Characterization of the DSS1 protein interaction

Malý kyslý ľudský proteín DSS1 interaguje s tumor supresorovým proteínom BRCA2, ktorý pôsobí ako rekombinačný mediátor pri procese opravy DNA pomocou homologickej rekombinácie. Napriek tomu, že štruktúra DSS1 proteínu je známa, a že DSS1 interaguje s proteínom BRCA2, jeho funkcia v procese homologic...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Štefanovie, Barbora (Autor práce)
Další autoři: Krejčí, Lumír, 1972- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2011
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/142123/prif_m/
Obálka
LEADER 06935ctm a22012017a 4500
001 MUB01000682722
003 CZ BrMU
005 20111018120134.0
008 110629s2011 xr ||||| |||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2019-12-20 
035 |a (ISMU-VSKP)188711 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 577.113.8  |2 MRF 
080 |a 577.21  |2 MRF 
080 |a 577  |2 MRF 
100 1 |a Štefanovie, Barbora  |% UČO 142123  |* [absolvent LF MU]  |4 dis 
242 1 0 |a Charakterizace DSS1 proteinových interakcí  |y cze 
245 1 0 |a Characterization of the DSS1 protein interaction  |h [rukopis]  |c Barbora Štefanovie 
260 |c 2011 
300 |a 62 l. :  |b il. 
500 |a Vedoucí práce: Lumír Krejčí 
502 |a Diplomová práce (Mgr.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2011 
520 2 |a Malý kyslý ľudský proteín DSS1 interaguje s tumor supresorovým proteínom BRCA2, ktorý pôsobí ako rekombinačný mediátor pri procese opravy DNA pomocou homologickej rekombinácie. Napriek tomu, že štruktúra DSS1 proteínu je známa, a že DSS1 interaguje s proteínom BRCA2, jeho funkcia v procese homologickej rekombinácie zostáva neobjasnená. Táto diplomová práca popisuje funkčnú spojitosť medzi proteínom DSS1 a významnými proteínmi pôsobiacimi v procese homologickej rekombinácie -hRPA a hRAD52. Najprv bolo pomocou pull-down reakcií dokázané, že DSS1 interaguje s oboma spomínanými proteínmi. Sila týchto interakcií však bola negatívne ovplyvnená prítomnosťou ssDNA. Pre hlbšie objasnenie mechanizmu, ktorým sa hRPA a hRAD52 viažu na ssDNA a aká je úloha DSS1 proteínu v tomto mechanizme, bola využitá gelová retardačná analýza (EMSA). V prípade hRPA proteínu, prítomnosť DSS1 stimulovala jeho ssDNA väzbovú aktivitu. Na druhej strane, DSS1 inhiboval schopnosť hRAD52 proteínu viazať ssDNA. Podobné vý  |% cze 
520 2 9 |a DSS1 is a small acidic protein, which interacts with BRCA2, a tumor suppressor protein, that acts as a recombination mediator during DNA repair mediated by the process of homologous recombination. Despite its known structure and interaction with BRCA2 protein, the function of DSS1 protein during the homologous recombination remains unclear. Here, we describe functional connection between DSS1 and hRPA, or hRAD52 proteins respectively, which also take part in homologous recombination. Firstly, we demonstrated by pull-down assays that DSS1 interacts with both hRPA and hRAD52 proteins. These interactions were negatively influenced by the presence of ssDNA. Electrophoretic shift mobility assay (EMSA) was used for the deeper study of the mechanism by which hRPA or hRAD52 bind ssDNA and what is the role of DSS1 protein in ssDNA binding activity of these proteins. In the case of hRPA, DSS1 protein had a stimulatory effect on the ssDNA binding activity of hRPA. On the other hand, in the case  |9 eng 
650 0 7 |a bílkoviny  |7 ph119082  |2 czenas 
650 0 7 |a DNA (nukleová kyselina)  |7 ph116977  |2 czenas 
650 0 7 |a homologní rekombinace  |2 CZ-BrMU 
650 0 9 |a deoxyribonucleic acid  |2 eczenas 
650 0 9 |a DSS1 protein  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a homologous recombination  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a hRAD52 protein  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a proteins  |2 eczenas 
650 0 9 |a RPA protein  |2 eCZ-BrMU 
655 7 |a diplomové práce  |7 fd132022  |2 czenas 
658 |a Biochemie  |b Analytická biochemie  |c PřF N-BCH ANBI (ANBI)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Krejčí, Lumír,  |d 1972-  |7 xx0125663  |% UČO 18098  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav biochemie  |7 ko2015866760  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/142123/prif_m/ 
CAT |c 20110629  |l MUB01  |h 0423 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20111018  |l MUB01  |h 1201 
CAT |a batch  |b 00  |c 20120324  |l MUB01  |h 0149 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20120410  |l MUB01  |h 1643 
CAT |c 20120610  |l MUB01  |h 2027 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20120831  |l MUB01  |h 1016 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20130304  |l MUB01  |h 1248 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20130507  |l MUB01  |h 1204 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20130610  |l MUB01  |h 1616 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20130926  |l MUB01  |h 1434 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140213  |l MUB01  |h 0835 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140424  |l MUB01  |h 0832 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140430  |l MUB01  |h 1641 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140430  |l MUB01  |h 1646 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140507  |l MUB01  |h 0912 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140507  |l MUB01  |h 0924 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140507  |l MUB01  |h 0930 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140513  |l MUB01  |h 0800 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140513  |l MUB01  |h 0804 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20140903  |l MUB01  |h 1206 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140924  |l MUB01  |h 0738 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140924  |l MUB01  |h 0742 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141111  |l MUB01  |h 0805 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141111  |l MUB01  |h 0808 
CAT |c 20150703  |l MUB01  |h 1146 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20150806  |l MUB01  |h 1640 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1447 
CAT |a NEDOMOVAX  |b 02  |c 20150902  |l MUB01  |h 2059 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1409 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0202 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20160802  |l MUB01  |h 0814 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20160802  |l MUB01  |h 0818 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20160831  |l MUB01  |h 1608 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170829  |l MUB01  |h 1151 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181107  |l MUB01  |h 1608 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181107  |l MUB01  |h 1614 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181107  |l MUB01  |h 1622 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 1815 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2020 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2033 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2142 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0147 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0151 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0208 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0734 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0739 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0742 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0745 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0749 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1138 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1142 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1155 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1436 
CAT |c 20191220  |l MUB01  |h 1307 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 0954 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1943 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1206 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240604  |l MUB01  |h 2354 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240604  |l MUB01  |h 2359 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240605  |l MUB01  |h 0002 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2019-12-20 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-2011-K-8477  |5 3285003985  |8 20111018  |f 70  |f Prezenční  |r 20111018  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-2011-K-8477  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD