DFT studium interakce aktivního místa thioredoxin reduktázy s modelovým komplexem Au(I) /
Teoretická část práce čtenáři nabízí základní informace o proteinech, jejich struktuře a funkci. Následně jsou předloženy ukázkové způsoby interakcí proteinů s kovy. Zmíněna je též biologická funkce thioredoxin reduktázy. Dále je čtenář seznámen se základy kvantové mechaniky a rozdíly mezi světem el...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2017
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/437155/prif_b/ |
| Shrnutí: | Teoretická část práce čtenáři nabízí základní informace o proteinech, jejich struktuře a funkci. Následně jsou předloženy ukázkové způsoby interakcí proteinů s kovy. Zmíněna je též biologická funkce thioredoxin reduktázy. Dále je čtenář seznámen se základy kvantové mechaniky a rozdíly mezi světem elementárních částic a světem makroobjektů. V teoretické části je také popsána kvantová chemie, kdy je věnována zvláštní pozornost nejčastěji používaným metodám kvantové chemie. Praktická část práce je zaměřena na teoretické studium reakce modelového komplexu zlata Au(I) v aktivním místě proteinu thioredoxin reduktázy. Vzhledem k tomu, že samotná struktura proteinu byla výsledkem rentgenové krystalografie, bylo nutné zjistit, jak přibližně aktivní místo proteinu vypadá, pokud se nachází ve fyziologických podmínkách. Bylo namodelováno přes 100 možných struktur tetrapeptidu, který se nachází v aktivním místě thioredoxin reduktázy. Jejich vypočtené redoxní potenciály byly porovnány s výsledky z The theoretical part of this thesis offers to the reader the basic information about proteins, their structures and functions. Then there are introduced exemplary methods of interactions of proteins with metals. Moreover there is mentioned biological function of thioredoxin reductase. The other part contains the basics of quantum mechanics and differences between the world of elementary particles and the world of macro-objects. In the theoretical part there is also subscribed a quantum chemistry, where is paid an extraordinary attention to the most common methods of quantum chemistry. The practical part of thesis is focused on the theoretical study of reaction of the model's complex of gold Au(I) in active spot of protein thioredoxin reductase. Due to the fact, that the structure of protein itself was the result of X-ray crystallography, it was necessary to find out how the active spot of protein looks like, if it is situated under physiological conditions. Over 100 possible structure |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Markéta Munzarová |
| Fyzický popis: | 57 stran |