Příprava proteinových vzorků z rostlinného materiálu pro LC-MS analýzu
Předložená práce je zaměřena na hodnocení faktorů ovlivňujících kvalitu proteinového vzorku získaného z rostlinného materiálu a optimalizaci postupů přípravy vzorku pro LC-MS/MS analýzu. Jako modelový organismus byla použita rostlina Arabidopsis thaliana. Rostliny, jakožto složitý mnohobuněčný organ...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2010
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/175819/prif_m/ |
| LEADER | 05604ctm a22009137a 4500 | ||
|---|---|---|---|
| 001 | MUB01000646092 | ||
| 003 | CZ BrMU | ||
| 005 | 20201016103902.0 | ||
| 008 | 100701s2010 xr ||||| |||||||||||cze d | ||
| STA | |a POSLANO DO SKCR |b 2019-05-27 | ||
| 035 | |a (ISMU-VSKP)169972 | ||
| 040 | |a BOD114 |b cze |d BOD035 | ||
| 072 | 7 | |a 577 |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika |2 Konspekt |9 2 | |
| 080 | |a 577.1:581.1 |2 MRF | ||
| 080 | |a 582.683.2 |2 MRF | ||
| 080 | |a 577.112.01:575.111 |2 MRF | ||
| 080 | |a 543.51 |2 MRF | ||
| 080 | |a (043)378.2 |2 MRF | ||
| 080 | |a 577 |2 MRF | ||
| 100 | 1 | |a Stejskal, Karel |7 xx0142105 |% UČO 175819 |4 dis | |
| 242 | 1 | 0 | |a Preparation of plant protein samples for LC-MS/MS analysis |y eng |
| 245 | 1 | 0 | |a Příprava proteinových vzorků z rostlinného materiálu pro LC-MS analýzu |h [rukopis] / |c Karel Stejskal |
| 260 | |c 2010 | ||
| 300 | |a 77 l. | ||
| 500 | |a Vedoucí práce: Zbyněk Zdráhal | ||
| 502 | |a Diplomová práce (Mgr.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2010 | ||
| 520 | 2 | |a Předložená práce je zaměřena na hodnocení faktorů ovlivňujících kvalitu proteinového vzorku získaného z rostlinného materiálu a optimalizaci postupů přípravy vzorku pro LC-MS/MS analýzu. Jako modelový organismus byla použita rostlina Arabidopsis thaliana. Rostliny, jakožto složitý mnohobuněčný organizmus, obsahují mnoho látek proteinové i neproteinové povahy, které mohou negativně ovlivnit výsledek přípravy proteinového vzorku, jeho analýzy a následně i výsledky celého experimentu. V práci byly srovnány vybrané postupy izolace proteinů z rostliny. Následně byly optimaliozovány tři varianty postupů přípravy proteinového peletu v kombinaci s LC-MS/MS analýzou. Kombinací všech tří postupů bylo identifikováno 524 proteinů. Na základě znalosti pI identifikovaných proteinů bylo zjištěno, že 12 % proteinů (pI > 10) by nebylo možné separovat a následně identifikovat ve vzorku pomocí klasické dvou-rozměrné gelové elektroforézy. |% cze | |
| 520 | 2 | 9 | |a The diploma thesis is focused on evaluation of factors influencing quality of protein sample isolated from plants and optimalization of sample preparation protocols prior LC-MS/MS analysis. Arabidopsis thaliana was employed as a model. Generally, plants contains plenty of protein and non-protein components, which could complicate preparation of protein isolate and have a negative influence on analysis and final results of the whole experiment. Here, selected isolation procedures were compared. Subsequently, three sample preparation protocols combined with LC-MS/MS analysis were optimalized. Total number of 524 proteins was identified by combination of all three tested sample preparation procedures employing LC-MS/MS analysis in TCA/acetone isolates. Based on pI knowledge of identified proteins we can conclude that about 12 % of proteins (pI > 10) could not be separated and subsequently detected by classical two-dimensional gel electrophoresis. |9 eng |
| 650 | 0 | 7 | |a biochemie rostlin |7 ph333390 |2 czenas |
| 650 | 0 | 7 | |a hmotnostní spektrometrie |7 ph120763 |2 czenas |
| 650 | 0 | 7 | |a huseníček rolní |7 ph116928 |2 czenas |
| 650 | 0 | 7 | |a proteomika |7 ph347581 |2 czenas |
| 650 | 0 | 9 | |a Arabidopsis thaliana |2 eczenas |
| 650 | 0 | 9 | |a mass spectrometry |2 eczenas |
| 650 | 0 | 9 | |a mass spectroscopy |2 eczenas |
| 650 | 0 | 9 | |a plant biochemistry |2 eczenas |
| 650 | 0 | 9 | |a proteomics |2 eczenas |
| 655 | 7 | |a diplomové práce |7 fd132022 |2 czenas | |
| 655 | 9 | |a master's theses |2 eczenas | |
| 658 | |a Biochemie |b Analytická biochemie |c PřF N-BCH ANBI (ANBI) |2 CZ-BrMU | ||
| 700 | 1 | |a Zdráhal, Zbyněk, |d 1965- |7 xx0074482 |% UČO 34759 |4 ths | |
| 710 | 2 | |a Masarykova univerzita. |b Ústav experimentální biologie |7 mzk2008412438 |4 dgg | |
| 856 | 4 | 1 | |u http://is.muni.cz/th/175819/prif_m/ |
| CAT | |c 20100702 |l MUB01 |h 1037 | ||
| CAT | |a VARTECKA |b 02 |c 20100930 |l MUB01 |h 0936 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20110119 |l MUB01 |h 1134 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20110119 |l MUB01 |h 1139 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20110119 |l MUB01 |h 1143 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20110120 |l MUB01 |h 1005 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20110120 |l MUB01 |h 1007 | ||
| CAT | |c 20110627 |l MUB01 |h 1918 | ||
| CAT | |c 20110627 |l MUB01 |h 2328 | ||
| CAT | |a batch |b 00 |c 20120324 |l MUB01 |h 0139 | ||
| CAT | |c 20120610 |l MUB01 |h 2009 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20120919 |l MUB01 |h 0930 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20130304 |l MUB01 |h 1109 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20140115 |l MUB01 |h 1257 | ||
| CAT | |c 20140127 |l MUB01 |h 1905 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20140514 |l MUB01 |h 0902 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20140514 |l MUB01 |h 1228 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20140616 |l MUB01 |h 1503 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20140829 |l MUB01 |h 1432 | ||
| CAT | |c 20150703 |l MUB01 |h 1127 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20150803 |l MUB01 |h 1743 | ||
| CAT | |c 20150901 |l MUB01 |h 1445 | ||
| CAT | |c 20150921 |l MUB01 |h 1406 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20151006 |l MUB01 |h 1034 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20151226 |l MUB01 |h 0116 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20160906 |l MUB01 |h 1539 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20170814 |l MUB01 |h 1733 | ||
| CAT | |c 20190527 |l MUB01 |h 1024 | ||
| CAT | |a PTICHAX |b 02 |c 20201016 |l MUB01 |h 1039 | ||
| CAT | |c 20210614 |l MUB01 |h 0947 | ||
| CAT | |c 20210614 |l MUB01 |h 1937 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20210724 |l MUB01 |h 1158 | ||
| LOW | |a POSLANO DO SKCR |b 2019-05-27 | ||
| 994 | - | 1 | |l MUB01 |l MUB01 |m VYSPR |1 KUK |a Knihovna univ. kampusu |2 SKLAD |b KUK - sklad |3 PřF-2010-K-7799 |5 3285003265 |8 20100930 |f 71 |f Prezenční SKLAD |r 20100930 |s převod |
| AVA | |a MED50 |b KUK |c KUK - sklad |d PřF-2010-K-7799 |e available |t K dispozici |f 1 |g 0 |h N |i 0 |j SKLAD | ||