Predikce pKa s využitím QSPR modelů

Predikce hodnot disociačních konstant je oblastí, která má velký význam pro farmaceutický, chemický, biologický a enviromentání výzkum. Velmi slibnou metodikou pro predikci pKa je aplikace QSPR modelů využívajících jako deskriptory parciální atomové náboje. Cílem této práce bylo připravit QSPR model...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Bouchal, Tomáš (Autor práce)
Další autoři: Svobodová Vařeková, Radka, 1977- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Čeština
Vydáno: 2012
Témata:
anilin
disociační konstanta
fenoly
kvantitativní vztahy mezi strukturou a aktivitou
aniline
dissociation constant
phenols
Quantitative Structure-Activity Relationship
bakalářské práce
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/357534/prif_b/
Obálka
LEADER 07326ctm a22012737a 4500
001 MUB01000721598
003 CZ BrMU
005 20160901142543.0
008 120628s2012 xr ||||| |||||||||||cze d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-05-07 
035 |a (ISMU-VSKP)229517 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035 
072 7 |a 547  |x Organická chemie  |2 Konspekt  |9 10 
080 |a 547.551.1  |2 MRF 
080 |a 547.56  |2 MRF 
100 1 |a Bouchal, Tomáš  |* [absolvent PřírF MU]  |% UČO 357534  |4 dis 
242 1 0 |a QSPR models for pKa prediction  |y eng 
245 1 0 |a Predikce pKa s využitím QSPR modelů  |h [rukopis] /  |c Tomáš Bouchal 
260 |c 2012 
300 |a 35 l. :  |b il. +  |e 1CD-ROM. 
500 |a Vedoucí práce: Radka Svobodová Vařeková 
502 |a Bakalářská práce (Bc.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2012 
520 2 |a Predikce hodnot disociačních konstant je oblastí, která má velký význam pro farmaceutický, chemický, biologický a enviromentání výzkum. Velmi slibnou metodikou pro predikci pKa je aplikace QSPR modelů využívajících jako deskriptory parciální atomové náboje. Cílem této práce bylo připravit QSPR modely pro různé typy molekul a nábojů a analyzovat vliv vybraných faktorů na kvalitu těchto QSPR modelů. V rámci práce byly vytvořeny tréninkové sady pro různé typy molekul (fenoly, o-benzoové kyseliny, m- a p- benzoové kyseliny, o-aniliny, m- a p-aniliny). Dále byly pro každou molekulu vypočítány náboje pomocí 27 různých metod. Pro jednotlivé typy molekul a nábojů bylo připraveno 297 různých QSPR modelů, přičemž tyto modely se rovněž lišily počty desktiptorů. Na závěr práce byla porovnána kvalita různých QSPR modelů. Bylo zjištěno, že QSPR modely využívající nábojové deskriptory jsou velmi úspěšné pro predikci pKa (více než 50% těchto modelů má R2 > 0,9). Analýzy rovněž ukázaly, které typy nábo  |% cze 
520 2 9 |a Prediction of dissociation constants is very important for pharmaceutical, biological and environmental research. A very promising method for pKa prediction is an application of QSPR models employing partial atomic charges as descriptors. The goal of this work is to create QSPR models for different types of molecules and charges and analyze an influence of selected factors on the quality of these models. The training sets for different types of molecules (phenols, o-benzoic acids, m- and p- benzoic acids, o-anilines, m- and p-anilines) were created in this work. Afterwards, partial atomic charges for each molecule were calculated using 27 different methods. For each type of molecule and for each type of charge were prepared 297 QSPR models. These models differ also in a number of descriptors. At the end of the work, the quality of all prepared QSPR models was compared. It was found, that QSPR models employing charge descriptors are very successful for pKa prediction (more than 50% of t  |9 eng 
650 0 7 |a anilin  |7 ph669733  |2 czenas 
650 0 7 |a disociační konstanta  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a fenoly  |7 ph145181  |2 czenas 
650 0 7 |a kvantitativní vztahy mezi strukturou a aktivitou  |2 czmesh 
650 0 9 |a aniline  |2 eczenas 
650 0 9 |a dissociation constant  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a phenols  |2 eczenas 
650 0 2 |a Quantitative Structure-Activity Relationship 
655 7 |a bakalářské práce  |7 fd132403  |2 czenas 
658 |a Biochemie  |b Chemoinformatika a bioinformatika  |c PřF B-BCH CHI (CHI)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Svobodová Vařeková, Radka,  |d 1977-  |7 mub2010609307  |% UČO 4056  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Národní centrum pro výzkum biomolekul  |7 kn20100614011  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/357534/prif_b/ 
CAT |c 20120628  |l MUB01  |h 0421 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20120718  |l MUB01  |h 1429 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20121212  |l MUB01  |h 1109 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20130304  |l MUB01  |h 1433 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20130904  |l MUB01  |h 0955 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20140212  |l MUB01  |h 1326 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140417  |l MUB01  |h 1230 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140428  |l MUB01  |h 1333 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140428  |l MUB01  |h 1349 
CAT |c 20140911  |l MUB01  |h 1610 
CAT |c 20140912  |l MUB01  |h 1104 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141104  |l MUB01  |h 1319 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20150107  |l MUB01  |h 1127 
CAT |c 20150703  |l MUB01  |h 1206 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1449 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1410 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20151203  |l MUB01  |h 1045 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0245 
CAT |c 20160525  |l MUB01  |h 1552 
CAT |a PTICHAX  |b 02  |c 20160830  |l MUB01  |h 2127 
CAT |a PUTNOVAX  |b 02  |c 20160901  |l MUB01  |h 1425 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20180806  |l MUB01  |h 1723 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180828  |l MUB01  |h 0911 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181106  |l MUB01  |h 0731 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 1433 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190228  |l MUB01  |h 1419 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190605  |l MUB01  |h 1343 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190620  |l MUB01  |h 0746 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 0849 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1210 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1218 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200123  |l MUB01  |h 1134 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200123  |l MUB01  |h 1137 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200323  |l MUB01  |h 1958 
CAT |c 20200507  |l MUB01  |h 1114 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 1125 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 1126 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201112  |l MUB01  |h 0514 
CAT |a PTICHAX  |b 02  |c 20210131  |l MUB01  |h 1332 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210217  |l MUB01  |h 2156 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210525  |l MUB01  |h 1147 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210525  |l MUB01  |h 1148 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 0959 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1948 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1215 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210819  |l MUB01  |h 1812 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220324  |l MUB01  |h 2121 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220811  |l MUB01  |h 2150 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220929  |l MUB01  |h 2118 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221004  |l MUB01  |h 0159 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221220  |l MUB01  |h 0136 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230228  |l MUB01  |h 0105 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230314  |l MUB01  |h 2021 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2352 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2354 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2355 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230730  |l MUB01  |h 2154 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230910  |l MUB01  |h 2311 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231013  |l MUB01  |h 0910 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231110  |l MUB01  |h 0959 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231212  |l MUB01  |h 0014 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240202  |l MUB01  |h 2101 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240313  |l MUB01  |h 0025 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240415  |l MUB01  |h 0036 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240519  |l MUB01  |h 0019 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240613  |l MUB01  |h 2039 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240701  |l MUB01  |h 2141 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240729  |l MUB01  |h 2337 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-05-07 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-2012-K-8783  |5 3285005323  |8 20121213  |f 70  |f Prezenční  |r 20121213  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-2012-K-8783  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD 

Podobné jednotky