Biochemická charakterizace halogenalkandehalogenas s modifikovanými tunely
Enzymy jsou biologické katalyzátory urychlující chemické reakce v živých organismech. Aktivní místa těchto biokatalyzátorů jsou často lokalizována hluboko uvnitř proteinové struktury a spojena s okolním prostředím pomocí vstupních cest neboli tunelů. Velikost, tvar a flexibilita tunelů hraje významn...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Angličtina |
| Vydáno: |
2014
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/358209/prif_m/ |
| Shrnutí: | Enzymy jsou biologické katalyzátory urychlující chemické reakce v živých organismech. Aktivní místa těchto biokatalyzátorů jsou často lokalizována hluboko uvnitř proteinové struktury a spojena s okolním prostředím pomocí vstupních cest neboli tunelů. Velikost, tvar a flexibilita tunelů hraje významnou roli při vstupu substrátu a rozpouštědla do aktivního místa enzymu a odchodu reakčních produktů. Halogenalkandehalogenasa LinB z bakterie Sphingobium japonicum UT26 je hydrolytický enzym katalyzující přeměnu širokého spektra halogenovaných alifatických uhlovodíků na příslušný alkohol a halogenidový aniont. Jeho aktivní místo je uloženo v hydrofobní dutině, která je spojena s okolním prostředím několika tunely. Metodou racionálního designu byly navrženy a metodami místně cílené a náhodné mutageneze zkonstruovány různé varianty halogenalkandehalogenasy LinB s modifikovanými tunely. Enzymes are natural catalysts accelerating the rate of chemical reactions in living organisms. Active sites of some of these biocatalysts are deeply buried inside the protein interior and connected with surrounding environment by access pathways, called tunnels. The size, shape and flexibility of the tunnels play a significant role in the entry of substrates or solvents into the enzyme active site and the egress of reaction products. Haloalkane dehalogenase LinB from Sphingobium japonicum UT26 is an enzyme that catalyzes hydrolytic conversion of broad range halogenated aliphatic hydrocarbons to their corresponding alcohols and halide anions. Its active site is located in predominantly buried hydrophobic cavity that is linked with the protein surface by various tunnels. Several variants of haloalkane dehalogenase LinB with modified tunnels were rationally designed and constructed by site-directed and site-saturation mutagenesis. |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Radka Chaloupková |
| Fyzický popis: | 66 l. |