Preparation and characterization of a tudor domain involved in binding of asymmetrically dimethylated arginine

C-terminální doména (CTD) je unikátní struktura největší podjednotky eukaryotické RNA polymerázy II, složena z tandemově se opakujících heptapeptidů. CTD je v průběhu transkripce masivně post-translačně modifikována. Jednou z nejnověji objevených modifikací je methylace argininu třicátého prvního he...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Križanová, Eva (Autor práce)
Další autoři: Štefl, Richard, 1975- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2012
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/357444/prif_b/
Obálka
LEADER 06713ctm a22011177a 4500
001 MUB01000721086
003 CZ BrMU
005 20230713131231.0
008 120626s2012 xr ||||| |||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-05-07 
035 |a (ISMU-VSKP)229462 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035 
072 7 |a 543  |x Analytická chemie  |2 Konspekt  |9 10 
080 |a 543.426.1  |2 MRF 
100 1 |a Križanová, Eva  |% UČO 357444  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
242 1 0 |a Preparation and characterization of a tudor domain involved in binding asymmetrically dimethylated arginine  |y eng 
245 1 0 |a Preparation and characterization of a tudor domain involved in binding of asymmetrically dimethylated arginine  |h [rukopis] /  |c Eva Križanová 
260 |c 2012 
300 |a 65 l. :  |b il. 
500 |a Vedoucí práce: Richard Štefl 
502 |a Bakalářská práce (Bc.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2012 
520 2 |a C-terminální doména (CTD) je unikátní struktura největší podjednotky eukaryotické RNA polymerázy II, složena z tandemově se opakujících heptapeptidů. CTD je v průběhu transkripce masivně post-translačně modifikována. Jednou z nejnověji objevených modifikací je methylace argininu třicátého prvního heptapeptidu. Bylo prokázáno, že tato modifikace má vliv na regulaci transkripce malých jaderných RNA. Tudor doména je jediná dosud známa bílkovinná doména specificky rozpoznávající methylované argininové zbytky. Na rozdíl od jiných tudor domén, TDRD3 upřednostňuje arginin methylovaný asymetricky (aDMA) před symetricky methylovaným, avšak mechanizmus, kterým TDRD3 rozeznává aDMA, není známý. Tato bakalářská práce se zaměřuje na získání různých forem Tudor domény lidského proteinu TDRD3 a charakterizaci jejich vazebné afinity vůči methylované CTD. Potvrdili jsme preferenci asymetricky methylovaného argininu a objasnili roli vybraných aromatických aminokyselinových zbytků aktivního místa.  |% cze 
520 2 9 |a The C-terminal domain (CTD) is a unique structure of the largest subunit of eukaryotic RNA polymerase II. It is composed of tandem heptapeptide repeats which undergo massive post-translational modification during process of transcription. A newly discovered modification is methylation at a single arginine of non-consensus repeat n31 and it was shown that this modification plays a role in the regulation of snRNA expression. The Tudor domain is the only known protein structure specifically recognizing methylarginine residues. It was shown that the Tudor domain containing protein 3 (TDRD3) binds preferentially to CTD containing asymmetrically dimethylated arginine (aDMA), as opposed to other Tudor domain-containing proteins (SMN and SPF30). The mechanistic understanding of recognition of methylated arginine by TDRD3 is lacking. In this thesis we focus on expression of different constructs of Tudor domain of TDRD3 and characterization of binding affinity of TDRD3 to asymmetrically dimethy  |9 eng 
650 0 7 |a anizotropie  |2 czmesh 
650 0 7 |a bílkoviny  |7 ph119082  |2 czenas 
650 0 7 |a fluorescenční polarizace  |2 czmesh 
650 0 7 |a methylovaný arginin  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a Tudor doména  |2 CZ-BrMU 
650 0 9 |a arginine methylation  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a proteins  |2 eczenas 
650 0 9 |a Tudor domain  |2 eCZ-BrMU 
650 0 2 |a Fluorescence Polarization 
655 7 |a bakalářské práce  |7 fd132403  |2 czenas 
658 |a Biochemie  |b Biochemie  |c PřF B-BCH BCHM (BCHM)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Štefl, Richard,  |d 1975-  |7 mub2010582198  |% UČO 19362  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav biochemie  |7 ko2015866760  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/357444/prif_b/ 
CAT |c 20120626  |l MUB01  |h 0423 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20120921  |l MUB01  |h 1454 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20121116  |l MUB01  |h 1142 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20130304  |l MUB01  |h 1432 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20130610  |l MUB01  |h 1454 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140115  |l MUB01  |h 0942 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140424  |l MUB01  |h 0832 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140430  |l MUB01  |h 1641 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140430  |l MUB01  |h 1646 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140507  |l MUB01  |h 0912 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140507  |l MUB01  |h 0924 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140507  |l MUB01  |h 0930 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140513  |l MUB01  |h 0801 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140513  |l MUB01  |h 0804 
CAT |c 20140911  |l MUB01  |h 1609 
CAT |c 20140912  |l MUB01  |h 1103 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140924  |l MUB01  |h 0738 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140924  |l MUB01  |h 0742 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141111  |l MUB01  |h 0805 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141111  |l MUB01  |h 0808 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20150806  |l MUB01  |h 1237 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1449 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1410 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0244 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20160802  |l MUB01  |h 0814 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20160802  |l MUB01  |h 0818 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170829  |l MUB01  |h 0015 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181107  |l MUB01  |h 1608 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181107  |l MUB01  |h 1614 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181107  |l MUB01  |h 1622 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 1815 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2020 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2033 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2142 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0147 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0152 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0208 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0734 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0739 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0742 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0745 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0749 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1138 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1142 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1155 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1436 
CAT |c 20200507  |l MUB01  |h 1113 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 0959 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1948 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1214 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221102  |l MUB01  |h 1703 
CAT |a VASICEKX  |b 02  |c 20230713  |l MUB01  |h 1312 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240604  |l MUB01  |h 2354 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240604  |l MUB01  |h 2359 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240605  |l MUB01  |h 0002 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-05-07 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PriF-2012-K-8750  |5 3285005268  |8 20121119  |f 70  |f Prezenční  |r 20121119  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PriF-2012-K-8750  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD