Evoluční a genetická analýza genomů rodu Trifolium s využitím genomických a bioinformatických nástrojů /
Rod Trifolium patří mezi nejvýznamnější a nejpočetnější rody čeledi Fabaceae. V zemědělství se nejvíce uplatňují jetel luční a jetel plazivý jako pícniny, či se využívá jejich schopnosti fixace vzdušného dusíku pro obnovu úrodné půdy. Genetická analýza těchto druhů je však komplikována cizosprašnost...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2015
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/214574/prif_d/ |
| LEADER | 05416ctm a22008057i 4500 | ||
|---|---|---|---|
| 001 | MUB01006343822 | ||
| 003 | CZ BrMU | ||
| 005 | 20170420090427.0 | ||
| 008 | 150702s2015 xr ||||| |||||||||||cze d | ||
| STA | |a POSLANO DO SKCR |b 2016-03-09 | ||
| 035 | |a (ISMU-VSKP)221356 | ||
| 040 | |a BOD114 |b cze |d BOD035 |e rda | ||
| 072 | 7 | |a 57/59 |x Biologické vědy |2 Konspekt |9 2 | |
| 080 | |a 582.736.3 |2 MRF | ||
| 080 | |a 575.111:58 |2 MRF | ||
| 080 | |a 577.212.3 |2 MRF | ||
| 100 | 1 | |a Ištvánek, Jan |% UČO 214574 |* [absolvent PřírF MU] |4 dis | |
| 242 | 1 | 0 | |a Evolution and genetic analysis of Trifolium genomes by means of genomic and bioinformatic tools |y eng |
| 245 | 1 | 0 | |a Evoluční a genetická analýza genomů rodu Trifolium s využitím genomických a bioinformatických nástrojů / |c Jan Ištvánek |
| 264 | 0 | |c 2015 | |
| 300 | |a 124 listů, 11 nečíslovaných listů příloh + |e CD-ROM příloha | ||
| 336 | |a text |b txt |2 rdacontent | ||
| 337 | |a bez média |b n |2 rdamedia | ||
| 338 | |a svazek |b nc |2 rdacarrier | ||
| 500 | |a Vedoucí práce: Jana Řepková | ||
| 502 | |a Dizertace (Ph.D.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2015 | ||
| 520 | 2 | |a Rod Trifolium patří mezi nejvýznamnější a nejpočetnější rody čeledi Fabaceae. V zemědělství se nejvíce uplatňují jetel luční a jetel plazivý jako pícniny, či se využívá jejich schopnosti fixace vzdušného dusíku pro obnovu úrodné půdy. Genetická analýza těchto druhů je však komplikována cizosprašností a často i polyploidním charakterem jejich genomů. Žádný z genomů jetele dosud nebyl osekvenován. Pro popis genomů rodu Trifolium byla vybrána kulturní odrůda jetele lučního (T. pratense) Tatra a jetel prostřední (T. medium). Genomy byly osekvenovány metodou Illumina, přičemž u jetele lučního bylo dosaženo pokrytí 58,8 x (haploidní velikost genomu x = 418 Mbp), u jetele prostředního 23 x (haploidní velikost genomu x = 3154 Mbp). Vzhledem ke zvolenému přístupu de novo byly otestovány a vybrány vhodné programy pro sestavení referenčních sekvencí. Byla použita kombinace programů Abyss (assembler) a Echo (oprava sekvenačních chyb). V rámci popisu nově osekvenovaných genomů byla charakterizována |% cze | |
| 520 | 2 | 9 | |a Genus Trifolium belongs among the most significant and largest genera in Fabaceae family. The most employed species in agronomy, red clover and white clover, are used as fodder plants or to regenerate fertile soil by air nitrogen fixation. However, outcrossing and polyploid nature of their genomes complicate their genetic analysis. To date, none of their genomes was sequenced. The cultivated variety of red clover (T. pratense) Tatra and wild species zigzag clover (T. medium) were chosen to describe genomes of Trifolium genus. Genomes were sequenced with Illumina technology and genome coverages of 58.8 x and 23 x were achieved for red clover (haploid genome size x = 418 Mbp) and zigzag clover (haploid genome size x = 3154 Mbp), respectively. Based on chosen de novo approach, the programs were tested for their suitability to assemble the reference sequences. Combination of Abyss (assembler) and Echo (error correction) was used. Repetitive content of the newly sequenced genomes was charac |9 eng |
| 650 | 0 | 7 | |a jetel luční |7 ph503024 |2 czenas |
| 650 | 0 | 7 | |a jetel prostřední |2 CZ-BrMU |
| 650 | 0 | 7 | |a mapování chromozomů |2 czmesh |
| 650 | 0 | 7 | |a rostlinný genom |7 ph849150 |2 czenas |
| 650 | 0 | 7 | |a sekvenování de novo |2 CZ-BrMU |
| 650 | 0 | 7 | |a sekvenování DNA |7 ph187962 |2 czenas |
| 650 | 0 | 7 | |a Trifolium |x genetika |2 czmesh |
| 650 | 0 | 9 | |a de novo sequencing |2 eCZ-BrMU |
| 650 | 0 | 9 | |a DNA sequencing |2 eczenas |
| 650 | 0 | 9 | |a plant genome |2 eczenas |
| 650 | 0 | 9 | |a Trifolium medium |2 eCZ-BrMU |
| 650 | 0 | 9 | |a Trifolium pratense |2 eczenas |
| 650 | 0 | 2 | |a Chromosome Mapping |
| 655 | 7 | |a disertace |7 fd132024 |2 czenas | |
| 655 | 9 | |a dissertations |2 eczenas | |
| 658 | |a Biologie (čtyřleté) |b Obecná a molekulární genetika |c PřF D-BI4 OMG (OMG) |2 CZ-BrMU | ||
| 700 | 1 | |a Řepková, Jana, |d 1959- |7 ola2003204799 |% UČO 530 |4 ths | |
| 710 | 2 | |a Masarykova univerzita. |b Ústav experimentální biologie |7 mzk2008412438 |4 dgg | |
| 856 | 4 | 1 | |u http://is.muni.cz/th/214574/prif_d/ |
| CAT | |c 20150702 |l MUB01 |h 0421 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20150804 |l MUB01 |h 1654 | ||
| CAT | |c 20150901 |l MUB01 |h 1453 | ||
| CAT | |c 20150921 |l MUB01 |h 1415 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20151226 |l MUB01 |h 0549 | ||
| CAT | |a MENSIKOVA |b 02 |c 20160121 |l MUB01 |h 0922 | ||
| CAT | |c 20160303 |l MUB01 |h 1235 | ||
| CAT | |c 20160308 |l MUB01 |h 1507 | ||
| CAT | |c 20160309 |l MUB01 |h 1109 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20160901 |l MUB01 |h 1458 | ||
| CAT | |a VASICEKX |b 02 |c 20170420 |l MUB01 |h 0904 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20170823 |l MUB01 |h 1627 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20180807 |l MUB01 |h 1520 | ||
| CAT | |c 20210614 |l MUB01 |h 1015 | ||
| CAT | |c 20210614 |l MUB01 |h 2002 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20210724 |l MUB01 |h 1239 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20230522 |l MUB01 |h 1940 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20240610 |l MUB01 |h 1636 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20240820 |l MUB01 |h 2235 | ||
| LOW | |a POSLANO DO SKCR |b 2016-03-09 | ||
| 994 | - | 1 | |l MUB01 |l MUB01 |m VYSPR |1 KUK |a Knihovna univ. kampusu |2 SKLAD |b KUK - sklad |3 PřF-K-11128 |6 3285008533 |5 3285008533 |8 20160121 |f 71 |f Prezenční SKLAD |r 20160121 |s převod |
| AVA | |a MED50 |b KUK |c KUK - sklad |d PřF-K-11128 |e available |t K dispozici |f 1 |g 0 |h N |i 0 |j SKLAD | ||