Identifikace a charakterizace proteinů regulovaných rostlinnými hormony cytokininy pomocí hmotnostní spektrometrie
Rostlinné hormony cytokininy mají zásadní význam pro růst a vývoj rostlin. I přes intenzivní výzkum molekulární podstata působení cytokininů není dosud zcela objasněna. Zvláště pak o přímém vlivu cytokininů na změny proteinového profilu v rostlinách toho není dosud příliš známo. Pro proteomickou ana...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Angličtina |
| Vydáno: |
2012
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/77671/prif_d/ |
| Shrnutí: | Rostlinné hormony cytokininy mají zásadní význam pro růst a vývoj rostlin. I přes intenzivní výzkum molekulární podstata působení cytokininů není dosud zcela objasněna. Zvláště pak o přímém vlivu cytokininů na změny proteinového profilu v rostlinách toho není dosud příliš známo. Pro proteomickou analýzu byli vybráni zástupci čtyř tříd cytokininů: hydroxylovaný isopentenylový, isopentenylový, aromatický typ a cytokininy odvozené od močoviny. Sedmidenní sazeničky huseníčku jarního (Arabidopsis thaliana) byly vystaveny krátkodobému působení cytokininů v kultivačním médiu. Po sběru rostlinek a následné extrakci proteinů, bylo využito metod gelové elektroforézy a hmotnostní spektrometrie s ionizací laserem za přítomnosti matrice v kombinaci s detektorem doby letu pro identifikaci proteinů, u kterých byla pozorována změna exprese vlivem cytokininů. Zkoumání a optimalizace různých proteomických metod vedly k podstatnému zlepšení identifikace a charakterizace rostlinných proteinů. Cytokinins are plant hormones that play an important role in plant growth and development. The molecular mechanisms of the cytokinin action are being intensely researched, but the changes of the proteome and phosphoproteome in response to cytokinin signals are still largely unknown. In order to get an insight into cytokinin signalling action at the protein level, 7-day-old Arabidopsis thaliana seedlings were treated with four main cytokinins representing hydroxyisopentenyl, isopentenyl, aromatic, and urea-derived type cytokinins. After total protein extraction with standard methods, gel electrophoresis followed by matrix-assisted laser desorption/ionization-time-of-flight mass spectrometry were used to separate and identify proteins that were differentially expressed under the cytokinin treatment. Various proteomic methods were examined to enhance the efficiency of the protein identification procedure. |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Janette Bobáľová |
| Fyzický popis: | 109 l., V l. |