Exprese varianty přijímačové domény histidinkinasy CKI1 rostliny Arabidopsis thaliana napodobující přijímačovou doménu AHK5.
V rostlině Arabidopsis thaliana, je dvoukomponentní systém používán k detekci signálu. Je také zodpovědný za přenos fosfátu mezi histidinkinázou a proteinem přenášející fosfát (AHP). Histidinkinázy se skládají ze tří domén: extracelulární a intracelulární histidinkinázové a přijímačové domény. Po na...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Angličtina |
| Vydáno: |
2014
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/326704/prif_b/ |
| Shrnutí: | V rostlině Arabidopsis thaliana, je dvoukomponentní systém používán k detekci signálu. Je také zodpovědný za přenos fosfátu mezi histidinkinázou a proteinem přenášející fosfát (AHP). Histidinkinázy se skládají ze tří domén: extracelulární a intracelulární histidinkinázové a přijímačové domény. Po navázání extracelulárního signálu na extracelulární doménu je histidinkinázová doména fosforylována; fosfát je poté transportován na přijímačovou doménu a AHP proteiny. Přijímačová doména je zodpovědná za interakci s AHP proteiny. V rostlině A. thaliana bylo objeveno šest AHP proteinů. CKI1 a AHK5 jsou dvě histidinkinázy A. thaliana. CKI11RD interaguje s AHP2, AHP3 a slabě s AHP1. AHK5RD interaguje s AHP1, AHP3, AHP5 a slabě s AHP2. Na základě bioinformatické analýzy předpokládáme, že smyčka L5 je zodpovědná za afinitu mezi přijímačovou doménou a AHP proteiny. Připravili jsme mutanta CKI1RDL- L5-AHK5, ve kterém jsme smyčku L5 přijímačové domény CKI1 nahradili smyčkou L5 přijímačové domény AHK5 In Arabidopsis thaliana, the two-component system is used to detect environmental signals. It is responsible for transport of phosphate between histidine kinase and Arabidopsis histidine phospho-transfer protein (AHP). Histidine kinases include three domains: extracellular, and intracellular histidine-kinase and receiver domains. Upon binding of ligand to the extra-cellular domain, histidine kinase domain is phosphorylated; the phosphate is then transferred to the receiver domain and to the AHPs. The receiver domain is responsible for interaction with AHPs. Six AHPs have been discovered in A. thaliana. CKI1 and AHK5 are two histidine kinases of A. thaliana. CKI1RD interacts with AHP2, AHP3 and weakly with AHP1. AHK5RD interacts with AHP1, AHP3, AHP5 and weakly with AHP2. Based on bioinformatics analysis, we hypothesise, that the loop L5 of CKI1RD is responsible for affinity between receiver domain and AHPs. We prepared the mutant CKI1RDL- L5-AHK5, in which the loop L5 of CKI1 has been |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Séverine Jansen |
| Fyzický popis: | 38 l. : il. |