Studium nestrukturovaných proteinů metodami molekulového modelování

V této bakalářské práci jsem se zaměřila na porovnání fosforylované a nefosforylované molekuly enzymu kasein kinasa1, a to její isoformy ε. Kasein kinasa patří do skupiny transferáz, které přenášejí funkční skupiny. V případě kasein kinasy1 dochází k přenosu fosfátů. Tento enzym v C-koncích vykazuje...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Dvořáková, Libuše (Autor práce)
Další autoři: Kříž, Zdeněk, 1972- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Čeština
Vydáno: 2013
Témata:
bílkoviny
enzymy
kaseinkinasy
molekulární dynamika
molekulární mechanika
molekulové modelování
nestrukturované proteiny
enzymes
molecular dynamics
molecular mechanics
proteins
Casein Kinases
bakalářské práce
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/377326/prif_b/
Obálka
LEADER 06888ctm a22012617a 4500
001 MUB01000864034
003 CZ BrMU
005 20131018113126.0
008 130622s2013 xr ||||| |||||||||||cze d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-10-05 
035 |a (ISMU-VSKP)242293 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 544.112  |2 MRF 
080 |a 544.112:531.3  |2 MRF 
080 |a 577.112  |2 MRF 
080 |a 577.15  |2 MRF 
100 1 |a Dvořáková, Libuše  |% UČO 377326  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
245 1 0 |a Studium nestrukturovaných proteinů metodami molekulového modelování  |h [rukopis] /  |c Libuše Dvořáková 
246 1 1 |a Unstructured proteins study using molecular modeling methods 
260 |c 2013 
300 |a 40 l. :  |b il. 
500 |a Vedoucí práce: Zdeněk Kříž 
502 |a Bakalářská práce (Bc.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2013 
520 2 |a V této bakalářské práci jsem se zaměřila na porovnání fosforylované a nefosforylované molekuly enzymu kasein kinasa1, a to její isoformy ε. Kasein kinasa patří do skupiny transferáz, které přenášejí funkční skupiny. V případě kasein kinasy1 dochází k přenosu fosfátů. Tento enzym v C-koncích vykazuje nepřítomnost sekundárních struktur, a tudíž jej můžeme zařadit mezi nestrukturované proteiny. Působení CK1 v organismu je rozsáhlé, účastní se řady biologicky důležitých drah. Pomocí metod molekulového modelování, za použití programového balíku AMBER, byla provedena analýza MD trajektorií těchto dvou molekul, za účelem zjistit, jaký vliv má vazba fosforu na molekulu CK1. Pomocí výpočetních metod byla analyzována stabilita molekul, výskyt sekundárních struktur, případná změna torzních úhlů, fluktulace molekul.  |% cze 
520 2 9 |a In this thesis I focused on the comparison of phosphorylated and unphosphorylated molecules of enzyme casein kinase1, isoforms ε. Casein kinase belonging to the group transferases which carry functional groups. In the case of casein kinase1 is transferred phosphates. This enzyme in the C-ends exhibits absence of secondary structures, and therefore it can be defined as unstructured proteins. Effect of CK1 in the body is extensive, involved in a number of biologically important pathways. Using molecular modeling methods, by use software package AMBER were analysed MD trajectories of these two molecules, in order to determine the effect of the binding of phosphorus per molecule CK1. Using computational methods were analyzed stability of the molecules, the occurrence of secondary structures, or changing the torsion angles fluktulace molecules.  |9 eng 
650 0 7 |a bílkoviny  |7 ph119082  |2 czenas 
650 0 7 |a enzymy  |7 ph119969  |2 czenas 
650 0 7 |a kaseinkinasy  |2 czmesh 
650 0 7 |a molekulární dynamika  |7 ph202577  |2 czenas 
650 0 7 |a molekulární mechanika  |7 ph579351  |2 czenas 
650 0 7 |a molekulové modelování  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a nestrukturované proteiny  |2 CZ-BrMU 
650 0 9 |a enzymes  |2 eczenas 
650 0 9 |a molecular dynamics  |2 eczenas 
650 0 9 |a molecular mechanics  |2 eczenas 
650 0 9 |a proteins  |2 eczenas 
650 0 2 |a Casein Kinases 
655 7 |a bakalářské práce  |7 fd132403  |2 czenas 
658 |a Biochemie  |b Chemoinformatika a bioinformatika  |c PřF B-BCH CHI (CHI)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Kříž, Zdeněk,  |d 1972-  |7 jn20000620187  |% UČO 37415  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Národní centrum pro výzkum biomolekul  |7 kn20100614011  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/377326/prif_b/ 
CAT |c 20130622  |l MUB01  |h 0422 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20131018  |l MUB01  |h 1131 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20131218  |l MUB01  |h 1537 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140417  |l MUB01  |h 1230 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140428  |l MUB01  |h 1333 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140428  |l MUB01  |h 1350 
CAT |c 20140911  |l MUB01  |h 1612 
CAT |c 20140912  |l MUB01  |h 1106 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141104  |l MUB01  |h 1320 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20150107  |l MUB01  |h 1127 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1450 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1411 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20151203  |l MUB01  |h 1045 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0408 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20160202  |l MUB01  |h 1213 
CAT |c 20170119  |l MUB01  |h 1537 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170313  |l MUB01  |h 1329 
CAT |c 20180202  |l MUB01  |h 1041 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180828  |l MUB01  |h 0911 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181106  |l MUB01  |h 0732 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 1433 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190228  |l MUB01  |h 1419 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190605  |l MUB01  |h 1343 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190620  |l MUB01  |h 0746 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 0849 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1210 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1218 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200123  |l MUB01  |h 1134 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200123  |l MUB01  |h 1137 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200323  |l MUB01  |h 1958 
CAT |c 20201005  |l MUB01  |h 1143 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 1125 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 1126 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201112  |l MUB01  |h 0514 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210217  |l MUB01  |h 2156 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210525  |l MUB01  |h 1148 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210525  |l MUB01  |h 1148 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1004 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1953 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1222 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210819  |l MUB01  |h 1812 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220324  |l MUB01  |h 2121 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220811  |l MUB01  |h 2150 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220929  |l MUB01  |h 2118 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221004  |l MUB01  |h 0159 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221220  |l MUB01  |h 0136 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230228  |l MUB01  |h 0105 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2352 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2354 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2355 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230730  |l MUB01  |h 2154 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230910  |l MUB01  |h 2311 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231013  |l MUB01  |h 0910 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231110  |l MUB01  |h 0959 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231212  |l MUB01  |h 0014 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240313  |l MUB01  |h 0025 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240415  |l MUB01  |h 0036 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240519  |l MUB01  |h 0019 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240613  |l MUB01  |h 2039 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240701  |l MUB01  |h 2141 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240729  |l MUB01  |h 2337 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-10-05 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-9250  |5 3285005924  |8 20131023  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20131023  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-9250  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD 

Podobné jednotky