Genomické profilování CD34+ buněk pacientů s CML
Chronická myeloidní leukémie (CML) je myeloproliferativní nádorové onemocnění, způsobené onkogenní aktivitou produktu genu BCR/ABL. Tato tyrosinkinasa aktivuje řadu molekulárních mechanismů, zapojených do nádorové transformce. Většina z nich však dosud není dostatečně prozkoumaná. Vhodným nástrojem...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2008.
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/106117/prif_m/ |
| Shrnutí: | Chronická myeloidní leukémie (CML) je myeloproliferativní nádorové onemocnění, způsobené onkogenní aktivitou produktu genu BCR/ABL. Tato tyrosinkinasa aktivuje řadu molekulárních mechanismů, zapojených do nádorové transformce. Většina z nich však dosud není dostatečně prozkoumaná. Vhodným nástrojem ke studiu změn souvisejících s nádorovou transformací je technologie cDNA microarrays, která umožňuje sledovat genovou expresi na úrovní celého genomu. Vzhledem k předpokládanému vzniku CML již v hematopoetických kmenových buňkách jsme se rozhodli expresnímu profilování podrobit populaci CD34+ hematopoetických buněk z kostní dřeně. Za účelem provedení cDNA microarrays studie na CD34+ buňkách byla nejprve navržena a ověřena účinná metoda k izolaci a amplifikaci RNA z minimálního množství buněk. Ta byla následně aplikována na klinické vzorky a pomocí cDNA microarrays s 19 008 lidskými EST sekvencemi byly sestrojeny expresní profily klinických vzorků CD34+ hematopoetických buněk skupiny nově di. Chronic myeloid leukemia is a myeloproliferative disorder caused by oncogenic activity of the Bcr/Abl protein. The Bcr/Abl tyrosinkinase activates many molecular mechanisms linked with malignant transformation. Unfortunately, most of these mechanisms are still unknown. The cDNA microarrays technology allows us to study gene expression at the level of whole genome. Therefore it can be used as a powerful tool for studying changes connected with malignant transformation. We decided to use CD34+ hematopoietic cells from bone marrow. It is supposed that leukemia originates in these cells. Therefore we used CD34+ cells for our expression profiling experiments. At first we selected and verified the method for RNA isolation and amplification to obtain sufficient amount of high-quality RNA for microarrays analysis. Than we used RNA from clinical samples to obtain expression profiles of the group of chronic phase CML patients, complete cytogenetic remission patients, and healthy volunteers. Some. |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Irena Koutná. |
| Fyzický popis: | 63 l. : il., obr. |