Analysis of SMC5-6 complex subunits and their functional homologs
U většiny organizmů, SMC proteiny (structural maintenance of chromosomes) regulují replikaci chromosomů, jejich kondenzaci, kohezi, segregaci a opravy DNA. V eukaryontních buňkách zajišťují kohesin a kondensin, dva z SMC komplexů, kohezi a kondenzaci chromozomů během mitózy. Třetí komplex - SMC5-6 k...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Angličtina |
| Vydáno: |
2013
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/250452/prif_d/ |
| Shrnutí: | U většiny organizmů, SMC proteiny (structural maintenance of chromosomes) regulují replikaci chromosomů, jejich kondenzaci, kohezi, segregaci a opravy DNA. V eukaryontních buňkách zajišťují kohesin a kondensin, dva z SMC komplexů, kohezi a kondenzaci chromozomů během mitózy. Třetí komplex - SMC5-6 komplex - se podílí na segregaci a procesech oprav DNA. Obsahuje subkomplex složený ze tří ne-SMC elementů, Nse1-Nse3-Nse4. Nse3 je kvasinkový ortolog lidského hNSE3-MAGEG1, prvního z objevených proteinů MAGE, který dal název celé skupině savčích MAGE proteinů. Nse4 je příbuzný s rodinou savčích EID (E1A-like Inhibitor of Differentiation) proteinů. Předchozí studie ukázaly, že interakce mezi Nse3 a Nse4 odpovídá evolučně zakonzervovaným interakcím mezi skupinou proteinů MAGE a EID. Za použití protein-proteinových interakčních technik jako in vitro pull-down nebo kvasinkový dvojhybridní systém je v této práci identifikován region zodpovědný za vazbu Nse4 k Nse3 a Nse1. Podle svého působení byl In most organisms, the structural maintenance of chromosomes (SMC) proteins regulate the chromosome replication, condensation, cohesion, segregation and DNA repair. In eukaryotes, cohesin and condensin, two SMC complexes, ensure chromosome cohesion and condensation during mitosis. The third SMC complex, the intriguing SMC5-6 complex, is involved in segregation and DNA repair processes. It contains a subcomplex formed by three non-smc-elements, Nse1-Nse3-Nse4. Nse3 is the yeast ortholog of the human hNSE3/MAGEG1, founding member of the mammalian MAGE protein superfamily. Nse4 is related to the mammalian EID (E1A-like Inhibitor of Differentiation) protein family. A previous study has shown that the Nse3-Nse4 interaction is evolutionary conserved between mammalian MAGE and EID proteins. In this thesis, using protein-protein interaction techniques (like in vitro pull-down or yeast-two-hybrid) and molecular modelling, the amino acid regions of Nse4 responsible for the binding to Nse3 and Ns |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Jan Paleček |
| Fyzický popis: | 101 s. : il. + 2 příl. |