Strukturní vlastnosti biologicky významných kvadruplexů

Studovali jsme biologicky významné fragmenty nukleových kyselin, které díky své neobvyklé nukleotidové sekvenci mohou vytvářet kvadruplexová uspořádání. Studiem série vhodně vybraných oligonukleotidů jsme ukázali, že vrstvení guaninů, jak u paralelního G-kvadruplexu (dále jen kvadruplexu) dG4, tak i...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Fialová, Markéta (Autor práce)
Další autoři: Vorlíčková, Michaela, 1945- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Čeština
Vydáno: 2010
Témata:
biofyzika
biophysics
disertace
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/23709/prif_d/
Obálka
LEADER 05072ntm a22007217a 4500
001 MUB01000665206
003 CZ BrMU
005 20110104152159.0
008 101217s2010 xr |||||q|||||||||||cze d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2019-10-21 
040 |a BOD004  |b cze 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 577.3  |2 MRF 
080 |a 577  |2 MRF 
100 1 |a Fialová, Markéta  |7 xx0118183  |% UČO 23709  |4 dis 
242 1 0 |a Structural properties of biologicaly important quadruplexes  |y eng 
245 1 0 |a Strukturní vlastnosti biologicky významných kvadruplexů  |h [elektronický zdroj] /  |c Markéta Fialová 
260 |c 2010 
300 |a 1 CD-ROM 
500 |a Vedoucí práce: Michaela Vorlíčková 
502 |a Dizertace (Ph.D.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2010 
520 2 |a Studovali jsme biologicky významné fragmenty nukleových kyselin, které díky své neobvyklé nukleotidové sekvenci mohou vytvářet kvadruplexová uspořádání. Studiem série vhodně vybraných oligonukleotidů jsme ukázali, že vrstvení guaninů, jak u paralelního G-kvadruplexu (dále jen kvadruplexu) dG4, tak i u duplexu d(C4G4) v B-DNA i A-DNA uspořádání je velmi podobné. Tato strukturní neměnnost mohla mít význam v evoluci přenosu genetické informace a v základních funkcích nukleových kyselin, jako je například zahájení transkripce, rekombinace a další. (Kypr and Fialova, 2001) Věnovali jsme se studiu konformačních vlastností aptameru, který se specificky váže k thrombinu a inhibuje tím jeho aktivitu. Literární data uvádějí, že thrombinový aptamer se skládá do kompaktního antiparalelního intramolekulárního kvadruplexu. Pozorovali jsme, že thrombinový aptamer tvoří antiparalelní kvadruplex již v roztoku s nízkou iontovou silou. Přítomnost draselných iontů nebo etanolu kvadruplex stabilizuje, na  |% cze 
520 2 9 |a We have studied biologically important fragments of nucleic acids that can form quadruplexes due to their unusual primary structure. Using a series of suitably selected oligonucleotides we have shown that the arrangements of guanines in the parallel G-quadruplex of dG4, and in the duplex of d(C4G4) in its both, B-DNA and A-DNA forms are very similar. This structural invariance might be important in evolution of genetic information and in the basic functions of nucleic acids, as e.g. in transcription. (Kypr and Fialova, 2001) We have studied conformational properties of an aptamer d(GGTTGGTGTGGTTGG), which specifically binds to thrombin and inhibits its activity. It has been shown in literature that the aptamer folds into a compact intramolecular anti-parallel quadruplex. We have, however, found that the aptamer forms a bimolecular quadruplex in an aqueous solution. The quadruplex is stable even in low salt solutions and it is stabilized by potassium ions or alcohol. In contrast, the  |9 eng 
650 0 7 |a biofyzika  |7 ph114152  |2 czenas 
650 0 9 |a biophysics  |2 eczenas 
655 7 |a disertace  |7 fd132024  |2 czenas 
658 |a Fyzika (čtyřleté)  |b Biofyzika  |c PřF D-FY4 BF (BF)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Vorlíčková, Michaela,  |d 1945-  |7 jk01150711  |% UČO 71514  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Přírodovědecká fakulta.  |b Fyzikální sekce  |7 kn20020321517  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/23709/prif_d/ 
CAT |a DRIMLOVA  |b 02  |c 20101217  |l MUB01  |h 0912 
CAT |a NOVAKOVA  |b 02  |c 20110104  |l MUB01  |h 1521 
CAT |a batch  |b 00  |c 20120324  |l MUB01  |h 0144 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20120510  |l MUB01  |h 0733 
CAT |c 20120610  |l MUB01  |h 2019 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20120726  |l MUB01  |h 1016 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20120910  |l MUB01  |h 1408 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20130304  |l MUB01  |h 1158 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20130730  |l MUB01  |h 0745 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20141006  |l MUB01  |h 1348 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1446 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1407 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0140 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20160314  |l MUB01  |h 1206 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180826  |l MUB01  |h 1454 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180826  |l MUB01  |h 1504 
CAT |c 20181017  |l MUB01  |h 1803 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190109  |l MUB01  |h 1226 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190129  |l MUB01  |h 0937 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190129  |l MUB01  |h 0941 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190129  |l MUB01  |h 0952 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190227  |l MUB01  |h 0752 
CAT |c 20191021  |l MUB01  |h 1112 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 0223 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 0951 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1940 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1202 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210819  |l MUB01  |h 1726 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230808  |l MUB01  |h 2127 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2019-10-21 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m CDROM  |1 PRIF  |a Přírodovědecká fakulta  |2 PRFST  |b ÚK volný výběr  |3 K-F-2010-FIAL  |5 3145350316  |8 20101217  |f 70  |f Prezenční  |q 20180718  |r 20101217  |s dar 
AVA |a SCI50  |b PRIF  |c ÚK volný výběr  |d K-F-2010-FIAL  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j PRFST 

Podobné jednotky