Characterization of the functional domains of the Trf4 protein

Trf4p je nekanonická poly(A)-polymerasa, která je katalytickou podjednotkou polyadenylačního komplexu zvaného TRAMP. Komplex TRAMP spolupracuje s nukleasovým komplexem exozom a hraje zásadní roli při kontrole kvality RNA v jádře kvasinek Saccharomyces cerevisiae. Katalytické jádro proteinu Trf4, kte...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Sárazová, Marie (Autor práce)
Další autoři: Vaňáčová, Štěpánka, 1972- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2011
Témata:
bílkoviny
komplex TRAMP
kontrola kvality RNA
nekanonická polyadenylace
TRF4
non-canonical polyadenylation
proteins
RNA quality control
TRAMP complex
diplomové práce
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/211964/prif_m/
Obálka
LEADER 07085ctm a22012257a 4500
001 MUB01000682432
003 CZ BrMU
005 20231128135824.0
008 110628s2011 xr ||||| |||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2019-12-20 
035 |a (ISMU-VSKP)187236 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 577.112  |2 MRF 
080 |a 577  |2 MRF 
100 1 |a Sárazová, Marie  |% UČO 211964  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
245 1 0 |a Characterization of the functional domains of the Trf4 protein  |h [rukopis] /  |c Marie Sárazová 
246 1 1 |a Charakterizace funkčních domén proteinu Trf4 
260 |c 2011 
300 |a 77 l. :  |b il. 
500 |a Vedoucí práce: Štěpánka Vaňáčová 
502 |a Diplomová práce (Mgr.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2011 
520 2 |a Trf4p je nekanonická poly(A)-polymerasa, která je katalytickou podjednotkou polyadenylačního komplexu zvaného TRAMP. Komplex TRAMP spolupracuje s nukleasovým komplexem exozom a hraje zásadní roli při kontrole kvality RNA v jádře kvasinek Saccharomyces cerevisiae. Katalytické jádro proteinu Trf4, které se skládá z katalytické a centrální domény, je poměrně dobře prozkoumané, avšak úloha N- a C-koncových částí proteinu je dosud neznámá. V první části práce je popsána systematická charakterizace koncových oblastí proteinu Trf4. Bylo vytvořeno několik zkrácených a bodově mutantních forem genu TRF4 a jejich funkce byla studována jak pomocí in vivo, tak in vitro přístupů. Předběžné výsledky naznačují, že katalytický mechanismus proteinu Trf4 je shodný se strukturně příbuznou poly(A)-polymerasou Pap1p. Druhá část práce je zaměřena na úlohu komplexu TRAMP při kontrole kvality zrání ribozomů. Prekurzory malé ribozomální podjednotky byly izolovány z kvasinek, ze kterých byly odstraněny obě možné  |% cze 
520 2 9 |a The Trf4p is a non-canonical poly(A) polymerase which is a catalytic subunit of the polyadenylation complex TRAMP. The TRAMP complex cooperates with the exosome nuclease complex, thus playing a fundamental role in surveillance over nuclear RNA species in yeast Saccharomyces cerevisiae. Although the catalytic core of the Trf4p, comprising of catalytic and central domains, has been well characterized to date, the function of the N- and C-terminal regions of the protein has essentialy been unknown. In the first part of this study, a systematic characterization of the Trf4p terminal regions is described. A set of truncation and point mutations was introduced into the TRF4 gene and was subsequently characterized by both in vivo and in vitro approaches. The preliminary results suggest that the mechanism of Trf4p catalytic action is similar to canonical poly(A) polymerase Pap1p. The second part of the study focuses on the role of the TRAMP complex in the quality control of ribosome maturation  |9 eng 
650 0 7 |a bílkoviny  |7 ph119082  |2 czenas 
650 0 7 |a komplex TRAMP  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a kontrola kvality RNA  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a nekanonická polyadenylace  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a TRF4  |2 CZ-BrMU 
650 0 9 |a non-canonical polyadenylation  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a proteins  |2 eczenas 
650 0 9 |a RNA quality control  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a TRAMP complex  |2 eCZ-BrMU 
655 7 |a diplomové práce  |7 fd132022  |2 czenas 
658 |a Biochemie  |b Biochemie  |c PřF N-BCH BIOCH (BIOCH)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Vaňáčová, Štěpánka,  |d 1972-  |7 mub2010613414  |% UČO 105562  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav biochemie  |7 ko2015866760  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/211964/prif_m/ 
CAT |c 20110628  |l MUB01  |h 0423 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20110909  |l MUB01  |h 1316 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20110923  |l MUB01  |h 1415 
CAT |a batch  |b 00  |c 20120324  |l MUB01  |h 0149 
CAT |c 20120610  |l MUB01  |h 2027 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20120612  |l MUB01  |h 1130 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20120718  |l MUB01  |h 1459 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20120903  |l MUB01  |h 1057 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20130304  |l MUB01  |h 1248 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20130304  |l MUB01  |h 1303 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20140401  |l MUB01  |h 1457 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140424  |l MUB01  |h 0832 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140430  |l MUB01  |h 1641 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140430  |l MUB01  |h 1646 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140507  |l MUB01  |h 0912 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140507  |l MUB01  |h 0924 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140507  |l MUB01  |h 0930 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140513  |l MUB01  |h 0800 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140513  |l MUB01  |h 0804 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20140829  |l MUB01  |h 1425 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140924  |l MUB01  |h 0737 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140924  |l MUB01  |h 0742 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141111  |l MUB01  |h 0805 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141111  |l MUB01  |h 0808 
CAT |c 20150703  |l MUB01  |h 1146 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1447 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1408 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0202 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20160802  |l MUB01  |h 0814 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20160802  |l MUB01  |h 0818 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20161212  |l MUB01  |h 1547 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170829  |l MUB01  |h 0007 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181107  |l MUB01  |h 1607 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181107  |l MUB01  |h 1614 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181107  |l MUB01  |h 1622 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 1815 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2020 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2033 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2141 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0147 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0151 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0208 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0734 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0739 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0742 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0745 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0749 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1138 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1142 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1155 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1436 
CAT |a VASICEK  |b 02  |c 20190527  |l MUB01  |h 1503 
CAT |c 20191220  |l MUB01  |h 1306 
CAT |a FUKSOVAX  |b 02  |c 20200924  |l MUB01  |h 1319 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 0954 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1943 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1206 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230314  |l MUB01  |h 2356 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20231128  |l MUB01  |h 1358 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240415  |l MUB01  |h 0911 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240604  |l MUB01  |h 2354 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240604  |l MUB01  |h 2359 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240605  |l MUB01  |h 0002 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2019-12-20 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-2011-K-8398  |5 3285003878  |8 20110909  |f 70  |f Prezenční  |r 20110909  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-2011-K-8398  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD 

Podobné jednotky