Příprava celogenomových DNA sond pro techniku komparativní genomové hybridizace metodou DOP-PCR
Předmětem této práce je optimalizace komparativní genomové hybridizace (CGH) z malého množství materiálu. Praktické provedení spočívalo v optimalizaci metod celogenomové amplifikace pro účely komparativní genomové hybridizace, následné značení amplifikátu, výběr nejvhodnější z testovaných metod, hod...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2006
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/59950/prif_m/ |
| Shrnutí: | Předmětem této práce je optimalizace komparativní genomové hybridizace (CGH) z malého množství materiálu. Praktické provedení spočívalo v optimalizaci metod celogenomové amplifikace pro účely komparativní genomové hybridizace, následné značení amplifikátu, výběr nejvhodnější z testovaných metod, hodnocení profilů získaných amplifikací různých množství vstupní DNA a jejich srovnání s výsledky standardní CGH. Výsledky CGH z malého množství odpovídaly standardní CGH v případech od amplifikace 1 ng DNA, což představuje ekvivalent stovek buněk, tedy snížení nároku na množství vstupní DNA o tři řády. In this work CGH from smaller amounts of DNA has to be optimized. The practical part of this work was to find the best protocol of whole-genome amplification for CGH from smaller amount of DNA, labeling of the probe for CGH, getting the CGH profiles from variable amounts of DNA and comparing them with standard CGH. DOP-PCR with LA-polymerases mix showed good ability to be used for CGH from amounts of 1 ng DNA or larger. |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Petr Kuglík |
| Fyzický popis: | 53 l. |