Vývojové aspekty umlčování exprese genů pro ribosomální RNA v přirozených a syntetických hybridech rodu Tragopogon

Tragopogon mirus Ownbey a Tragopogon miscellus Ownbey jsou relativně nové allotetraploidní druhy. Vznikly asi před 80ti lety na severozápadě Spojených států poté, co byly jejich rodičovské druhy T. dubius Scop., T. pratensis L. a T. porrifolius L. přivezeny z Evropy. Zde se začaly množit a hybridizo...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Malinská, Hana, 1983- (Autor práce)
Další autoři: Kovařík, Aleš, 1960- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Čeština
Vydáno: 2011
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/78322/prif_d/
Obálka
LEADER 07068ctm a22008177a 4500
001 MUB01000709034
003 CZ BrMU
005 20210412112906.0
008 120309s2011 xr ||||| |||||||||||cze d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-04-01 
035 |a (ISMU-VSKP)139568 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD004 
072 7 |a 575  |x Obecná genetika. Obecná cytogenetika. Evoluce  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 577.214  |2 MRF 
080 |a 582.998.1  |2 MRF 
100 1 |a Malinská, Hana,  |d 1983-  |7 mub2012693432  |% UČO 78322  |4 dis 
242 1 0 |a Evolutionary Aspects of rRNA Gene Silencing in Natural and Synthetic Tragopogon Hybrids  |y eng 
245 1 0 |a Vývojové aspekty umlčování exprese genů pro ribosomální RNA v přirozených a syntetických hybridech rodu Tragopogon  |h [rukopis] /  |c Hana Malinská 
260 |c 2011 
300 |a 67 l., [24]l. příl. 
500 |a Vedoucí práce: Aleš Kovařík 
502 |a Dizertace (Ph.D.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2012 
520 2 |a Tragopogon mirus Ownbey a Tragopogon miscellus Ownbey jsou relativně nové allotetraploidní druhy. Vznikly asi před 80ti lety na severozápadě Spojených států poté, co byly jejich rodičovské druhy T. dubius Scop., T. pratensis L. a T. porrifolius L. přivezeny z Evropy. Zde se začaly množit a hybridizovat, dodnes můžeme pozorovat na stejném místě původní diploidní druhy spolu s expandujícími populacemi tetraploidů. Ve většině přirozených populací obsahuje genom T. mirus i T. miscellus mnohem méně rDNA jednotek od jejich společného rodiče (T. dubius) než od druhého rodičovského druhu. Ve vzácných případech dochází k tak rozsáhlé eliminaci T. dubius jednotek, že je rDNA lokus jen velmi obtížně detekovatelný. Jedinci s malým množstvím T. dubius rDNA obvykle vykazují jadérkovou dominanci pouze jednoho z rodičů, paradoxně tedy pochází většina transkriptů právě z T. dubius, tedy minoritního rodiče. Tento obvyklý trend však může být porušen, například dojde-li k natolik vážnému snížení množství T. dubius jednotek, že nejsou schopny pokrýt metabolickou potřebu rRNA v rychle se dělicích pletivech. Pak může dojít i k přepisu rDNA jednotek homeologa, jako se to stalo u jedné přirozené populace T. mirus. V této populaci je množství ribozomálních genů téměř vyrovnané. U těchto rostlin detekujeme zhruba stejné množství transkriptů původem z obou rodičovských druhů. Tyto výsledky ukazují, že proces umlčování genů není nezvratný, ale že umlčené geny lze aktivovat v závislosti na podmínkách (stupeň diferenciace) a počtu genů. Během posledních let bylo připraveno několik syntetických linií, analogických k přirozeným druhům T. mirus a T. miscellus.  |% cze 
520 2 9 |a Tragopogon mirus Ownbey and Tragopogon miscellus Ownbey are recent allotetraploids that have formed recurrently within the last 80 years, following the introduction of the diploids T. dubius Scop., T. pratensis L. and T. porrifolius L. from Europe to North America. In some areas, the progenitor diploids still occur along with expanding populations of the allotetraploids, and the polyploids at those locations likely represent descendents of the nearby diploids. In most natural populations of T. mirus and T. miscellus, there are far fewer rDNA units of the common parent (T. dubius) than there are of the other diploid parent and in some rarely occurring individuals one parental locus was almost deleted. These individuals usually display nucleolar dominance of one parental species (T. dubius). General trend of dominance can be reversed in highly metabollically active tissues. In one population of T. mirus gene ratios were balanced. In these plants, transcripts from both parental species equally occur. Several lineages of T. mirus and T. miscellus were recently successfully resynthetized from diploid species. Among more than 200 synthetic individuals analyzed, we observed frequent deviations from copy number additivity; that is in most cases, the T. dubius homoelogs were reduced in copy number. Also some lines with equal number of both parental rDNA occured, in these lines, codominance of both parental species was usually detected. At the epigenetic level, the genes of T. dubius origin dominate expression in most natural and synthetic allopolyploids. The fact that some rDNA genotypes seen in 80 years old allopolyploids are already evident in the first generation of synthetic lines support the hypothesis that the extent and tempo of rDNA homogenization in older allopolyploids is largely influenced by genetic and epigenetic changes in the early generations.  |9 eng 
650 0 7 |a hvězdnicovité  |7 ph170609  |2 czenas 
650 0 7 |a polyploidie  |2 czmesh 
650 0 7 |a ribozomální DNA  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a Tragopogon  |2 czmesh 
650 0 7 |a umlčování genů  |7 ph579350  |2 czenas 
650 0 9 |a Asteraceae  |2 eczenas 
650 0 9 |a gene silencing  |2 eczenas 
650 0 9 |a ribosomal DNA  |2 eCZ-BrMU 
650 0 2 |a Polyploidy 
650 0 2 |a Tragopogon 
655 7 |a disertace  |7 fd132024  |2 czenas 
655 9 |a dissertations  |2 eczenas 
658 |a Biologie (čtyřleté)  |b Obecná a molekulární genetika  |c PřF D-BI4 OMG (OMG)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Kovařík, Aleš,  |d 1960-  |7 xx0028286  |% UČO 24426  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav experimentální biologie  |7 mzk2008412438  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/78322/prif_d/ 
CAT |c 20120309  |l MUB01  |h 0420 
CAT |a batch  |b 00  |c 20120324  |l MUB01  |h 0155 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20120410  |l MUB01  |h 1624 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20120411  |l MUB01  |h 1606 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20120831  |l MUB01  |h 1006 
CAT |a RACLAVSKA  |b 02  |c 20130228  |l MUB01  |h 1305 
CAT |a RACLAVSKA  |b 02  |c 20130301  |l MUB01  |h 1511 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20130304  |l MUB01  |h 1404 
CAT |a RACLAVSKA  |b 02  |c 20131210  |l MUB01  |h 1508 
CAT |a KLEPPOVA  |b 02  |c 20131211  |l MUB01  |h 1600 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140611  |l MUB01  |h 0739 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140611  |l MUB01  |h 0740 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140611  |l MUB01  |h 0741 
CAT |c 20150703  |l MUB01  |h 1200 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1448 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1409 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0232 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20160126  |l MUB01  |h 1413 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180814  |l MUB01  |h 0746 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181003  |l MUB01  |h 1412 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200218  |l MUB01  |h 0851 
CAT |c 20200401  |l MUB01  |h 1259 
CAT |a VASICEKX  |b 02  |c 20210412  |l MUB01  |h 1129 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 0958 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1946 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1212 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230925  |l MUB01  |h 2011 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-04-01 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-12552  |5 3145357307  |8 20130228  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20130227  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-12552  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD