Learning-Based Cell Image Synthesis in Biomedical Imaging /

Strojové učení nachází stále větší uplatnění v analýze biomedicínských snímků. Umožňuje řešit úlohy, které jsou příliš časově náročné nebo náchylné k chybám při ručním zpracování a mezi které patří například segmentace buněk v 3D časosběrných sekvencích. Metody založené na strojovém učení jsou však...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Wiesner, David (Autor práce)
Další autoři: Svoboda, David, 1978- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2023
Témata:
On-line přístup:https://is.muni.cz/th/nbrbe/
Obálka
LEADER 04714ctm a22007217i 4500
001 MUB01006533693
003 CZ BrMU
005 20241120104458.0
008 240125s2023 xr ||||| |||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2024-07-15 
035 |a (ISMU-VSKP)318933 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD018  |e rda 
072 7 |a 004.8  |x Umělá inteligence  |2 Konspekt  |9 23 
072 7 |a 57  |x Obecná biologie  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 004  |2 MRF 
080 |a 57:61  |2 MRF 
080 |a 004.85  |2 MRF 
080 |a 57.089  |2 MRF 
080 |a 57.086.2  |2 MRF 
080 |a 575.112  |2 MRF 
100 1 |a Wiesner, David  |% UČO 255597  |* [absolvent FI MU]  |4 dis 
242 1 0 |a Learning-Based Cell Image Synthesis in Biomedical Imaging  |y eng 
245 1 0 |a Learning-Based Cell Image Synthesis in Biomedical Imaging /  |c David Wiesner 
264 0 |c 2023 
300 |a viii, 1 svazek (různé stránkování) :  |b ilustrace 
336 |a text  |b txt  |2 rdacontent 
337 |a bez média  |b n  |2 rdamedia 
338 |a svazek  |b nc  |2 rdacarrier 
500 |a Vedoucí práce: David Svoboda 
502 |a Dizertace (Ph.D.)--Masarykova univerzita, Fakulta informatiky, 2024 
520 2 |a Strojové učení nachází stále větší uplatnění v analýze biomedicínských snímků. Umožňuje řešit úlohy, které jsou příliš časově náročné nebo náchylné k chybám při ručním zpracování a mezi které patří například segmentace buněk v 3D časosběrných sekvencích. Metody založené na strojovém učení jsou však ze své podstaty závislé na datech a vyžadují značné množství trénovacích vzorků, aby mohly produkovat výstupy v žádané kvalitě. Vhodných souborů trénovacích dat je málo a obvykle nejsou volně dostupné kvůli licenčním omezením nebo pracné ruční přípravě. V této práci se zaměřujeme na vývoj metod pro syntézu vizuálně věrohodných mikroskopických snímků buněk s cílem řešit nedostatek dostupných trénovacích datových sad. Práce se navíc věnuje návrhu nové metodiky pro syntézu 3D statických i časosběrných sekvencí živých buněk ve vysokém rozlišení.  |% cze 
520 2 9 |a Machine learning techniques have an increasing presence in biomedical image analysis. They can provide solutions to tasks that would be too time-consuming or error-prone to do manually, such as cell tracking and segmentation in 3D time-lapse sequences. However, they are inherently data-driven and therefore require a considerable amount of training samples in order to produce outputs with reasonable accuracy. Suitable training data sets are scarce and usually not freely available due to licensing restrictions or laborious manual preparation. In this work, we focus on developing methods for the synthesis of visually-plausible microscopy images of cells in order to address the lack of available training data sets. We begin with a simple method for 3D static cell modeling and then explore a new methodology to produce 3D time-lapse sequences of living cells in high spatial and temporal resolution.  |9 eng 
650 0 7 |a výpočetní technika  |7 ph137273  |2 czenas 
650 0 7 |a strojové učení  |7 ph126143  |2 czenas 
650 0 7 |a bioinformatika  |7 ph194800  |2 czenas 
650 0 7 |a biomedicína  |7 ph165181  |2 czenas 
650 0 7 |a biomedicínské metody  |7 ph138852  |2 czenas 
650 0 9 |a computer science  |2 eczenas 
650 0 9 |a machine learning  |2 eczenas 
650 0 9 |a bioinformatics  |2 eczenas 
650 0 9 |a biomedicine  |2 eczenas 
650 0 9 |a biomedical methods  |2 eczenas 
655 7 |a disertace  |7 fd132024  |2 czenas 
655 9 |a dissertations  |2 eczenas 
658 |a Informatika  |b Technologie a metodologie počítačových systémů  |c FI D-INF DIIA (DIIA)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Svoboda, David,  |d 1978-  |7 xx0145053  |% UČO 2824  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Katedra vizuální informatiky  |4 dgg 
856 4 1 |u https://is.muni.cz/th/nbrbe/ 
CAT |c 20240125  |l MUB01  |h 0420 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240202  |l MUB01  |h 2142 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240202  |l MUB01  |h 2143 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240206  |l MUB01  |h 2048 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240206  |l MUB01  |h 2048 
CAT |a VESELA  |b 02  |c 20240408  |l MUB01  |h 1534 
CAT |a VESELA  |b 02  |c 20240408  |l MUB01  |h 1536 
CAT |c 20240715  |l MUB01  |h 1016 
CAT |a VESELA  |b 02  |c 20241120  |l MUB01  |h 1044 
CAT |a VESELA  |b 02  |c 20241120  |l MUB01  |h 1044 
CAT |c 20241121  |l MUB01  |h 0454 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2024-07-15 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 FI  |a Fakulta informatiky  |2 SKLAD  |b sklad  |3 Doktorská práce 2023  |5 42005D2772  |8 20240408  |f 72  |f Týdenní  |r 20240408 
AVA |a INF50  |b FI  |c sklad  |d Doktorská práce 2023  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD