Predlžovanie mikrosatelitov v ľudskom genóme
Genomová DNA není konstantní objekt. Dochází v ní k řade zmen, které mají značný biologický význam. Jednou z těchto zmen je prodlužování DNA, o kterém se ví, že souvisí s radou zejména neurodegenerativních onemocnění a také některými typy rakoviny. Mechanismus prodlužování DNA není znám. DNA se prod...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Slovenština |
| Vydáno: |
2008.
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/184513/prif_b/ |
| Shrnutí: | Genomová DNA není konstantní objekt. Dochází v ní k řade zmen, které mají značný biologický význam. Jednou z těchto zmen je prodlužování DNA, o kterém se ví, že souvisí s radou zejména neurodegenerativních onemocnění a také některými typy rakoviny. Mechanismus prodlužování DNA není znám. DNA se prodlužuje už i pri jednoduché PCR. O tomto prodlužování jsme zjistili, že vykazuje podobné zákonitosti jako prodlužování v genomech. Empiricky provádíme PCR genomových fragmentu a zjištujeme, že některé z nich se prodlužují a jiné nikoli. Pro prodlužování je podstatné, aby fragmenty nebyly ani příliš krátké ani příliš dlouhé a aby obsahovaly jedoduché opakující se motivy, které se vyskytují v mikrosatelitech. Dalšími faktory jsou konce molekul, jejich obsah (A+T) a obsah pyrimidinových bází. Cílem práce je analyzovat již provedené experimenty s cílem nalézt zákonitosti mechanismu prodlužování. Vítané by bylo dále navržení a provedení experimentů, které by dále prispely k objasnení této otázky. Genomic DNA is not a constant object. It undergoes various changes which can have a major biological impact. One of them is the DNA elongation which is known for being connected with many, mostly neurodegenerative diseases, and also some types of cancer. The mechanism of DNA elongation is not known yet. DNA expands even in the course of simple PCR. This elongation exhibits similar pattern as elongation in genomes. PCR of genomic fragments has been performed empirically, and it has been found that some of these fragments undergo elongation and some don`t. For elongation, it is essential for fragments to be neither too short nor too long, and to contain simple repetitive motives which are found in microsatellites. Another factors, which influence elongation, are fragment ends, (A+T) content, and pyrimidine bases content. The aim of this work is to analyse performed experiments in order to find the pattern of elongation mechanism. Design and performance of experiments, which would contrib. |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Jaroslav Kypr. |
| Fyzický popis: | 35 l., [3] l. příl. |