Functional and structural characterization of key players in RNA quality control: the exosome, TRAMP and NRD1 complexes

Kontrolou kvality RNA nazýváme soubor procesů odpovědných za udržování homeostáze různých druhů RNA molekul v buňce. V nedávné době byly tyto procesy popsány u organizmů počínaje jednobuňečnými kvasinkami a konče člověkem. V práci nabizím úvod do problematiky kontroly kvality RNA a shrnuji data získ...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Holub, Peter (Autor práce)
Další autoři: Vaňáčová, Štěpánka, 1972- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2013
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/229688/prif_d/
Obálka
LEADER 07301ctm a22013457a 4500
001 MUB01000852700
003 CZ BrMU
005 20130722135120.0
008 130228s2013 xr ||||| |||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-08-05 
035 |a (ISMU-VSKP)159605 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 577.113.8  |2 MRF 
080 |a 577.122  |2 MRF 
080 |a 577.21  |2 MRF 
080 |a 582.282.23  |2 MRF 
100 1 |a Holub, Peter  |% UČO 229688  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
242 1 0 |a Funkční a strukturní charakterizace klíčových hráčů kontroly kvality RNA: komplexů exosomu, TRAMP a NRD1  |y cze 
245 1 0 |a Functional and structural characterization of key players in RNA quality control: the exosome, TRAMP and NRD1 complexes  |h [rukopis] /  |c Peter Holub 
260 |c 2013 
300 |a 130 s. :  |b il. 
500 |a Vedoucí práce: Štěpánka Vaňáčová 
502 |a Dizertace (Ph.D.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2013 
520 2 |a Kontrolou kvality RNA nazýváme soubor procesů odpovědných za udržování homeostáze různých druhů RNA molekul v buňce. V nedávné době byly tyto procesy popsány u organizmů počínaje jednobuňečnými kvasinkami a konče člověkem. V práci nabizím úvod do problematiky kontroly kvality RNA a shrnuji data získané o klíčových hráčích této dráhy v Saccharomyces cerevisiae: exosomu a komplexech TRAMP a NRD1. Představuji strukturní studie domény zodpovědné za endonukleázovou aktivitu exosomu, RNA vazebné domény TRAMP komplexu a domény zabezpečující interakci terminačního komplexu NRD1 s RNA polymerasou II. Dále popisuji biochemické vlastnosti jednotlivých podjednotek komplexu TRAMP a představuji předbežnou studii jejich regulace posttranslačními modifikacemi.  |% cze 
520 2 9 |a The RNA quality control is a set of processes responsible for maintaining the homeostasis of different RNA species in cell. It was recently described in organisms ranging from unicellular yeast to humans. Here I provide an introduction to this topic and sum up the data I have obtained on the key players of RNA quality control in Saccharomyces cerevisiae in the course of my PhD work: the exosome, TRAMP and NRD1 complexes. I present the structural study of an exosome domain responsible for endonuclease activity, RNA binding domain of TRAMP complex and domain required for protein-protein interaction between NRD1 complex and the RNA polymerase II. Furthermore, I describe the biochemical properties of individual subunits of the TRAMP complex and present the preliminary study of the posttranslational modifications that might be involved in its regulation.  |9 eng 
650 0 7 |a exozómy  |2 czmesh 
650 0 7 |a interakce protein-protein  |7 ph602153  |2 czenas 
650 0 7 |a kontrola kvality RNA  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a Nrd1  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a RNA (nukleové kyseliny)  |7 ph125167  |2 czenas 
650 0 7 |a Saccharomyces cerevisiae  |7 ph280228  |2 czenas 
650 0 7 |a TRAMP  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a vztah mezi strukturou a funkcí  |2 CZ-BrMU 
650 0 9 |a protein-protein interaction  |2 eczenas 
650 0 9 |a ribonucleic acids  |2 eczenas 
650 0 9 |a RNA quality control  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a Saccharomyces cerevisiae  |2 eczenas 
650 0 9 |a structure-function relationship  |2 eczenas 
650 0 2 |a Exosomes 
655 7 |a disertace  |7 fd132024  |2 czenas 
658 |a Biochemie (čtyřleté)  |b Biomolekulární chemie  |c PřF D-BCH4 BIOM (BIOM)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Vaňáčová, Štěpánka,  |d 1972-  |7 mub2010613414  |% UČO 105562  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Národní centrum pro výzkum biomolekul  |7 kn20100614011  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/229688/prif_d/ 
CAT |c 20130228  |l MUB01  |h 0420 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20130304  |l MUB01  |h 1303 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20130304  |l MUB01  |h 1539 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20130722  |l MUB01  |h 1351 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20140401  |l MUB01  |h 1457 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140417  |l MUB01  |h 1230 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140428  |l MUB01  |h 1333 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140428  |l MUB01  |h 1349 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20140829  |l MUB01  |h 1425 
CAT |c 20140911  |l MUB01  |h 1611 
CAT |c 20140912  |l MUB01  |h 1105 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141104  |l MUB01  |h 1319 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20150107  |l MUB01  |h 1127 
CAT |c 20150703  |l MUB01  |h 1218 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1450 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1411 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20151203  |l MUB01  |h 1045 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0353 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20161212  |l MUB01  |h 1547 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170829  |l MUB01  |h 0007 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180828  |l MUB01  |h 0911 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181106  |l MUB01  |h 0731 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 1433 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190228  |l MUB01  |h 1419 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190605  |l MUB01  |h 1343 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190620  |l MUB01  |h 0746 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 0849 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1210 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1218 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200123  |l MUB01  |h 1134 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200123  |l MUB01  |h 1137 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200323  |l MUB01  |h 1958 
CAT |c 20200805  |l MUB01  |h 1103 
CAT |a FUKSOVAX  |b 02  |c 20200924  |l MUB01  |h 1319 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 1125 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 1126 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201112  |l MUB01  |h 0514 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210217  |l MUB01  |h 2156 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210525  |l MUB01  |h 1147 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210525  |l MUB01  |h 1148 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1003 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1951 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1219 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210819  |l MUB01  |h 1812 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220324  |l MUB01  |h 2121 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220811  |l MUB01  |h 2150 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220929  |l MUB01  |h 2118 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221004  |l MUB01  |h 0159 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221220  |l MUB01  |h 0136 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230228  |l MUB01  |h 0105 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230314  |l MUB01  |h 2357 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2352 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2354 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2355 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230730  |l MUB01  |h 2154 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230910  |l MUB01  |h 2311 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231013  |l MUB01  |h 0910 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231110  |l MUB01  |h 0959 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231212  |l MUB01  |h 0014 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240313  |l MUB01  |h 0025 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240415  |l MUB01  |h 0036 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240415  |l MUB01  |h 0911 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240519  |l MUB01  |h 0019 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240613  |l MUB01  |h 2039 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240701  |l MUB01  |h 2141 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240729  |l MUB01  |h 2337 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-08-05 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-2013-K-9125  |5 3285005826  |8 20130725  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20130725  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-2013-K-9125  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD