Tandemová afinitní purifikace jako metoda studia protein-proteinových interakcí
Väčšina bunkových dejov je vykonávaná multiproteínovými komplexami. Identifikácia jednotlivých podjednotiek týchto komplexov je nevyhnutná pre pochopenie ich funkcie. Za posledných 30 rokov bolo vyvinuté široké spektrum metód štúdia proteín-proteínových interakcií. Táto práca popisuje systematický p...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Slovenština |
| Vydáno: |
2012
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/268693/prif_b_b1/ |
| Shrnutí: | Väčšina bunkových dejov je vykonávaná multiproteínovými komplexami. Identifikácia jednotlivých podjednotiek týchto komplexov je nevyhnutná pre pochopenie ich funkcie. Za posledných 30 rokov bolo vyvinuté široké spektrum metód štúdia proteín-proteínových interakcií. Táto práca popisuje systematický prístup slúžiaci k identifikácii a analýze interdoménových a intermolekulárnych proteín-proteínových interakcií katalytickej podjednotky telomerázy Arabidopsis thaliana (AtTERT). Metóda kombinuje vysokovýkonnú platformu tandemová afinitná purifikácia/hmotnostná spektrometria pre identifikáciu interakčných partnerov rastlinnej telomerázy s koimunoprecipitáciami slúžiacimi k analýze vzájomných interakcií domén AtTERT vnútri telomerázového komplexu. Práca pojednáva o výhodách a nástrahách tohto prístupu a komentuje predbežné výsledky, naznačujúce oligomerizačný potenciál AtTERT. Most cellular processes are carried out by multiprotein complexes. The identification of individual subunits is essential for understanding their function. Over the past 30 years, a wide variety of methods have been developed to explore protein-protein interactions. This thesis reports on the use of a systematic approach for the identification and analysis of interdomain and intermolecular protein-protein interactions of the catalytic subunit of telomerase in Arabidopsis thaliana (AtTERT). It combines high-throughput tandem affinity purification/mass spectrometry platform for the identification of putative telomerase regulators and downstream effectors with co-immunoprecipitations for the study of the physical association of AtTERT protein domains inside the telomerase complex. Here I discuss the advantages and caveats of this approach, as well as the preliminary results pointing to the existence of AtTERT oligomerization. |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Petra Procházková Schrumpfová |
| Fyzický popis: | 67 l. : il. |