Druhová identifikace klinicky významných hub pomocí molekulárně-biologických metod

Mikroskopické houby jsou běžnými kolonizátory kůže a gastrointestinálního traktu zdravé populace. U imunitně oslabených jedinců jsou častou příčinou morbidity a mortality. Nedostatečná citlivost a časová náročnost současných kultivačních a histologických metod vedou k rozvoji molekulárně-biologickýc...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Tihelková, Radka (Autor práce)
Další autoři: Freiberger, Tomáš, 1970- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Čeština
Vydáno: 2015
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/357761/prif_m/
Obálka
LEADER 05243ctm a22008057a 4500
001 MUB01001024076
003 CZ BrMU
005 20160418102344.0
008 150213s2015 xr ||||| |||||||||||cze d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2021-03-22 
035 |a (ISMU-VSKP)240662 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 577.2  |2 MRF 
080 |a 582.28-022.53  |2 MRF 
080 |a 616-022.7  |2 MRF 
080 |a 577.2:616-07  |2 MRF 
100 1 |a Tihelková, Radka  |% UČO 357761  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
242 1 0 |a Molecular-based identification of clinically important fungi  |y eng 
245 1 0 |a Druhová identifikace klinicky významných hub pomocí molekulárně-biologických metod  |h [rukopis] /  |c Radka Tihelková 
260 |c 2015 
300 |a 104 l. 
500 |a Vedoucí práce: Tomáš Freiberger 
502 |a Diplomová práce (Mgr.)--Masarykova univerzita, 1471, 2015 
520 2 |a Mikroskopické houby jsou běžnými kolonizátory kůže a gastrointestinálního traktu zdravé populace. U imunitně oslabených jedinců jsou častou příčinou morbidity a mortality. Nedostatečná citlivost a časová náročnost současných kultivačních a histologických metod vedou k rozvoji molekulárně-biologických technik, s jejichž pomocí je možné analyzovat klinické vzorky rychleji a s vyšší citlivostí. V práci byla optimalizována a testována metoda panfungální PCR s následnou analýzou amplifikovaných fragmentů oblasti ITS2 pomocí kapilární elektroforézy. Analýzou 37 sbírkových kmenů mikroskopických hub byla vytvořena interní banka referenčních délek fragmentů ITS2, která byla využita jako základ pro identifikaci neznámých druhů hub ze 124 klinických vzorků. Použitou metodou bylo možné vzájemně odlišit klinicky významné druhy mikroskopických hub z komplexních klinických vzorků moči a sonikátů stentů a katétrů.  |% cze 
520 2 9 |a Microscopic fungi are common colonizers of the skin and gastrointestinal tract of healthy people but on the other hand they may cause mortality and morbidity in immunocompromised hosts. The lack of sensitivity and the specificity of current cultivation and histological techniques has led to expansion of molecular methods, which are able to detect pathogenic microorganisms fast and in low concentrations. The aim of this study was to design and optimize PCR method for detection and identification of fungal species. Panfungal PCR targeting the ITS2 region located between structural RNA genes with subsequent analyses of fluorescently labelled amplicons by capillary electrophoresis was developed using 37 reference fungal strains. This approach has been shown as a useful tool in distinguishing fungal species when applied on 124 polyfungal clinical specimens of urine and ureteral stents or catheters.  |9 eng 
650 0 7 |a laboratorní diagnostika  |7 ph115087  |2 czenas 
650 0 7 |a mikromycety  |7 ph221960  |2 czenas 
650 0 7 |a molekulární biologie  |7 ph115344  |x metody  |2 czenas 
650 0 7 |a molekulární diagnostika  |7 ph122955  |2 czenas 
650 0 7 |a mykotické infekce  |7 ph136539  |2 czenas 
650 0 7 |a panfungální PCR  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a polymerázová řetězová reakce  |2 czmesh 
650 0 9 |a laboratory diagnostics  |2 eczenas 
650 0 9 |a microfungi  |2 eczenas 
650 0 9 |a molecular biology  |x methods  |2 eczenas 
650 0 9 |a molecular diagnostic  |2 eczenas 
650 0 9 |a mycotic infections  |2 eczenas 
650 0 9 |a panfungal PCR  |2 eCZ-BrMU 
650 0 2 |a Polymerase Chain Reaction 
655 7 |a diplomové práce  |7 fd132022  |2 czenas 
655 9 |a master's theses  |2 eczenas 
658 |a Experimentální biologie  |b Speciální biologie  |c PřF N-EXB SPBI (SPBI)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Freiberger, Tomáš,  |d 1970-  |7 xx0071641  |% UČO 24036  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav experimentální biologie  |7 mzk2008412438  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/357761/prif_m/ 
CAT |c 20150213  |l MUB01  |h 0420 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20150216  |l MUB01  |h 1247 
CAT |a VARTECKAX  |b 02  |c 20150519  |l MUB01  |h 1316 
CAT |c 20150724  |l MUB01  |h 1145 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20150810  |l MUB01  |h 1458 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1453 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1414 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0534 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20160106  |l MUB01  |h 0804 
CAT |a MENSIKOVA  |b 02  |c 20160112  |l MUB01  |h 1548 
CAT |a MENSIKOVA  |b 02  |c 20160418  |l MUB01  |h 1022 
CAT |a MENSIKOVA  |b 02  |c 20160418  |l MUB01  |h 1023 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20160815  |l MUB01  |h 1124 
CAT |c 20210322  |l MUB01  |h 0938 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1013 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 2000 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1235 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20211122  |l MUB01  |h 1137 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230920  |l MUB01  |h 1940 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231204  |l MUB01  |h 1953 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2021-03-22 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-9949  |6 3285008526  |5 3285008526  |8 20160112  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20160112  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-9949  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD