Charakterizace mikroflóry trávicího traktu volně žijících goril nížíných (Gorilla gorilla gorilla)

V předkládané práci byla zkoumána mikroflóra gastrointestinálního traktu (GIT) volně žijících goril nížinných (Gorilla gorilla gorilla) z národního parku Dzanga Ndoki ve Středoafrické republice. Pomocí molekulárních nekultivačních metod (PCR-DGGE a qPCR) byla popsána, kvantifikována a porovnána mikr...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Vlčková, Klára (Autor práce)
Další autoři: Mrázek, Jakub (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2012
Témata:
gorila nižinná
lidoopovití
střevní mikroflóra
trávicí ústrojí
alimentary tract
apes
Gorilla gorilla
intestinal microflora
diplomové práce
master's theses
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/268991/prif_m/
Obálka
LEADER 07384ctm a22008417a 4500
001 MUB01000721261
003 CZ BrMU
005 20200423120652.0
008 120627s2012 xr ||||| |||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-05-07 
035 |a (ISMU-VSKP)204882 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD004 
072 7 |a 59  |x Zoologie  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 599.88/.89  |2 MRF 
080 |a 611  |2 MRF 
080 |a [612.33+612.36]:579  |2 MRF 
100 1 |a Vlčková, Klára  |% UČO 268991  |* [absolvent PřírF MU, zoologie]  |4 dis 
242 1 0 |a Description of microflora of gastrointestinal tract of free living westen lowland gorillas (Gorilla gorilla gorilla)  |y eng 
245 1 0 |a Charakterizace mikroflóry trávicího traktu volně žijících goril nížíných (Gorilla gorilla gorilla)  |h [rukopis] /  |c Klára Vlčková 
260 |c 2012 
300 |a 62 l. 
500 |a Vedoucí práce: Jakub Mrázek 
502 |a Diplomová práce (Mgr.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2012 
520 2 |a V předkládané práci byla zkoumána mikroflóra gastrointestinálního traktu (GIT) volně žijících goril nížinných (Gorilla gorilla gorilla) z národního parku Dzanga Ndoki ve Středoafrické republice. Pomocí molekulárních nekultivačních metod (PCR-DGGE a qPCR) byla popsána, kvantifikována a porovnána mikroflóra (i) dvou plně habituovaných skupin, jedné skupiny v procesu habituace a jedné nehabituované skupiny goril, (ii) jednotlivých goril z plně habituované skupiny sledované ve dvou následujících letech a (iii) volně žijících goril a goril žijících v zajetí v českých ZOO. Fragmenty bakteriální DNA z DGGE byly osekvenovány a získané sekvence byly porovnány s EMBL databází nukleotidů (GenBank). U všech studovaných skupin goril patřila většina získaných sekvencí dosud nekultivovaným bakteriím. Nejčastěji identifikované bakterie patřily do kmene Firmicutes. Pomocí klastrové analýzy bylo zjištěno, že jedinci v rámci jedné plně habituované skupiny a v rámci skupiny v procesu habituace mají relativně podobné mikrobiální profily, zatímco profily jedinců z druhé habituované skupiny a nehabituované skupiny se v rámci skupiny lišily. Metodou qPCR byly kvantifikovány vybrané skupiny bakterií: skupina Clostridium leptum, skupina Bacteroides, skupina Bifidobacterium, skupina Lactobacillus a Enterobacteriaceae. U skupin Lactobacillus a Enterobacteriacea byly zjištěny signifikantní rozdíly v počtech bakterií mezi skupinami goril, což může být spojeno s působením stresu během procesu habituace. Časové změny v mikroflóře u jedinců z plně habituované skupiny nebyly klastrovou analýzou potvrzeny; výsledky z qPCR však ukázaly, že počty bakterií ve skupině Lactobacillus byly vyšší ve vzorcích z roku 2009.  |% cze 
520 2 9 |a We studied microflora of gastrointestinal tract (GIT) of wild western lowland gorillas (Gorilla gorilla gorilla) from Dzanga Ndoki National Park, Central African Republic. Using molecular non-cultivation techniques (PCR-DGGE and qPCR) we described, quantified, and compared gastrointestinal microflora of (i) two fully-habituated gorilla groups, one group under habituation, and one completely unhabituated group, (ii) individual gorillas of one fully-habituated group in two consecutive years, and (iii) wild and captive gorillas from Czech Zoos. Fragments of bacterial DNA obtained from DGGE analyses were identified by sequencing and were assigned to those in the EMBL (GenBank) database. In all gorilla groups, a high number of uncultured bacteria were detected. Most of the identified bacteria belonged to the phylum Firmicutes. Using clustering analyses it was shown that the profiles of GIT microflora within one habituated group and the group under habituation were relatively similar; on the contrary, profiles obtained from the second habituated group and the unhabituated group did not clearly cluster according to group. Using qPCR, selected bacterial groups, namely the Clostridium leptum group, Bacteroides group, Bifidobacterium group, Lactobacillus group, and Enterobacteriaceae, were quantified. Significant differences in counts of the Lactobacillus group and Enterobacteriaceae among gorilla groups were detected, which can be linked to exposure to stress during the habituation process. The cluster analysis did not reveal any temporal changes in gut microflora in individual gorillas from the fully-habituated group; however, using qPCR it was detected that lactobacilli counts were higher in samples collected in 2009. The Clostridium leptum group was the most numerous group of bacteria for both wild and captive gorillas.  |9 eng 
650 0 7 |a gorila nižinná  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a lidoopovití  |7 ph187936  |2 czenas 
650 0 7 |a střevní mikroflóra  |7 ph292622  |2 czenas 
650 0 7 |a trávicí ústrojí  |7 ph126779  |2 czenas 
650 0 9 |a alimentary tract  |2 eczenas 
650 0 9 |a apes  |2 eczenas 
650 0 9 |a Gorilla gorilla  |2 eczenas 
650 0 9 |a intestinal microflora  |2 eczenas 
655 7 |a diplomové práce  |7 fd132022  |2 czenas 
655 9 |a master's theses  |2 eczenas 
658 |a Biologie  |b Systematická biologie a ekologie  |c PřF N-BI BISE (BISE)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Mrázek, Jakub  |7 xx0062336  |% UČO 389354  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav botaniky a zoologie  |7 olak2006333067  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/268991/prif_m/ 
CAT |c 20120627  |l MUB01  |h 0423 
CAT |a RACLAVSKA  |b 02  |c 20120731  |l MUB01  |h 1425 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20130304  |l MUB01  |h 1432 
CAT |a KLEPPOVA  |b 02  |c 20130910  |l MUB01  |h 1430 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20140116  |l MUB01  |h 1453 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140514  |l MUB01  |h 0848 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140514  |l MUB01  |h 0853 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140514  |l MUB01  |h 0856 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140528  |l MUB01  |h 0733 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140528  |l MUB01  |h 0742 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140528  |l MUB01  |h 0745 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140528  |l MUB01  |h 0749 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140528  |l MUB01  |h 0752 
CAT |c 20140911  |l MUB01  |h 1609 
CAT |c 20140912  |l MUB01  |h 1103 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141204  |l MUB01  |h 1156 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141204  |l MUB01  |h 1159 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141204  |l MUB01  |h 1204 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20150107  |l MUB01  |h 1325 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20150107  |l MUB01  |h 1329 
CAT |c 20150703  |l MUB01  |h 1206 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1449 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1410 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0244 
CAT |a FIALOVA  |b 02  |c 20200423  |l MUB01  |h 1206 
CAT |c 20200507  |l MUB01  |h 1113 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 0959 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1948 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1214 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-05-07 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 ZOOLO  |b Ústav botaniky a zoologie (ZOOLO)  |3 DP 738/2012/výtisk A  |5 3145355578  |4 DPČ: 738-12 -- DP  |8 20120731  |f 78  |f Mimo UK  |r 20120731  |s dar 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 ZOOLO  |b Ústav botaniky a zoologie (ZOOLO)  |3 DP 738/2012/výtisk B  |5 3145359084  |4 DPČ: 738-12 -- DP  |8 20130924  |f 78  |f Mimo UK  |r 20130708  |s dar 
AVA |a MED50  |b KUK  |c Ústav botaniky a zoologie (ZOOLO)  |d DP 738/2012/výtisk B  |e available  |t K dispozici  |f 2  |g 0  |h N  |i 0  |j ZOOLO 

Podobné jednotky