Změny genomu indukované expresí fragilních míst a ztrátou genů kódujících proteiny asociované s chromatinem /
Tato diplomová práce se zabývá analýzou vybraných genů asociovaných s chromatinem, tzv. CHR genů a vybranými repeticemi, u rostliny A. thaliana. CHR geny kódují faktory podílející se na remodelaci chromatinu, jež je nezbytná pro replikaci, transkripci i reparaci DNA, a tedy pro stabilitu genomu. Z h...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2018
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/x1cwc/ |
| Shrnutí: | Tato diplomová práce se zabývá analýzou vybraných genů asociovaných s chromatinem, tzv. CHR genů a vybranými repeticemi, u rostliny A. thaliana. CHR geny kódují faktory podílející se na remodelaci chromatinu, jež je nezbytná pro replikaci, transkripci i reparaci DNA, a tedy pro stabilitu genomu. Z hlediska replikace, mezi nejméně stabilní místa genomu patří repetice. V této práci jsem se zabývala dvěma typy repetic - telomerami, což jsou nukleoproteinové komplexy chránící konce chromozomů; a úseky ribozomální DNA (rDNA), kódující ribozomální RNA, jež jsou důležitou součástí ribozomu. Pomocí inhibitoru replikace aphidicolinu (APH) a transkripce actinomycinu D (ActD) je možno zviditelnit nestabilní úseky DNA ve formě zúžení na chromozomech, označované jako fragilní místa. Díky své nestabilitě jsou fragilní místa vhodná pro studium mechanismů odpovědných za udržování genomové integrity. Experimentální část této práce je zaměřena na selekci mutant s T-DNA inzercí v CHR genech rostliny A. t This thesis is focused on analysis of selected chromatin-associated genes (so called CHR genes) and selected DNA repeats in Arabidopsis thaliana plants. These genes encode the factors involved in chromatin remodeling, which are necessary for DNA replication, transcription and DNA repair. These factors thus affect genome stability. Repetitive sequences are the least stable genome sites because they represent a hard template for DNA polymerases during replication. In this thesis I focused on two types of repeats - telomeres and ribosomal DNA (rDNA). Telomeres are nucleoprotein complexes protecting the ends of chromosomes, while ribosomal DNA encodes genes for ribosomal RNA, a key component of ribosomes. By using the replication inhibitor aphidicolin (APH) and the transcription inhibitor actinomycin D (ActD), instable genomic sites can be seen in the form of chromosomal constricts, so called fragile sites. Fragile sites, because of their instability, represent an ideal model to study the |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Martina Dvořáčková |
| Fyzický popis: | 79 stran |