Jednonukleotidové polymorfizmy genů imunitní odpovědi koně

Cílem diplomové práce bylo identifikovat jednonukleotidové polymorfizmy vybraných genů přirozené imunity koně a vypracovat metody jejich genotypizace s cílem využít je pro další práce jako markerů v asociačních studiích. Použitím specifických primerů bylo u genu IL- 1RA nalezeno 7 jednonukleotidovýc...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Nečesánková, Michaela (Autor práce)
Další autoři: Matiašovic, Ján (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Čeština
Vydáno: 2007.
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/67596/prif_m/
Obálka
LEADER 05928ctm a22009497a 4500
001 MUB01000507266
003 CZ BrMU
005 20230715092638.0
008 070619s2007 xr ||||| |||||||||||cze d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2014-04-10 
035 |a (ISMU-VSKP)92779 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD004 
072 7 |a 575  |x Obecná genetika. Obecná cytogenetika. Evoluce  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 577.21  |2 MRF 
080 |a 575  |2 MRF 
080 |a 616-097  |2 MRF 
100 1 |a Nečesánková, Michaela  |7 xx0303893  |% UČO 67596  |4 dis 
242 1 0 |a Single nucleotide polymorphisms of selected immunity-related genes in the domestic horse  |y eng 
245 1 0 |a Jednonukleotidové polymorfizmy genů imunitní odpovědi koně  |h [rukopis] /  |c Michaela Nečesánková. 
260 |c 2007. 
300 |a 65 l., [20] s. příl. 
500 |a Vedoucí práce: Ján Matiašovic. 
502 |a Diplomová práce (Mgr.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2007. 
520 2 |a Cílem diplomové práce bylo identifikovat jednonukleotidové polymorfizmy vybraných genů přirozené imunity koně a vypracovat metody jejich genotypizace s cílem využít je pro další práce jako markerů v asociačních studiích. Použitím specifických primerů bylo u genu IL- 1RA nalezeno 7 jednonukleotidových polymorfizmů, všechny v oblasti mezi 3. a 4. exonem. U genu TLR2 byla nalezena 3 polymorfní místa, všechna v exonu 3, v jednom případě se jednalo o nesynonymní substituci. U genu COX- 2 byly lokalizované 3 polymorfizmy nacházející se v intronu 5. MyD88 se nepodařilo amplifikovat, vzhledem k mezidruhovým rozdílům v sekvenci tohoto genu a primery navrženými podle sekvencí myši a člověka. U genu MD- 2 nebyla v analyzované části nalezena žádná polymorfní místa. Na základě zjištěných sekvencí, byly vypracovány metody genotypizace pomocí PCR-RFLP. Nalezené jednonukleotidové polymorfizmy mohou být dále využívány jako SNP markery pro asociační studie. Dosavadní analýzy neodhalily asociaci mez.  |% cze 
520 2 9 |a The aim of this thesis was to identify single nucleotide polymorphisms of selected genes related to innate immunity in the domestic horse and to establish methods of their genotyping for the purpose of assessing associations with specific diseases. By using horse-specific primers and the PCR-RFLP method, 7 single nucleotide polymorphisms (SNPs) were found within the gene IL-1RA, all of them being located between exons 3 and 4. 3 SNPs were identified in the gene TLR2, all located in exon 3, one of them being a non-synonymous substitution. 3 SNPs were found in the gene COX-2, located in intron 5. We did not succeed to amplify the gene MyD88, due to inter-species differences, as revealed after the complete horse genomic sequence became available. No polymorphism was found within the analyzed part of the gene MD- 2 . Based on the sequences determined, a PCR-RFLP method for genotyping selected SNPs was developed. These SNP markers thus could be used for association analyses. No associatio.  |9 eng 
650 0 7 |a imunogenetika  |7 ph121048  |2 czenas 
650 0 7 |a koně  |7 ph114977  |2 czenas 
650 0 7 |a molekulární genetika  |7 ph122957  |2 czenas 
650 0 9 |a horses  |2 eczenas 
650 0 9 |a immunogenetics  |2 eczenas 
650 0 9 |a molecular genetics  |2 eczenas 
655 7 |a diplomové práce  |7 fd132022  |2 czenas 
655 9 |a master's theses  |2 eczenas 
658 |a Biologie  |b Molekulární biologie a genetika  |c PřF M-BI BIMG (BIMG)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Matiašovic, Ján  |7 mzk2015855524  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Přírodovědecká fakulta.  |b Biologická sekce  |7 ko2003200163  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/67596/prif_m/ 
CAT |c 20070619  |l MUB01  |h 0451 
CAT |c 20071003  |l MUB01  |h 2203 
CAT |a DRIMLOVA  |b 02  |c 20080407  |l MUB01  |h 1452 
CAT |c 20080429  |l MUB01  |h 1813 
CAT |c 20080429  |l MUB01  |h 1828 
CAT |a JANA  |b 02  |c 20080722  |l MUB01  |h 1532 
CAT |a BATCH-UPD  |b 02  |c 20091102  |l MUB01  |h 0605 
CAT |a BATCH-UPD  |b 02  |c 20091103  |l MUB01  |h 0128 
CAT |c 20091203  |l MUB01  |h 0150 
CAT |c 20091203  |l MUB01  |h 1833 
CAT |a BATCH-UPD  |b 00  |c 20091219  |l MUB01  |h 0737 
CAT |c 20100428  |l MUB01  |h 1000 
CAT |a BATCH-UPD  |b 00  |c 20100501  |l MUB01  |h 1130 
CAT |a BATCH-UPD  |b 00  |c 20100929  |l MUB01  |h 0318 
CAT |c 20110627  |l MUB01  |h 1901 
CAT |c 20110627  |l MUB01  |h 2310 
CAT |a batch  |b 00  |c 20120324  |l MUB01  |h 0101 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20120510  |l MUB01  |h 0723 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20120712  |l MUB01  |h 0810 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20130303  |l MUB01  |h 0900 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20130730  |l MUB01  |h 0735 
CAT |c 20140410  |l MUB01  |h 1147 
CAT |a ANTLOVAX  |b 02  |c 20140716  |l MUB01  |h 1431 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141023  |l MUB01  |h 0819 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1436 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1356 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151225  |l MUB01  |h 2244 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180824  |l MUB01  |h 2256 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180824  |l MUB01  |h 2259 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190618  |l MUB01  |h 1650 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1424 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1427 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200323  |l MUB01  |h 1850 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200323  |l MUB01  |h 1927 
CAT |a PUTNOVAX  |b 02  |c 20200525  |l MUB01  |h 1045 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 0214 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 0924 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1913 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1124 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210819  |l MUB01  |h 0810 
CAT |a VACOVAX  |b 02  |c 20230715  |l MUB01  |h 0926 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2014-04-10 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-12528  |5 3145341335  |8 20080407  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20080407  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-12528  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD