Studium struktury DNA kvadruplexů pomocí NMR spektroskopie
Tato bakalářská práce se zabývá studiem vlivu ztráty adeninu v TTA smyčkách na změnu struktury G-kvadruplexu tvořeného lidskou telomerní sekvencí AG3(TTAGGG)3. S využitím NMR experimentů bylo zjištěno, že stabilita struktury se mění v závislosti na pozici chybějící báze, jako nejlépe uspořádaná stru...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2011
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/324338/prif_b/ |
| LEADER | 07175ctm a22013937a 4500 | ||
|---|---|---|---|
| 001 | MUB01000682514 | ||
| 003 | CZ BrMU | ||
| 005 | 20160225101618.0 | ||
| 008 | 110628s2011 xr ||||| |||||||||||cze d | ||
| STA | |a POSLANO DO SKCR |b 2019-12-20 | ||
| 035 | |a (ISMU-VSKP)212154 | ||
| 040 | |a BOD114 |b cze |d BOD035 | ||
| 072 | 7 | |a 577 |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika |2 Konspekt |9 2 | |
| 080 | |a 543.42 |2 MRF | ||
| 080 | |a 577.113.8 |2 MRF | ||
| 080 | |a 577 |2 MRF | ||
| 100 | 1 | |a Svobodová, Barbora |% UČO 324338 |* [absolvent PřírF MU] |4 dis | |
| 242 | 1 | 0 | |a Study of DNA quadruplex structures by NMR spectroscopy |y eng |
| 245 | 1 | 0 | |a Studium struktury DNA kvadruplexů pomocí NMR spektroskopie |h [rukopis] / |c Barbora Svobodová |
| 260 | |c 2011 | ||
| 300 | |a 46 l. : |b il. | ||
| 500 | |a Vedoucí práce: Radovan Fiala | ||
| 502 | |a Bakalářská práce (Bc.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2011 | ||
| 520 | 2 | |a Tato bakalářská práce se zabývá studiem vlivu ztráty adeninu v TTA smyčkách na změnu struktury G-kvadruplexu tvořeného lidskou telomerní sekvencí AG3(TTAGGG)3. S využitím NMR experimentů bylo zjištěno, že stabilita struktury se mění v závislosti na pozici chybějící báze, jako nejlépe uspořádaná struktura se jevil oligonukleotid s abazickým místem v pozici 19. Lidská telomerní sekvence AG3(TTAGGG)3 vytváří v roztoku K+ dva odlišné konformery hybridního typu kvadruplexu, označované jako hybridní typ 1 a hybridní typ 2. Ztráta adeninu v pozici 19 zvýhodňuje tvorbu jedné z konformací. Na základě sekvenčního přiřazení bylo určeno, že se jedná o hybridní typ 1. |% cze | |
| 520 | 2 | 9 | |a This bachelor thesis evaluates how the loss of an adenine base in TTA loops affects the structure and stability of the G-quadruplex formed by the human telomeric sequence AG3(TTAGGG)3. Using of NMR experiments we have found that the apurine lesions have different effect on this structure architecture, depending on the position of missing base. The sequence with apurine site in the position 19 appears the best structured. Human telomeric sequences AG3(TTAGGG)3 in K+ solution folds to hybride type intramolecular G-quadruplex with two different coexisting conformers noted Form 1 and Form 2. The loss of adenine in position 19 favors the formation of one the two conformers. Based on sequential assignment we determined the apurine site in position 19 adopts Form 1 folding topology. |9 eng |
| 650 | 0 | 7 | |a dna |7 ph114333 |2 czenas |
| 650 | 0 | 7 | |a glykosidický torzní úhel |2 CZ-BrMU |
| 650 | 0 | 7 | |a guaninová tetráda |2 CZ-BrMU |
| 650 | 0 | 7 | |a guaninový kvadruplex |2 CZ-BrMU |
| 650 | 0 | 7 | |a Hoogsteenovo párování bází |2 CZ-BrMU |
| 650 | 0 | 7 | |a hybridní typ kvadruplexu |2 CZ-BrMU |
| 650 | 0 | 7 | |a nukleární magnetická rezonance |7 ph123365 |2 czenas |
| 650 | 0 | 7 | |a spektroskopie |7 ph116234 |2 czenas |
| 650 | 0 | 7 | |a telomera |2 CZ-BrMU |
| 650 | 0 | 9 | |a deoxyribonucleic acid |2 eczenas |
| 650 | 0 | 9 | |a glycosidic torsion angle |2 eCZ-BrMU |
| 650 | 0 | 9 | |a gout |2 eczenas |
| 650 | 0 | 9 | |a guanine quadruplex |2 eCZ-BrMU |
| 650 | 0 | 9 | |a guanine tetrad |2 eCZ-BrMU |
| 650 | 0 | 9 | |a Hoogsteen base pairing |2 eCZ-BrMU |
| 650 | 0 | 9 | |a hybrid-type quadruplex |2 eCZ-BrMU |
| 650 | 0 | 9 | |a nuclear magnetic resonance |2 eczenas |
| 650 | 0 | 9 | |a spectroscopy |2 eczenas |
| 650 | 0 | 9 | |a telomere |2 eCZ-BrMU |
| 655 | 7 | |a bakalářské práce |7 fd132403 |2 czenas | |
| 655 | 9 | |a bachelor's theses |2 eczenas | |
| 658 | |a Biochemie |b Biochemie |c PřF B-BCH BCHM (BCHM) |2 CZ-BrMU | ||
| 700 | 1 | |a Fiala, Radovan, |d 1959- |7 xx0064673 |% UČO 564 |4 ths | |
| 710 | 2 | |a Masarykova univerzita. |b Národní centrum pro výzkum biomolekul |7 kn20100614011 |4 dgg | |
| 856 | 4 | 1 | |u http://is.muni.cz/th/324338/prif_b/ |
| CAT | |c 20110628 |l MUB01 |h 0423 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20110721 |l MUB01 |h 1239 | ||
| CAT | |a FOLTYNOVA |b 02 |c 20110825 |l MUB01 |h 0935 | ||
| CAT | |a FOLTYNOVA |b 02 |c 20110923 |l MUB01 |h 1431 | ||
| CAT | |a batch |b 00 |c 20120324 |l MUB01 |h 0149 | ||
| CAT | |c 20120610 |l MUB01 |h 2027 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20130304 |l MUB01 |h 1248 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20130304 |l MUB01 |h 1302 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20130925 |l MUB01 |h 1210 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20140417 |l MUB01 |h 1230 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20140428 |l MUB01 |h 1332 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20140428 |l MUB01 |h 1349 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20141104 |l MUB01 |h 1319 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20150107 |l MUB01 |h 1127 | ||
| CAT | |c 20150703 |l MUB01 |h 1146 | ||
| CAT | |c 20150901 |l MUB01 |h 1447 | ||
| CAT | |c 20150921 |l MUB01 |h 1409 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20151203 |l MUB01 |h 1045 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20151226 |l MUB01 |h 0202 | ||
| CAT | |a VACOVAX |b 02 |c 20160225 |l MUB01 |h 1016 | ||
| CAT | |c 20171207 |l MUB01 |h 1421 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20180828 |l MUB01 |h 0911 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20181106 |l MUB01 |h 0731 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190105 |l MUB01 |h 1433 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190228 |l MUB01 |h 1419 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190605 |l MUB01 |h 1343 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190620 |l MUB01 |h 0746 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20191210 |l MUB01 |h 0849 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20191210 |l MUB01 |h 1210 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20191210 |l MUB01 |h 1218 | ||
| CAT | |c 20191220 |l MUB01 |h 1306 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20200123 |l MUB01 |h 1134 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20200123 |l MUB01 |h 1137 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20200323 |l MUB01 |h 1958 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20201030 |l MUB01 |h 1125 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20201030 |l MUB01 |h 1126 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20201112 |l MUB01 |h 0514 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20210217 |l MUB01 |h 2156 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20210525 |l MUB01 |h 1147 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20210525 |l MUB01 |h 1148 | ||
| CAT | |c 20210614 |l MUB01 |h 0954 | ||
| CAT | |c 20210614 |l MUB01 |h 1943 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20210724 |l MUB01 |h 1206 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20210724 |l MUB01 |h 1206 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20210819 |l MUB01 |h 1812 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20220324 |l MUB01 |h 2121 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20220811 |l MUB01 |h 2150 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20220929 |l MUB01 |h 2118 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20221004 |l MUB01 |h 0159 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20221220 |l MUB01 |h 0136 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20230228 |l MUB01 |h 0105 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20230331 |l MUB01 |h 2352 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20230331 |l MUB01 |h 2354 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20230331 |l MUB01 |h 2355 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20230730 |l MUB01 |h 2154 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20230910 |l MUB01 |h 2311 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20231013 |l MUB01 |h 0910 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20231110 |l MUB01 |h 0959 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20231212 |l MUB01 |h 0014 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20240313 |l MUB01 |h 0025 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20240415 |l MUB01 |h 0035 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20240519 |l MUB01 |h 0019 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20240613 |l MUB01 |h 2039 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20240701 |l MUB01 |h 2141 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20240729 |l MUB01 |h 2337 | ||
| LOW | |a POSLANO DO SKCR |b 2019-12-20 | ||
| 994 | - | 1 | |l MUB01 |l MUB01 |m VYSPR |1 KUK |a Knihovna univ. kampusu |2 SKLAD |b KUK - sklad |3 PřF-2011-K-8376 |5 3285003793 |8 20110825 |f 70 |f Prezenční |r 20110825 |s převod |
| AVA | |a MED50 |b KUK |c KUK - sklad |d PřF-2011-K-8376 |e available |t K dispozici |f 1 |g 0 |h N |i 0 |j SKLAD | ||