Strategie pro detekci a diferenciaci izolátů Mycobacterium avium
Zástupci druhu Mycobacterium avium zahrnující M. avium subsp. paratuberculosis, M. a. hominissuis, M. a. avium a M. a.silvaticum jsou vXsoučasné době považováni za nejčastější oportunně patogenní mykobakterie způsobující infekce u zvířat a lidí. Schopnost rozlišit zmíněné poddruhy je velmi důležitá...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2008
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/8722/prif_r/ |
| Shrnutí: | Zástupci druhu Mycobacterium avium zahrnující M. avium subsp. paratuberculosis, M. a. hominissuis, M. a. avium a M. a.silvaticum jsou vXsoučasné době považováni za nejčastější oportunně patogenní mykobakterie způsobující infekce u zvířat a lidí. Schopnost rozlišit zmíněné poddruhy je velmi důležitá pro správnou diagnózu a nastavení kontrolních programů pro tyto infekce. Úkolem práce bylo navrhnout a validovat strategii pro rychlou a specifickou detekci a diferenciaci poddruhů M. avium zXbakteriálních kultur pomocí PCR (polymerázové řetězové reakce). Pro tento účel jsme vyvinuli multiplexní PCR metodu založenou na detekci genů kódujících IS900, IS901, IS1245 a dnaJ. Vyvinutá metoda multiplexní PCR umožňuje detekovat M. a. paratuberculosis, M. a. hominissuis a M. a. avium/M. a. silvaticum vXjedné PCR reakci aXteoreticky umožňuje rozlišit smíšenou infekci M. a. paratuberculosis a M. a. avium, nebo M. a. paratuberculosis a M. a. hominissuis. Sensitivita multiplexní PCR je 103 CFU každého t The members of Mycobacterium avium species, comprising M. avium subsp. paratuberculosis, M. a. hominissuis, M. a. avium, M. a. silvaticum, are currently the most prevalent opportunistic pathogenic mycobacteria causing mycobacterial infection in animals and humans. The ability to distinguish between these subspecies is of relevance for proper diagnosis and control programmes of the diseases. The aim of this study was to design a fast and specific PCR strategy for the detection and differentiation of M. avium subspecies fromXthe solid plate cultures for use in routine veterinary diagnosis. We have developed aXmultiplex PCR based on IS900, IS901, IS1245 and the dnaJ gene. This method allows the detection ofXM. a. paratuberculosis, M. a. hominissuis and M. a. avium/M. a. silvaticum in one PCR reaction and theoretically enables mixed infections of M. a. paratuberculosis and M. a. avium or M. a. paratuberculosis and M. a. hominissuis to be revealed. The sensitivity of this multiplex PCR is 1 |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Milan Bartoš |
| Fyzický popis: | 36 l., [16] l. příl. : il. |