Functional and structural characterization of key players in RNA quality control: the exosome, TRAMP and NRD1 complexes
Kontrolou kvality RNA nazýváme soubor procesů odpovědných za udržování homeostáze různých druhů RNA molekul v buňce. V nedávné době byly tyto procesy popsány u organizmů počínaje jednobuňečnými kvasinkami a konče člověkem. V práci nabizím úvod do problematiky kontroly kvality RNA a shrnuji data získ...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Angličtina |
| Vydáno: |
2013
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/229688/prif_d/ |
| Shrnutí: | Kontrolou kvality RNA nazýváme soubor procesů odpovědných za udržování homeostáze různých druhů RNA molekul v buňce. V nedávné době byly tyto procesy popsány u organizmů počínaje jednobuňečnými kvasinkami a konče člověkem. V práci nabizím úvod do problematiky kontroly kvality RNA a shrnuji data získané o klíčových hráčích této dráhy v Saccharomyces cerevisiae: exosomu a komplexech TRAMP a NRD1. Představuji strukturní studie domény zodpovědné za endonukleázovou aktivitu exosomu, RNA vazebné domény TRAMP komplexu a domény zabezpečující interakci terminačního komplexu NRD1 s RNA polymerasou II. Dále popisuji biochemické vlastnosti jednotlivých podjednotek komplexu TRAMP a představuji předbežnou studii jejich regulace posttranslačními modifikacemi. The RNA quality control is a set of processes responsible for maintaining the homeostasis of different RNA species in cell. It was recently described in organisms ranging from unicellular yeast to humans. Here I provide an introduction to this topic and sum up the data I have obtained on the key players of RNA quality control in Saccharomyces cerevisiae in the course of my PhD work: the exosome, TRAMP and NRD1 complexes. I present the structural study of an exosome domain responsible for endonuclease activity, RNA binding domain of TRAMP complex and domain required for protein-protein interaction between NRD1 complex and the RNA polymerase II. Furthermore, I describe the biochemical properties of individual subunits of the TRAMP complex and present the preliminary study of the posttranslational modifications that might be involved in its regulation. |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Štěpánka Vaňáčová |
| Fyzický popis: | 130 s. : il. |