Expresně aktivní oblasti v jaderné architektuře a její podíl na změnách v genové expresi buňky v průběhu granulocytární diferenciace
Granulopoéza je proces vedoucí ke vzniku vysoce specializovaných buněk imunitního systému, granulocytů. Vývoj granulocytárních neutrofilů je doprovázen výraznými změnami v jaderné architektuře. Restrukturalizace a kondenzace chromatinové struktury má na svědomí utlumení expresního aparátu. Cílem prá...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2013
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/67623/lf_d/ |
| Shrnutí: | Granulopoéza je proces vedoucí ke vzniku vysoce specializovaných buněk imunitního systému, granulocytů. Vývoj granulocytárních neutrofilů je doprovázen výraznými změnami v jaderné architektuře. Restrukturalizace a kondenzace chromatinové struktury má na svědomí utlumení expresního aparátu. Cílem práce je popsat propojení jaderné lokalizace genových klastrů a změn expresních aktivit v nich obsažených genů v průběhu granulopoetické diferenciace. Z microarrays dat porovnávajících rozdíly celkové genové exprese HL-60, in vitro diferencovaných granulocytů a granulocytů z periferní krve dárců jsme vybrali genové klastry obsahující blízké geny se simultánní změnou genové exprese. Pro tyto klastry jsme nasyntetizovali DNA sondy. Sledovali jsme změnu pozice genů v jádře nebo vzájemnou kolokalizaci s transkripčními továrnami bohatými na RNA Pol II během in vitro granulocytární diferenciace. V granulopoéze jsme pozorovali rozsáhlou kondenzaci chromatinu k jaderné periferii, zároveň tak i uvnitř j Granulopoiesis is a process that leads to the generation of highly specialized immune system cells, granulocytes. Granulopoiesis is accompanied by extensive changes in nuclear architecture. Chromatin restructuration and condensation is responsible for expression silencing of many genes. The goal of this thesis is to describe a connection between nuclear localization of selected gene clusters and changes in gene expression of present genes during granulopoietic differentiation. Based on microarray data, which compared gene expression differences among HL-60 cell line, in vitro differentiated granulocytes and peripheral blood granulocytes, gene clusters containing simultaneously regulated adjacent genes were chosen. Using specific probes, we studied changes in nuclear localization of clusters during in vitro granulopoiesis with respect to their transcription status. Also their reciprocal colocalizations with RNA Pol II rich transcription factories were determined. We observed extensive c |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Irena Krontorád Koutná |
| Fyzický popis: | 89 s. |