421 
CAT |a RACLAVSKA  |b 02  |c 20131011  |l MUB01  |h 1602 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140115  |l MUB01  |h 0857 
CAT |a RACLAVSKA  |b 02  |c 20140124  |l MUB01  |h 1038 
CAT |a NEDOMOVAX  |b 02  |c 20140708  |l MUB01  |h 2231 
CAT |c 20140911  |l MUB01  |h 1612 
CAT |c 20140912  |l MUB01  |h 1106 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20150804  |l MUB01  |h 1804 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1450 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1411 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0409 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20160510  |l MUB01  |h 1235 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20160731  |l MUB01  |h 2236 
CAT |c 20170119  |l MUB01  |h 1537 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170829  |l MUB01  |h 0007 
CAT |c 20180202  |l MUB01  |h 1041 
CAT |c 20200306  |l MUB01  |h 1846 
CAT |a FUKSOVAX  |b 02  |c 20200913  |l MUB01  |h 1821 
CAT |c 20201005  |l MUB01  |h 1143 
CAT |c 20210121  |l MUB01  |h 1011 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1005 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1953 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1222 
CAT |c 20220201  |l MUB01  |h 1210 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231012  |l MUB01  |h 2055 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231030  |l MUB01  |h 1225 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231204  |l MUB01  |h 1957 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-10-05 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-11435  |5 3145359228  |8 20131011  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20130708  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-11435  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD