Charakterizace PCNA zprostředkovaných interakcí při opravě dvouřetězcových zlomů v DNA

Kľúčovým procesom pri eliminácii DSBs je homológna rekombinácia. Tento proces vyžaduje prítomnosť mnohých faktorov, medzi ktoré patrí aj PCNA, ktorý plní úlohu procesivitného faktora eukaryotických polymeráz a zúčastňuje sa tak syntézy chýbajúceho úseku poškodenej molekuly DNA. Nakoľko in silico ana...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Sisáková, Alexandra (Autor práce)
Další autoři: Krejčí, Lumír, 1972- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Slovenština
Vydáno: 2010
Témata:
antigeny
DNA (nukleová kyselina)
geny
antigens
deoxyribonucleic acid
genes
diplomové práce
master's theses
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/184535/prif_m/
Obálka
LEADER 05345ctm a22008057a 4500
001 MUB01000645958
003 CZ BrMU
005 20110323150402.0
008 100701s2010 xr ||||| |||||||||||slo d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2019-05-27 
035 |a (ISMU-VSKP)165703 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD004 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 577.21  |2 MRF 
080 |a 575.113  |2 MRF 
080 |a 616-097  |2 MRF 
080 |a 577  |2 MRF 
100 1 |a Sisáková, Alexandra  |% UČO 184535  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
242 1 0 |a Characterization of PCNA mediate interactions in the DNA double-strand break repair  |y eng 
245 1 0 |a Charakterizace PCNA zprostředkovaných interakcí při opravě dvouřetězcových zlomů v DNA  |h [rukopis] /  |c Alexandra Sisáková 
260 |c 2010 
300 |a 76 l. 
500 |a Vedoucí práce: Lumír Krejčí 
502 |a Diplomová práce (Mgr.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2010 
520 2 |a Kľúčovým procesom pri eliminácii DSBs je homológna rekombinácia. Tento proces vyžaduje prítomnosť mnohých faktorov, medzi ktoré patrí aj PCNA, ktorý plní úlohu procesivitného faktora eukaryotických polymeráz a zúčastňuje sa tak syntézy chýbajúceho úseku poškodenej molekuly DNA. Nakoľko in silico analýzou bol zistený interakčný motív (PIP-box) pre PCNA u Rad54p ako aj komplexu Mus81/Mms4, faktorov, ktoré sa zúčastňujú opravy DSBs v HR, cieľom tejto diplomovej práce bolo potvrdiť tieto tieto interakcie ako aj porozumieť ich biologickému významu. Interakcia PCNA s Rad54 aj Mus81/Mms4 bola in vivo a tiez in vitro potvrdená. V prípade Rad54p bola dokázaná experimentami s mutantnou formou Rad54-AA nevyhnutnosť PIP-box motívu pre väzbu s PCNA a takisto bolo zistené, že PCNA má pre interakciu s Rad54p pravdepodobne viac väzbových motívov. Nakoľko sa ukázalo, že je Rad54p-AA ATP-ázovo deficientý, nebolo možné popísať biologický význam tejto interakcie. Za týmto účelom bol generovaný mutant Ra  |% cze 
520 2 9 |a The most toxic forms of DNA damage are DSBs, which once left unrepaired, can kill the cell. During evolution several pathways appeared to cope with this problem: the non-homologous end joining, homologous recombination (HR) and single strand annealing. Homologous recombination (HR) plays a key role in the elimination of DSBs. In our laboratory we are trying to understand the molecular mechanism of this pathway. In my diploma thesis we focused on PCNA mediated interactions involved in HR. By in silico analysis we found an interaction motif in the sequence of Rad54p and Mus81p, which are factors involved in the DSBs repair pathway. This led us to study these interactions more in detail. We comfirmed the interaction between PCNA and Rad54p as well as between PCNA and Mus81/Mms4 by in vitro and in vivo techniques. We also showed that these interactions are mediated by PIP-box motif in Rad54p and Mus81p. In the case of PCNA-Rad54p interaction we were not able to find out the biological fu  |9 eng 
650 0 7 |a antigeny  |7 ph134713  |2 czenas 
650 0 7 |a DNA (nukleová kyselina)  |7 ph116977  |2 czenas 
650 0 7 |a geny  |7 ph120499  |2 czenas 
650 0 9 |a antigens  |2 eczenas 
650 0 9 |a deoxyribonucleic acid  |2 eczenas 
650 0 9 |a genes  |2 eczenas 
655 7 |a diplomové práce  |7 fd132022  |2 czenas 
655 9 |a master's theses  |2 eczenas 
658 |a Biologie  |b Molekulární biologie a genetika  |c PřF N-BI BIMG (BIMG)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Krejčí, Lumír,  |d 1972-  |7 xx0125663  |% UČO 18098  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav experimentální biologie  |7 mzk2008412438  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/184535/prif_m/ 
CAT |c 20100702  |l MUB01  |h 1037 
CAT |a ANTLOVA  |b 02  |c 20100803  |l MUB01  |h 1003 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20110223  |l MUB01  |h 0824 
CAT |a JANA  |b 02  |c 20110323  |l MUB01  |h 1504 
CAT |c 20110627  |l MUB01  |h 1918 
CAT |c 20110627  |l MUB01  |h 2327 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20110817  |l MUB01  |h 1521 
CAT |a batch  |b 00  |c 20120324  |l MUB01  |h 0139 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20120410  |l MUB01  |h 1643 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20120412  |l MUB01  |h 0948 
CAT |c 20120610  |l MUB01  |h 2009 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20120831  |l MUB01  |h 1016 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20130304  |l MUB01  |h 1108 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20130507  |l MUB01  |h 1204 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20130610  |l MUB01  |h 1616 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20130926  |l MUB01  |h 1434 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140213  |l MUB01  |h 0835 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20140903  |l MUB01  |h 1206 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20150806  |l MUB01  |h 1640 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1445 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1406 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0115 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20160831  |l MUB01  |h 1608 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170829  |l MUB01  |h 1151 
CAT |c 20190527  |l MUB01  |h 1024 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 0947 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1936 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1158 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2019-05-27 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-11844  |5 3145349034  |8 20100803  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20100803  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-11844  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD 

Podobné jednotky