Epigenetické procesy v regulaci udržování telomer
Diplomová práce se zabývá sledováním změn ve stavbě telomer po navození celogenomové hypomethylace. Pro tyto účely byla vybrána chemikálie S-9-(2,3-dihydroxypropyl) adenin (DHPA), která funguje jako kompetitivní reversibilní inhibitor hydrolázy S-adenosyl-L-homocysteinu. Tato hydroláza je zodpovědná...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2009
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/150507/prif_m/ |
| Shrnutí: | Diplomová práce se zabývá sledováním změn ve stavbě telomer po navození celogenomové hypomethylace. Pro tyto účely byla vybrána chemikálie S-9-(2,3-dihydroxypropyl) adenin (DHPA), která funguje jako kompetitivní reversibilní inhibitor hydrolázy S-adenosyl-L-homocysteinu. Tato hydroláza je zodpovědná za hydrolýzu L-homocysteinu, což je látka vznikající z S-adenosyl-L-methioninu odtržením methylové skupiny. DHPA proto účinně zasahuje přímo do procesu methylace DNA i histonů, čímž se stává ideálním činidlem pro navození hypomethylace. Jako vhodný materiál byl vybrán rostlinný modelový organismus N. tabacum a z něho odvozené buňky TBY-2. Tyto buňky byly pěstovány na několika různých koncentracích DHPA a po jejich sklizení byl materiál podroben analýze délky terminálních restrikčních fragmentů (TRF), analýze stupně methylace DNA a analýze aktivity telomerázy. Byly sledovány nejen změny způsobené přímým ovlivňováním buněk, ale i případný návrat do původního stavu po odstranění hypomethylační. The presented diploma thesis deals with the monitoring of changes in the structure of telomeres after the whole-genomic hypomethylation. For this purpose S-9-(2,3-dihydroxypropyl)adenine was chosen, which works as a reversible competitive inhibitor of S-adenosyl-L-homocystein hydrolase. This hydrolase is responsible for lyses of L-homocystein, which is a substance that rises from S-adenosyl-L-methionin by ripping off the active methyl group. So DHPA interferes directly with the core mechanism of DNA and histone methylation, which makes it the ideal agent for inducing the hypomethylation. As a suitable material a plant model organism Nicotiana tabacum, particularly its TBY-2 cells were chosen. These cells were cultivated on different concentrations of DHPA and when harvested, the terminal restriction assay (TRF), methylation pattern assay and telomere repeat amplification protocol (TRAP) were proceeded. The observation was focused not only on direct changes after the treatment but also . |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Jiří Fajkus |
| Fyzický popis: | 53 l., [2] l. příl. |