MALDI-MS profiling in biomarker discovery

Cílem této práce je návrh a optimalizace metody úpravy plasmy před MALDI-MS profilováním, které má umožnit včasnou a účinnou detekci nemocí, v tomto případě rakoviny pankreatu, díky rozdílům v profilu plasmy pacienta a kontroly. K dosažení tohoto cíle byly použity metody jako molekulární filtry, dep...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Široký, Ondřej (Autor práce)
Další autoři: Zdráhal, Zbyněk, 1965- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2011
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/211473/prif_m/
Obálka
LEADER 04969ctm a22008297a 4500
001 MUB01000682425
003 CZ BrMU
005 20160413093655.0
008 110628s2011 xr ||||| |||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2019-12-20 
035 |a (ISMU-VSKP)185715 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035 
072 7 |a 57  |x Obecná biologie  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 57.089  |2 MRF 
080 |a 616.37-006.4  |2 MRF 
080 |a 57  |2 MRF 
100 1 |a Široký, Ondřej  |% UČO 211473  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
242 1 0 |a Možnosti MALDI-MS profilování při vyhledávání biomarkerů  |y cze 
245 1 0 |a MALDI-MS profiling in biomarker discovery  |h [rukopis]  |c Ondřej Široký 
260 |c 2011 
300 |a 83 l. :  |b il. 
500 |a Vedoucí práce: Zbyněk Zdráhal 
502 |a Diplomová práce (Mgr.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2011 
520 2 |a Cílem této práce je návrh a optimalizace metody úpravy plasmy před MALDI-MS profilováním, které má umožnit včasnou a účinnou detekci nemocí, v tomto případě rakoviny pankreatu, díky rozdílům v profilu plasmy pacienta a kontroly. K dosažení tohoto cíle byly použity metody jako molekulární filtry, deplece abundantních proteinů plasmy, různé afinitní chromatografie, digesce plasmatických proteinů, etc. a jejich kombinace. Dále se na vybrané skupině kontrol a pacientů testovaly kandidátní metody přípravy plasmy, které byly považovány za schopné odlišit profil plasmy pacienta a kontroly. Specifita případného nalezeného biomarkeru je klíčová, neboť některé biomarkery mohou indikovat více onemocnění, nebo například i obyčejnou infekci.  |% cze 
520 2 9 |a The purpose of this work is to find a suitable procedure of plasma preparation for a MALDI-MS profiling experiment that would enable a cost efficient and early detection of biomarkers for a specific disease, in this case pancreatic cancer. Various plasma preparation techniques such as molecular cut-offs, depletion of most abundant proteins, protein purification kits, proteolytic digestion, etc. have been used in the search for the best preparation technique enabling to distinguish between patient and control. In multiple samples of pacients and controls candidate methods were applied that should deliver differential MS plasma profiles that indicate the presence of pancreatic cancer or should be able to deny it. Specificity of the possible marker is of key importance since some might be matched with multiple diseases or indicate only a nonspecific, common inflammation.  |9 eng 
650 0 7 |a biologické markery  |7 ph138913  |2 czenas 
650 0 7 |a MALDI-TOF MS  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a plazmové profilování  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a rakovina pankreatu  |7 ph258285  |2 czenas 
650 0 9 |a biological markers  |2 eczenas 
650 0 9 |a biomarker discovery  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a early detection  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a magnetic beads  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a pancreatic cancer  |2 eczenas 
650 0 9 |a plasma profiling  |2 eCZ-BrMU 
655 7 |a diplomové práce  |7 fd132022  |2 czenas 
655 9 |a master's theses  |2 eczenas 
658 |a Biochemie  |b Biochemie  |c PřF N-BCH BIOCH (BIOCH)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Zdráhal, Zbyněk,  |d 1965-  |7 xx0074482  |% UČO 34759  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav experimentální biologie  |7 mzk2008412438  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/211473/prif_m/ 
CAT |c 20110628  |l MUB01  |h 0423 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20110824  |l MUB01  |h 0900 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20110923  |l MUB01  |h 1420 
CAT |a batch  |b 00  |c 20120324  |l MUB01  |h 0149 
CAT |c 20120610  |l MUB01  |h 2027 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20120919  |l MUB01  |h 0931 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20130304  |l MUB01  |h 1248 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140115  |l MUB01  |h 1257 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140514  |l MUB01  |h 0902 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140514  |l MUB01  |h 1228 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20140616  |l MUB01  |h 1503 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20140829  |l MUB01  |h 1432 
CAT |c 20150703  |l MUB01  |h 1146 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20150803  |l MUB01  |h 1743 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1447 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1408 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20151006  |l MUB01  |h 1034 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0202 
CAT |a VACOVAX  |b 02  |c 20160413  |l MUB01  |h 0936 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20160906  |l MUB01  |h 1539 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170814  |l MUB01  |h 1733 
CAT |c 20171207  |l MUB01  |h 1421 
CAT |c 20191220  |l MUB01  |h 1306 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 0954 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1943 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1206 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1206 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2019-12-20 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-2011-K-8374  |5 3285003791  |8 20110824  |f 70  |f Prezenční  |r 20110824  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-2011-K-8374  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD