Studium interakcí biomolekul za pomocí molekulového modelování
V první části této bakalářské se věnuji zejména amyloidu β, který hraje patologickou roli při vzniku Alzheimerovy choroby a metabolismu lipidů. Amyloid β je hlavní složkou senilních plaků nalezených v mozku pacientů s Alzheimerovou chorobou a jeho tvorba může být stimulována cholesterolem. Zejména t...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2013
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/377324/prif_b/ |
| LEADER | 07350ctm a22012857a 4500 | ||
|---|---|---|---|
| 001 | MUB01000864036 | ||
| 003 | CZ BrMU | ||
| 005 | 20190225161659.0 | ||
| 008 | 130622s2013 xr ||||| |||||||||||cze d | ||
| STA | |a POSLANO DO SKCR |b 2020-10-05 | ||
| 035 | |a (ISMU-VSKP)242295 | ||
| 040 | |a BOD114 |b cze |d BOD035 | ||
| 072 | 7 | |a 577 |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika |2 Konspekt |9 2 | |
| 080 | |a 547.922 |2 MRF | ||
| 080 | |a 577.112:616-002 |2 MRF | ||
| 080 | |a 577.115 |2 MRF | ||
| 080 | |a 616.831-003.8+616.892/.894 |2 MRF | ||
| 100 | 1 | |a Machová, Daniela |7 xx0232787 |% UČO 377324 |4 dis | |
| 245 | 1 | 0 | |a Studium interakcí biomolekul za pomocí molekulového modelování |h [rukopis] / |c Daniela Machová |
| 246 | 1 | 1 | |a Biomolecular interaction study using molecular modeling methods |
| 246 | 1 | 0 | |a Studium interakcí biomolekul metodami molekulového modelování |
| 260 | |c 2013 | ||
| 300 | |a 66 l. : |b il. | ||
| 500 | |a Vedoucí práce: Zdeněk Kříž | ||
| 502 | |a Bakalářská práce (Bc.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2013 | ||
| 520 | 2 | |a V první části této bakalářské se věnuji zejména amyloidu β, který hraje patologickou roli při vzniku Alzheimerovy choroby a metabolismu lipidů. Amyloid β je hlavní složkou senilních plaků nalezených v mozku pacientů s Alzheimerovou chorobou a jeho tvorba může být stimulována cholesterolem. Zejména tedy 24(S)hydroxycholesterolem, jež je jeden z mála oxysterolů, které mohou procházet přes hematoencefalitickou bariéru a stimulovat β-sekretasu, jejímž působením na amyloidní prekursorový protein, vzniká právě amyloid β. Také se věnuji souvislosti Alzheimerovy choroby s apolipoproteinemE. V druhé části je věnována pozornost studiu interakcí amyloidu β s 24(S)hydroxycholesterolem pomocí molekulového modelování. Na souboru 5 modelů byla zkoumána různá vazebná místa na amyloidu β, díky kterým může docházet k vazbě 24(S)hydroxycholesterolu. Byly provedeny 50 ns dlouhé simulace, pomocí nástrojů softwarového balíčku AMBER, na základě kterých byla provedena následná analýza. |% cze | |
| 520 | 2 | 9 | |a In the first part of this bachelor thesis, I focus mainly on amyloid β which have a pathological role in the development of Alzheimer's disease and lipid metabolism. Amyloid β is the main component of senile plaques found in the brains of patients with Alzheimer's disease and its creation can be stimulated by cholesterol. Particularly by 24(S)hydroxycholesterol which is one of the few oxysterols that may pass through the blood-brain barrier and stimulate the β-secretase, by which effects on amyloid precursor protein lead to formation of amyloid β. I also pay attention to context of Alzheimer's disease with apolipoproteinE. The second part is devoted to the study of the interaction of amyloid β with 24(S)hydroxycholesterol using the molecular modeling. On the set of 5 models were researched different binding sites on amyloid-β by which may happen the linking of 24(S)hydroxycholesterol. 50 ns long simulations were performed by using software package AMBER, and on these basis were the sub |9 eng |
| 650 | 0 | 7 | |a Alzheimerova nemoc |2 czmesh |
| 650 | 0 | 7 | |a amyloidový prekurzorový protein beta |2 czmesh |
| 650 | 0 | 7 | |a cholesterol |7 ph119190 |2 czenas |
| 650 | 0 | 7 | |a molekulové modelování |2 CZ-BrMU |
| 650 | 0 | 7 | |a proteiny akutní fáze |7 ph264924 |2 czenas |
| 650 | 0 | 9 | |a acute phase proteins |2 eczenas |
| 650 | 0 | 9 | |a Alzheimer's disease |2 eczenas |
| 650 | 0 | 9 | |a cholesterol |2 eczenas |
| 650 | 0 | 2 | |a Alzheimer Disease |
| 650 | 0 | 2 | |a Amyloid beta-Protein Precursor |
| 655 | 7 | |a bakalářské práce |7 fd132403 |2 czenas | |
| 658 | |a Biochemie |b Chemoinformatika a bioinformatika |c PřF B-BCH CHI (CHI) |2 CZ-BrMU | ||
| 700 | 1 | |a Kříž, Zdeněk, |d 1972- |7 jn20000620187 |% UČO 37415 |4 ths | |
| 710 | 2 | |a Masarykova univerzita. |b Národní centrum pro výzkum biomolekul |7 kn20100614011 |4 dgg | |
| 856 | 4 | 1 | |u http://is.muni.cz/th/377324/prif_b/ |
| CAT | |c 20130622 |l MUB01 |h 0422 | ||
| CAT | |a FOLTYNOVA |b 02 |c 20131025 |l MUB01 |h 0833 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20131218 |l MUB01 |h 1537 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20140417 |l MUB01 |h 1230 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20140428 |l MUB01 |h 1333 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20140428 |l MUB01 |h 1350 | ||
| CAT | |c 20140911 |l MUB01 |h 1612 | ||
| CAT | |c 20140912 |l MUB01 |h 1106 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20141104 |l MUB01 |h 1320 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20150107 |l MUB01 |h 1127 | ||
| CAT | |c 20150703 |l MUB01 |h 1223 | ||
| CAT | |c 20150901 |l MUB01 |h 1450 | ||
| CAT | |c 20150921 |l MUB01 |h 1411 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20151203 |l MUB01 |h 1045 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20151226 |l MUB01 |h 0408 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20160202 |l MUB01 |h 1213 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20170313 |l MUB01 |h 1329 | ||
| CAT | |c 20180202 |l MUB01 |h 1041 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20180828 |l MUB01 |h 0911 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20181106 |l MUB01 |h 0732 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190105 |l MUB01 |h 1433 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20190225 |l MUB01 |h 1616 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190228 |l MUB01 |h 1419 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190605 |l MUB01 |h 1343 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190620 |l MUB01 |h 0746 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20191210 |l MUB01 |h 0849 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20191210 |l MUB01 |h 1210 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20191210 |l MUB01 |h 1218 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20200123 |l MUB01 |h 1134 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20200123 |l MUB01 |h 1137 | ||
| CAT | |c 20200306 |l MUB01 |h 1846 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20200323 |l MUB01 |h 1958 | ||
| CAT | |c 20201005 |l MUB01 |h 1143 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20201030 |l MUB01 |h 1125 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20201030 |l MUB01 |h 1126 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20201112 |l MUB01 |h 0514 | ||
| CAT | |c 20210121 |l MUB01 |h 1011 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20210217 |l MUB01 |h 2156 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20210525 |l MUB01 |h 1148 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20210525 |l MUB01 |h 1148 | ||
| CAT | |c 20210614 |l MUB01 |h 1004 | ||
| CAT | |c 20210614 |l MUB01 |h 1953 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20210724 |l MUB01 |h 1222 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20210819 |l MUB01 |h 1812 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20220324 |l MUB01 |h 2121 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20220811 |l MUB01 |h 2150 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20220929 |l MUB01 |h 2118 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20221004 |l MUB01 |h 0159 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20221220 |l MUB01 |h 0136 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20230228 |l MUB01 |h 0105 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20230331 |l MUB01 |h 2352 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20230331 |l MUB01 |h 2354 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20230331 |l MUB01 |h 2355 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20230730 |l MUB01 |h 2154 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20230910 |l MUB01 |h 2311 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20231013 |l MUB01 |h 0910 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20231110 |l MUB01 |h 0959 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20231212 |l MUB01 |h 0014 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20240313 |l MUB01 |h 0025 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20240415 |l MUB01 |h 0036 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20240519 |l MUB01 |h 0019 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20240613 |l MUB01 |h 2039 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20240701 |l MUB01 |h 2141 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20240729 |l MUB01 |h 2338 | ||
| LOW | |a POSLANO DO SKCR |b 2020-10-05 | ||
| 994 | - | 1 | |l MUB01 |l MUB01 |m VYSPR |1 KUK |a Knihovna univ. kampusu |2 SKLAD |b KUK - sklad |3 PřF-K-9266 |5 3285005941 |8 20131025 |f 71 |f Prezenční SKLAD |r 20131025 |s převod |
| AVA | |a MED50 |b KUK |c KUK - sklad |d PřF-K-9266 |e available |t K dispozici |f 1 |g 0 |h N |i 0 |j SKLAD | ||