Epigenetické změny v transgenních lokusech v procesu dediferenciace rostlin
Rostlinné buněčné kultury se využívají k tvorbě transgenních proteinů nebo k rychlému množení rostlin. Nicméně, během kultivace buněk dochází k různým genetickým a epigenetickým změnám jako je například umlčování transgenů. Hlavním cílem této diplomové práce bylo studovat přeměnu posttranskripčního...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2014
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/324228/prif_m/ |
| LEADER | 05441ctm a22008057a 4500 | ||
|---|---|---|---|
| 001 | MUB01001001407 | ||
| 003 | CZ BrMU | ||
| 005 | 20210510131743.0 | ||
| 008 | 140627s2014 xr ||||| |||||||||||cze d | ||
| STA | |a POSLANO DO SKCR |b 2021-02-08 | ||
| 035 | |a (ISMU-VSKP)237335 | ||
| 040 | |a BOD114 |b cze |d BOD035 | ||
| 072 | 7 | |a 57/59 |x Biologické vědy |2 Konspekt |9 2 | |
| 080 | |a 57.086.83 |2 MRF | ||
| 080 | |a 575.111:58 |2 MRF | ||
| 080 | |a 576.35.032 |2 MRF | ||
| 080 | |a 577.214 |2 MRF | ||
| 100 | 1 | |a Kučera, Marek |% UČO 324228 |* [absolvent PřírF MU] |4 dis | |
| 242 | 1 | 0 | |a Epigenetic changes in plant transgenes during dedifferentiation processes |y eng |
| 245 | 1 | 0 | |a Epigenetické změny v transgenních lokusech v procesu dediferenciace rostlin |h [rukopis] / |c Marek Kučera |
| 260 | |c 2014 | ||
| 300 | |a 65 l. | ||
| 500 | |a Vedoucí práce: Aleš Kovařík | ||
| 502 | |a Diplomová práce (Mgr.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2014 | ||
| 520 | 2 | |a Rostlinné buněčné kultury se využívají k tvorbě transgenních proteinů nebo k rychlému množení rostlin. Nicméně, během kultivace buněk dochází k různým genetickým a epigenetickým změnám jako je například umlčování transgenů. Hlavním cílem této diplomové práce bylo studovat přeměnu posttranskripčního genového umlčování (PTGS) na transkripční genové umlčování (TGS) v průběhu dediferenciace a kultivace kalusové kultury tansgenního tabáku (Nicotiana tabacum). Pomocí hydrogensiřičitanového sekvenování jsem detekoval pokles metylace DNA v blízkosti obrácené repetice v TGS epialele v porovnání s PTGS epialelou. Pomocí chromatin imunoprecipitace jsem určil distribuci histonových modifikací u šesti genů, které jsou zodpovědné za epigenetickou regulaci. Výsledky naznačují, že ihned po vytvoření kalus tyto geny prodělají změny rozložení histonových značek. Pozdější fáze kalusu vykazovaly nižší variabilitu než ty počáteční. Gen ROS1 by mohl být zodpovědný za konverzi PTGS na TGS u trangenního lokus |% cze | |
| 520 | 2 | 9 | |a Plant cell cultures are used for production of transgenic proteins and rapid reproduction of plants. However, during in vitro cultivation of cell numerous genetic and epigenetic alterations may occur, including transgene silencing. The aim of this diploma thesis was to study conversion of posttranscriptional gene silencing (PTGS) to transcriptional gene silencing (TGS) in a tobacco (Nicotiana tabacum) transgene locus during dedifferentiation and callus culture cultivation. Using bisulfite sequencing, I have identified reduced DNA methylation of nonsymmetrical motifs close to the inverted repeat center in a TGS epiallele compared to the PTGS epiallele. I have used chromatin immunoprecipitation to determine histone modifications patterns at 6 genes which are responsible for epigenetic regulation. The results indicate that immediately after the callus induction many of these genes undergo changes of composition of histone marks. Late stages of cell culture appeared to have reduced variabi |9 eng |
| 650 | 0 | 7 | |a diferenciace buněk |7 ph138136 |2 czenas |
| 650 | 0 | 7 | |a ekologická genetika |7 ph172854 |2 czenas |
| 650 | 0 | 7 | |a rostlinný genom |7 ph849150 |2 czenas |
| 650 | 0 | 7 | |a techniky tkáňových kultur |x využití |2 czmesh |
| 650 | 0 | 7 | |a umlčování genů |7 ph579350 |2 czenas |
| 650 | 0 | 9 | |a cell differentiation |2 eczenas |
| 650 | 0 | 9 | |a ecological genetics |2 eczenas |
| 650 | 0 | 9 | |a gene silencing |2 eczenas |
| 650 | 0 | 9 | |a plant genome |2 eczenas |
| 650 | 0 | 2 | |a Tissue Culture Techniques |
| 655 | 7 | |a diplomové práce |7 fd132022 |2 czenas | |
| 655 | 9 | |a master's theses |2 eczenas | |
| 658 | |a Experimentální biologie |b Molekulární biologie a genetika |c PřF N-EXB BIMG (BIMG) |2 CZ-BrMU | ||
| 700 | 1 | |a Kovařík, Aleš, |d 1960- |7 xx0028286 |% UČO 24426 |4 ths | |
| 710 | 2 | |a Masarykova univerzita. |b Ústav experimentální biologie. |b Oddělení genetiky a molekulární biologie |7 mub20211111509 |4 dgg | |
| 856 | 4 | 1 | |u http://is.muni.cz/th/324228/prif_m/ |
| CAT | |c 20140627 |l MUB01 |h 0421 | ||
| CAT | |c 20140911 |l MUB01 |h 1614 | ||
| CAT | |c 20140912 |l MUB01 |h 1109 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20140912 |l MUB01 |h 1543 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20141104 |l MUB01 |h 1331 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20141104 |l MUB01 |h 1332 | ||
| CAT | |a MENSIKOVA |b 02 |c 20150529 |l MUB01 |h 1045 | ||
| CAT | |c 20150703 |l MUB01 |h 1242 | ||
| CAT | |c 20150901 |l MUB01 |h 1452 | ||
| CAT | |c 20150921 |l MUB01 |h 1413 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20151226 |l MUB01 |h 0503 | ||
| CAT | |c 20170119 |l MUB01 |h 1537 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190605 |l MUB01 |h 1416 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20191210 |l MUB01 |h 1458 | ||
| CAT | |a FIALOVA |b 02 |c 20200424 |l MUB01 |h 0914 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20201102 |l MUB01 |h 0055 | ||
| CAT | |c 20210208 |l MUB01 |h 1138 | ||
| CAT | |a VASICEKX |b 02 |c 20210510 |l MUB01 |h 1317 | ||
| CAT | |c 20210614 |l MUB01 |h 1010 | ||
| CAT | |c 20210614 |l MUB01 |h 1957 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20210724 |l MUB01 |h 1230 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20230925 |l MUB01 |h 2011 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20240409 |l MUB01 |h 2331 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20240409 |l MUB01 |h 2332 | ||
| LOW | |a POSLANO DO SKCR |b 2021-02-08 | ||
| 994 | - | 1 | |l MUB01 |l MUB01 |m VYSPR |1 KUK |a Knihovna univ. kampusu |2 SKLAD |b KUK - sklad |3 PřF-K-9879 |6 3285007912 |5 3285007912 |8 20150529 |f 71 |f Prezenční SKLAD |r 20150521 |s převod |
| AVA | |a MED50 |b KUK |c KUK - sklad |d PřF-K-9879 |e available |t K dispozici |f 1 |g 0 |h N |i 0 |j SKLAD | ||