Úspěšnost izolace genetické informace z historického kosterního materiálu. Srovnání izolačních postupů

Tato práce se zabývá možnostmi izolace archaické DNA (aDNA) z kosterních pozůstatků. Zmiňuje stavbu molekuly DNA a změny, které nastávají během posmrtného procesu. Oxidativní a hydrolytické mechanismy způsobují změny ve stavbě molekuly a také zapříčiňují degradaci a fragmentaci aDNA. Práce také pouk...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Vlahová, Veronika (Autor práce)
Další autoři: Drozdová, Eva, 1967- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Čeština
Vydáno: 2012
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/356793/prif_b/
Obálka
Popis
Shrnutí:Tato práce se zabývá možnostmi izolace archaické DNA (aDNA) z kosterních pozůstatků. Zmiňuje stavbu molekuly DNA a změny, které nastávají během posmrtného procesu. Oxidativní a hydrolytické mechanismy způsobují změny ve stavbě molekuly a také zapříčiňují degradaci a fragmentaci aDNA. Práce také poukazuje na nebezpečí kontaminace, která je častou příčinou nízkých výtěžků a znehodnocení výsledků. Přítomnost inhibitorů znemožňuje další zpracování vzorků jako je např. PCR nebo sekvencování. Hlavní náplní práce je popis a srovnání izolačních metod, mezi které patří i použití komerčně dostupných izolačních sad. Práce popisuje vývoj a modifikace izolačních metod. Srovnává efektivnost těchto metod vzhledem k výtěžnosti dané metody, časové a finanční náročnosti a vzhledem k riziku kontaminace. Stejným způsobem práce srovnává také komerčně prodávané izolační kity, které se díky své jednoduchosti a specificitě používají pro izolaci aDNA stále častěji.
This essay/ research deals with the different possibilities of isolating archaic DNA (aDNA) from the skeletal remains. It mentions the structure of a DNA molecule and changes which happen during the post-mortem process. Oxidative and hydrolytic mechanisms cause changes in the molecular structure and also cause the degradation and fragmentation of aDNA. The essay/ research also warns against the dangers of contamination which is often the source of low gains and devaluation of results. The presence of inhibitors forbids further processing of samples e.g. PCR or sequencing. The main goal of the essay/ research is the description and comparison of isolation methods, including the use of commercially available isolating kits. The essay/ research describes the development and modification of isolation methods. It compares the efficacy of these methods considering the gains of given method, time and financial demands and the ri
Popis jednotky:Vedoucí práce: Eva Drozdová
Fyzický popis:41 l.