Information Content Analysis in Automated Fluorescence Microscopy

Tématem dizertační práce je automatizovaná fluorescenční mikroskopie. Práce se zabývá zejména algoritmy pro automatickou analýzu informace obsažené v obraze. Tento koncept zavádíme jakožto zobecnění tradičních postupů automatizovaného ostření. Zmíněné algoritmy slouží pro automatický výběr oblastí a...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Brázdilová, Silvie Luisa, 1978- (Autor práce)
Další autoři: Kozubek, Michal, 1974- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2011
Témata:
algoritmy (programování)
fluorescenční mikroskopie
zpracování obrazu
algorithms
fluorescence microscopy
image processing
disertace
dissertations
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/4123/fi_d/
Obálka
LEADER 05967ctm a22009257a 4500
001 MUB01000669606
003 CZ BrMU
005 20240510135322.0
008 110211s2011 xr ||||| |||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2019-10-21 
035 |a (ISMU-VSKP)89463 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD018 
072 7 |a 004.4/.6  |x Programování. Software  |2 Konspekt  |9 23 
072 7 |a 57  |x Obecná biologie  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 57.086.2:535.37  |2 MRF 
080 |a (043.3)  |2 MRF 
080 |a 57  |2 MRF 
080 |a 004.421  |2 MRF 
080 |a 621.397  |2 MRF 
100 1 |a Brázdilová, Silvie Luisa,  |d 1978-  |7 mub2011649484  |% UČO 4123  |4 dis 
242 1 0 |a Information Content Analysis in Automated Fluorescence Microscopy  |y eng 
245 1 0 |a Information Content Analysis in Automated Fluorescence Microscopy  |h [rukopis] /  |c Silvie Luisa Brázdilová 
260 |c 2011 
300 |a vi, 99 l. :  |b il. 
500 |a Vedoucí práce: Michal Kozubek 
502 |a Dizertace (Ph.D.)--Masarykova univerzita, Fakulta informatiky, 2010 
520 2 |a Tématem dizertační práce je automatizovaná fluorescenční mikroskopie. Práce se zabývá zejména algoritmy pro automatickou analýzu informace obsažené v obraze. Tento koncept zavádíme jakožto zobecnění tradičních postupů automatizovaného ostření. Zmíněné algoritmy slouží pro automatický výběr oblastí a následné snímání obrazů s vysokou informační hodnotou (tedy takových, které obsahují zajímavé objekty), v našem případě ve fluorescenčním režimu. Důraz je kladen na přesnost a spolehlivost. S ohledem na fenomén známý jako „photobleaching“ je i rychlost algoritmu klíčová. Klasické metody se obtížně vyrovnávají zejména s existencí více rovin s vysokou hodnotou obrazové informace (rovin ostrosti), v nichž by měl být obraz snímán. To je způsobeno značnou tloušťkou vzorku či prostě jen tím, že všechny objekty neleží ve stejné rovině. Pro konvenční režim (ve srovnání s konfokálním režimem) dokonce ani neznáme vhodnou funkci pro ohodnocení informace obsažené v obraze, bez ohledu na počet rovin s vysokou hodnotou obrazové informace. Celkově vzato, žádný z klasických přístupů neposkytuje uspokojivé výsledky.  |% cze 
520 2 9 |a This thesis deals with automated fluorescence microscopy, in particular with automatic content analysis algorithms, which is a concept that we introduced as a generalization of the well-established autofocusing procedure. The aim of such algorithms is to enable automatic selection of regions of interest to be acquired and subsequent acquisition of images with high information content (i.e. containing objects of interest), in our case in fluorescence mode. The emphasis is on accuracy and reliability. Speed is also a critical factor due to the common phenomenon of sample photobleaching. The main challenge to the state of the art methods is the existence of more planes (more focus positions) with high information content to be acquired, which is the consequence of specimen thickness or simply of the fact that all the imaged objects do not lie in one plane. For the wide-field mode (as compared to the confocal mode) there is even a lack of a suitable function that would measure the image content, regardless of the number of planes with high content.  |9 eng 
650 0 7 |a algoritmy (programování)  |7 ph131788  |2 czenas 
650 0 7 |a fluorescenční mikroskopie  |7 ph471369  |2 czenas 
650 0 7 |a zpracování obrazu  |7 ph210245  |2 czenas 
650 0 9 |a algorithms  |2 eczenas 
650 0 9 |a fluorescence microscopy  |2 eczenas 
650 0 9 |a image processing  |2 eczenas 
655 7 |a disertace  |7 fd132024  |2 czenas 
655 9 |a dissertations  |2 eczenas 
658 |a Informatika (čtyřleté)  |b Informatika  |c FI D-IN4 IN (IN)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Kozubek, Michal,  |d 1974-  |7 ola2003204934  |% UČO 3740  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Katedra počítačové grafiky a designu  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/4123/fi_d/ 
CAT |c 20110211  |l MUB01  |h 0427 
CAT |a KOZOVAX  |b 02  |c 20110216  |l MUB01  |h 1525 
CAT |c 20110627  |l MUB01  |h 1920 
CAT |c 20110627  |l MUB01  |h 2330 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20110714  |l MUB01  |h 0832 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20110817  |l MUB01  |h 1324 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20110905  |l MUB01  |h 1401 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20110906  |l MUB01  |h 0936 
CAT |a KOZOVA  |b 02  |c 20111129  |l MUB01  |h 1119 
CAT |a KOZOVA  |b 02  |c 20111129  |l MUB01  |h 1120 
CAT |a KOZOVA  |b 02  |c 20111129  |l MUB01  |h 1134 
CAT |a batch  |b 00  |c 20120324  |l MUB01  |h 0145 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20120417  |l MUB01  |h 0803 
CAT |c 20120610  |l MUB01  |h 2021 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20120831  |l MUB01  |h 1008 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20130304  |l MUB01  |h 1212 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20130530  |l MUB01  |h 0740 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20130822  |l MUB01  |h 1101 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20141006  |l MUB01  |h 1341 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1446 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1407 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20151209  |l MUB01  |h 0834 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0146 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20160218  |l MUB01  |h 0731 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20160315  |l MUB01  |h 0658 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20160913  |l MUB01  |h 1500 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20161116  |l MUB01  |h 1303 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20170329  |l MUB01  |h 0745 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180130  |l MUB01  |h 0802 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180411  |l MUB01  |h 0813 
CAT |c 20191021  |l MUB01  |h 1114 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 0952 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1941 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1203 
CAT |a VESELAX  |b 02  |c 20240510  |l MUB01  |h 1352 
CAT |a VESELAX  |b 02  |c 20240510  |l MUB01  |h 1353 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2019-10-21 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 FI  |a Fakulta informatiky  |3 Diz. práce 2010  |5 42005D2605  |8 20111129  |f 72  |f Týdenní  |r 20111129 
AVA |a INF50  |b FI  |d Diz. práce 2010  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0 

Podobné jednotky