Struktura a regulační funkce kvadruplexu v promotoru genu oct-4 /
V diplomové práci se věnuji prostudování podmínek vzniku guaninového kvadruplexu (G-kvadruplex) v promotoru genu oct-4, v prostředí monovalentních iontů K + a Li + , dále se věnuji vlivu vybraných ligandových molekul (NMM, PDS, Berberin, BRACO, Aloe-emodin)na stabilizaci této sekundární struktury. E...
Uloženo v:
Hlavní autor: | |
---|---|
Další autoři: | |
Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
Jazyk: | Čeština |
Vydáno: |
2016
|
Témata: | |
On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/356864/prif_m/ |
Shrnutí: | V diplomové práci se věnuji prostudování podmínek vzniku guaninového kvadruplexu (G-kvadruplex) v promotoru genu oct-4, v prostředí monovalentních iontů K + a Li + , dále se věnuji vlivu vybraných ligandových molekul (NMM, PDS, Berberin, BRACO, Aloe-emodin)na stabilizaci této sekundární struktury. Experimentálně je ověřována hypotéza vlivu ligandů a K + iontů na průchod enzymu Klenowova fragmentu DNA polymerázy I přes sekvenci schopnou vytvářet G-kvadruplex in vitro, který tak simuluje mechanizmus replikace G-kvadruplexové DNA při buněčném dělení. In this diploma thesis, I investigate conditions for inducing of a guanine quadruplex (G-quadruplex) in gene promoter oct-4, in presence of monovalent K + and Li + ions. Furthermore, I focused on the impact of selected ligand molecules (NMM, PDS, Berberin, BRACO, Aloe-emodin) on stabilization of this secondary structure. Experimentaly I verifyied the hypothesis that the presence of ligands and K + ions have impact on ability of Klenow fragment of DNA polymerase I to process a sequence that is able to create G-quadruplexes in vitro, which analogicaly simulates the mechanism of replication of G-quadruplex DNA during cell division. |
---|---|
Popis jednotky: | Vedoucí práce: Daniel Renčiuk |
Fyzický popis: | 57 listů |