Structure and dynamics of RNA
Práce je zaměřena na studium RNA duplexů a několik RNA motivů, konkrétně, trojcestných rozhraní (three-way junction), kink-turnů a vnitřních UAA/GAA smyček, s pomocí molekulově-dynamických simulací. Práce zahrňuje studii geometrie a dynamiky kanonických dvoušroubovic RNA za různých fyziologických ko...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Angličtina |
| Vydáno: |
2012
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/77577/prif_d/ |
| LEADER | 04161ctm a22006737a 4500 | ||
|---|---|---|---|
| 001 | MUB01000709709 | ||
| 003 | CZ BrMU | ||
| 005 | 20120723144814.0 | ||
| 008 | 120316s2012 xr ||||| |||||||||||eng d | ||
| STA | |a POSLANO DO SKCR |b 2020-04-01 | ||
| 035 | |a (ISMU-VSKP)139398 | ||
| 040 | |a BOD114 |b cze |d BOD035 | ||
| 072 | 7 | |a 577 |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika |2 Konspekt |9 2 | |
| 080 | |a 544.112:531.3 |2 MRF | ||
| 080 | |a 577.113.8 |2 MRF | ||
| 100 | 1 | |a Beššeová, Ivana, |d 1984- |7 mub2012681791 |% UČO 77577 |4 dis | |
| 242 | 1 | 0 | |a Struktura a dynamika RNA |y cze |
| 245 | 1 | 0 | |a Structure and dynamics of RNA |h [rukopis] / |c Ivana Beššeová |
| 260 | |c 2012 | ||
| 300 | |a xi, 79 s., [102] s. příl. | ||
| 500 | |a Vedoucí práce: Jiří Šponer | ||
| 502 | |a Dizertace (Ph.D.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2012 | ||
| 520 | 2 | |a Práce je zaměřena na studium RNA duplexů a několik RNA motivů, konkrétně, trojcestných rozhraní (three-way junction), kink-turnů a vnitřních UAA/GAA smyček, s pomocí molekulově-dynamických simulací. Práce zahrňuje studii geometrie a dynamiky kanonických dvoušroubovic RNA za různých fyziologických koncentrací iontů a použití několika verzí silového pole AMBER pro RNA i pro solvatující molekuly vody. Studie inovativně popisuje sekvenční závislost geometrie duplexů na koncentraci solí. Práce poskytuje detailní náhled na strukturu a dynamiku vybraných sekundárních a terciárních RNA motivů na nanosekundové škále a pro některé z nich navrhuje možné role v biologických procesech. |% cze | |
| 520 | 2 | 9 | |a This PhD thesis is focused on the study of RNA helices and selected RNA motifs, mainly, three-way junctions, kink-turns, and UAA/GAA internal loops, using state-of-the-art molecular dynamics simulations. The geometry and dynamics of canonical RNA helices have been explored under various physiological ionic conditions and by applying various available versions of the AMBER force field for RNA and water molecules. The sequence dependence of the helices’ geometry on salt strength is newly described. the PhD thesis provides a detailed insight into structure and dynamics of individual secondary and tertiary RNA structures on the nanosecond time scale and suggests for some of them possible roles in biological processes. |9 eng |
| 650 | 0 | 7 | |a molekulární dynamika |7 ph202577 |2 czenas |
| 650 | 0 | 7 | |a RNA |2 czmesh |
| 650 | 0 | 9 | |a molecular dynamics |2 eczenas |
| 650 | 0 | 2 | |a RNA |
| 655 | 7 | |a disertace |7 fd132024 |2 czenas | |
| 655 | 9 | |a dissertations |2 eczenas | |
| 658 | |a Biochemie (čtyřleté) |b Biomolekulární chemie |c PřF D-BCH4 BIOM (BIOM) |2 CZ-BrMU | ||
| 700 | 1 | |a Šponer, Jiří, |d 1964- |7 ola2003204899 |% UČO 28764 |4 ths | |
| 710 | 2 | |a Masarykova univerzita. |b Přírodovědecká fakulta |7 kn20010709281 |4 dgg | |
| 856 | 4 | 1 | |u http://is.muni.cz/th/77577/prif_d/ |
| CAT | |c 20120316 |l MUB01 |h 0421 | ||
| CAT | |a batch |b 00 |c 20120324 |l MUB01 |h 0156 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20120328 |l MUB01 |h 1100 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20120402 |l MUB01 |h 1006 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20120607 |l MUB01 |h 1523 | ||
| CAT | |a VASICEK |b 02 |c 20120723 |l MUB01 |h 1448 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20130304 |l MUB01 |h 1405 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20130528 |l MUB01 |h 1538 | ||
| CAT | |c 20150901 |l MUB01 |h 1448 | ||
| CAT | |c 20150921 |l MUB01 |h 1409 | ||
| CAT | |a NEDOMOVAX |b 02 |c 20151002 |l MUB01 |h 1954 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20151226 |l MUB01 |h 0232 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20161219 |l MUB01 |h 1558 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20171219 |l MUB01 |h 1213 | ||
| CAT | |c 20200401 |l MUB01 |h 1259 | ||
| CAT | |c 20210614 |l MUB01 |h 0958 | ||
| CAT | |c 20210614 |l MUB01 |h 1947 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20210724 |l MUB01 |h 1212 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20221101 |l MUB01 |h 0912 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20231012 |l MUB01 |h 2100 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20240513 |l MUB01 |h 1950 | ||
| LOW | |a POSLANO DO SKCR |b 2020-04-01 | ||
| 994 | - | 1 | |l MUB01 |l MUB01 |m VYSPR |1 KUK |a Knihovna univ. kampusu |2 SKLAD |b KUK - sklad |3 PřF-2012-K-8596 |5 3285005051 |8 20120723 |f 70 |f Prezenční |r 20120723 |s převod |
| AVA | |a MED50 |b KUK |c KUK - sklad |d PřF-2012-K-8596 |e available |t K dispozici |f 1 |g 0 |h N |i 0 |j SKLAD | ||