Torsion Angle Dependence of 31 P NMR Parameters in a Nucleic Acid Backbone Studied by Density Functional Theory

Tato práce se zabývá studiem vztahů mezi parametry nukleární magnetické rezonance (NMR) pro isotop P-31 a konformací páteře nukleových kyselin pomocí teorie funkcionálu hustoty (density functional theory, DFT). Studium bylo inspirováno nedostatkem experimentálních NMR dat, které mohou být použity ja...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Pavlíková Přecechtělová, Jana, 1980- (Autor práce)
Další autoři: Sklenář, Vladimír, 1951-2024 (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2010
Témata:
DNA (nukleová kyselina)
molekuly
nukleární magnetická rezonance
deoxyribonucleic acid
molecules
nuclear magnetic resonance
disertace
CD-ROM
dissertations
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/14825/prif_d/
Obálka
LEADER 07531ctm a22013097a 4500
001 MUB01000666984
003 CZ BrMU
005 20240726103727.0
008 110113s2010 xr |||||q|||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2019-10-21 
035 |a (ISMU-VSKP)80781 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035 
072 7 |a 544  |x Fyzikální chemie  |2 Konspekt  |9 10 
080 |a 537.635.082.79  |2 MRF 
080 |a 544.112-122  |2 MRF 
080 |a 577.113.8  |2 MRF 
080 |a (043.3)  |2 MRF 
080 |a 544  |2 MRF 
100 1 |a Pavlíková Přecechtělová, Jana,  |d 1980-  |7 xx0213539  |% UČO 14825  |4 dis 
245 1 0 |a Torsion Angle Dependence of 31 P NMR Parameters in a Nucleic Acid Backbone Studied by Density Functional Theory  |h [elektronický zdroj] /  |c Jana Přecechtělová 
260 |c 2010 
300 |a 1 CD-ROM 
500 |a Vedoucí práce: Vladimír Sklenář 
502 |a Dizertace (Ph.D.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2010 
520 2 |a Tato práce se zabývá studiem vztahů mezi parametry nukleární magnetické rezonance (NMR) pro isotop P-31 a konformací páteře nukleových kyselin pomocí teorie funkcionálu hustoty (density functional theory, DFT). Studium bylo inspirováno nedostatkem experimentálních NMR dat, které mohou být použity jako okrajové podmínky při určování struktur nukleových kyselin. Přestože NMR experimenty prokázaly potenciál chemických posunů P-31 poskytnout strukturní informace, praktické použití NMR parametrů P-31 není ve strukturních studiích příliš časté. Konformaci páteře nukleových kyselin určuje šest torzních úhlů, jejichž vliv na chemické stínění fosforu nebyl dosud analyzován. Pro studium závislosti NMR parametrů P-31 na torzních úhlech alpha a zeta, které určují konformaci okolo P-O vazeb ve fosfátových skupinách nukleových kyselin, byly použity statické DFT výpočty v kombinaci s molekulovou dynamikou (MD). Fitováním statisticky zpracovaných MD/DFT dat byly získány jednoduché funkce, které pop ...  |% cze 
520 2 9 |a This thesis focuses on the study of the relationships between P-31 nuclear magnetic resonance (NMR) parameters and the conformation of a nucleic acid backbone using density functional theory (DFT) based methods. The work has been inspired by the lack of experimental NMR restraints that can be applied in the nucleic acid structure determination. Although NMR experiments revealed the potential of P-31 chemical shifts to provide structural information, the practical use of P-31 NMR parameters in structural studies is rare. The conformation of a nucleic acid backbone is defined by six torsion angles, the influence of which on the chemical shielding has not been analyzed so far. The dependence of P-31 NMR parameters on backbone torsion angles alpha and zeta, which define the conformation around P-O bonds of the phosphate groups in nucleic acids, has been studied via static DFT calculations combined with molecular dynamics (MD). By means of fitting the statistically analyzed MD/DFT data, si ...  |9 eng 
650 0 7 |a DNA (nukleová kyselina)  |7 ph116977  |2 czenas 
650 0 7 |a molekuly  |7 ph122950  |2 czenas 
650 0 7 |a nukleární magnetická rezonance  |7 ph123365  |2 czenas 
650 0 9 |a deoxyribonucleic acid  |2 eczenas 
650 0 9 |a molecules  |2 eczenas 
650 0 9 |a nuclear magnetic resonance  |2 eczenas 
655 7 |a disertace  |7 fd132024  |2 czenas 
655 7 |a CD-ROM  |7 fd133955  |2 czenas 
655 9 |a dissertations  |2 eczenas 
658 |a Chemie (čtyřleté)  |b Fyzikální chemie  |c PřF D-CH4 FCHE (FCHE)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Sklenář, Vladimír,  |d 1951-2024  |7 ola2003204812  |% UČO 2611  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Národní centrum pro výzkum biomolekul  |7 kn20100614011  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/14825/prif_d/ 
CAT |a VARTECKA  |b 02  |c 20110113  |l MUB01  |h 1306 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20110211  |l MUB01  |h 1200 
CAT |c 20110627  |l MUB01  |h 1920 
CAT |c 20110627  |l MUB01  |h 2330 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20111013  |l MUB01  |h 0943 
CAT |a batch  |b 00  |c 20120324  |l MUB01  |h 0145 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20120605  |l MUB01  |h 1047 
CAT |c 20120610  |l MUB01  |h 2020 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20130304  |l MUB01  |h 1203 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20130521  |l MUB01  |h 1343 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20130523  |l MUB01  |h 1251 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140416  |l MUB01  |h 0651 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140428  |l MUB01  |h 1349 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141104  |l MUB01  |h 1319 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20150107  |l MUB01  |h 1126 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1446 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1407 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20151203  |l MUB01  |h 1045 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0143 
CAT |a VACOVAX  |b 02  |c 20160404  |l MUB01  |h 1100 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170301  |l MUB01  |h 1243 
CAT |c 20171207  |l MUB01  |h 1421 
CAT |a REPISOVA  |b 02  |c 20171213  |l MUB01  |h 1605 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180828  |l MUB01  |h 0911 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181106  |l MUB01  |h 0731 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 1433 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190228  |l MUB01  |h 1419 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190605  |l MUB01  |h 1342 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190620  |l MUB01  |h 0746 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20190925  |l MUB01  |h 1641 
CAT |c 20191021  |l MUB01  |h 1113 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 0848 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1210 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1218 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200123  |l MUB01  |h 1133 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200123  |l MUB01  |h 1137 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200323  |l MUB01  |h 1958 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 1125 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 1126 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201112  |l MUB01  |h 0514 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210217  |l MUB01  |h 2156 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210525  |l MUB01  |h 1147 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210525  |l MUB01  |h 1148 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 0951 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1940 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1203 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210819  |l MUB01  |h 1812 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220324  |l MUB01  |h 2121 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220811  |l MUB01  |h 2150 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220929  |l MUB01  |h 2118 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221004  |l MUB01  |h 0159 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221220  |l MUB01  |h 0136 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230228  |l MUB01  |h 0105 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2352 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2354 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2355 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230730  |l MUB01  |h 2154 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230910  |l MUB01  |h 2311 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231013  |l MUB01  |h 0910 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231110  |l MUB01  |h 0959 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231212  |l MUB01  |h 0014 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240313  |l MUB01  |h 0025 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240415  |l MUB01  |h 0035 
CAT |a BATCH-UPD  |b 02  |c 20240418  |l MUB01  |h 2351 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240519  |l MUB01  |h 0019 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240613  |l MUB01  |h 2039 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240701  |l MUB01  |h 2141 
CAT |a VACOVAX  |b 02  |c 20240726  |l MUB01  |h 1037 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240729  |l MUB01  |h 2337 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2019-10-21 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m CDROM  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 VV  |b KUK - volný výběr  |3 544-PŘEC  |5 3285003546  |7 CD-ROM si vyžádejte u knihovníka u výpůjčního pultu  |8 20110113  |f 70  |f Prezenční  |r 20110113  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - volný výběr  |d 544-PŘEC  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j VV 

Podobné jednotky