Optimalizace celogenomové amplifikace pro účely preimplantační genetické analýzy /
Celogenomové amplifikace jsou metody, jež z malého množství DNA umožňují získat množství dostačující pro násedné analýzy s pokrytím celého genomu. Jsou využívány v různých oblastech molekulární genetiky, např. v nádorové genetice při analýze DNA jednotlivých malých subpopulací nádorových buněk, při...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2016
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/394259/prif_m/ |
| Shrnutí: | Celogenomové amplifikace jsou metody, jež z malého množství DNA umožňují získat množství dostačující pro násedné analýzy s pokrytím celého genomu. Jsou využívány v různých oblastech molekulární genetiky, např. v nádorové genetice při analýze DNA jednotlivých malých subpopulací nádorových buněk, při studiu genetické informace nekultivovatelných organizmů nebo v případech, kdy je možné získat DNA pouze z několika buněk embryí pro navazující preimplantační genetické analýzy. Cílem této diplomové práce je optimalizovat metody celogenomové amplifikace DNA pro její využití v molekulárně-genetických analýzách pomocí komparativní genomové hybridizace na mikročipech a kvantitativní PCR v reálném čase. Srovnávány byly dva komerčně dostupné kity pro celogenomovou amplifikaci DNA založené na odlišném principu. Prvním byl kit „REPLI-g Single Cell Kit“ založený na izotermální amplifikaci násobným vytěsněním řetězce, druhým srovnávaným byl kit „PicoPLEX Whole Genome Amplification Kit“ založený na amp Whole-genome amplifications are methods that enable to obtain sufficient amount of DNA from small amounts of samples for ongoing analyses with whole-genome coverage. They are used in various fields of molecular genetics, e.g. in tumor genetics when analysing DNA from individual small subpopulations of tumor cells, for studies of unculturable organisms or in cases when DNA from only few embryonic cells is accessible for further preimplantation genetic analyses. The aim of this diploma thesis is to optimise methods of whole-genome amplification of DNA for the purpose of molecular genetic analyses by array comparative genomic hybridization and quantitative real-time PCR. Two commercially available kits for whole-genome amplification based on a different principle were compared. The first was the REPLI-g Sigle Cell Kit based on isothermal multiple displacement amplification, the second compared kit was the PicoPLEX Whole Genome Amplification Kit based on thermal cycling during DNA amplific |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Petr Kuglík |
| Fyzický popis: | 85 listů |