Studium interakcí proteinů p53 s kvadruplexy DNA pomocí biofyzikálních a biochemických metod
V této diplomové práci byly studovány interakce různých forem proteinu p53 s kvadruplexy DNA. Protein p53 je nádorový supresor, který se účastní procesů zabraňujících vzniku a rozvoji nádorových onemocnění. Mutace genu TP53 jsou asociovány s onkogenním chováním buněk. Standardní protein p53 se kromě...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2014
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/357593/prif_m/ |
| Shrnutí: | V této diplomové práci byly studovány interakce různých forem proteinu p53 s kvadruplexy DNA. Protein p53 je nádorový supresor, který se účastní procesů zabraňujících vzniku a rozvoji nádorových onemocnění. Mutace genu TP53 jsou asociovány s onkogenním chováním buněk. Standardní protein p53 se kromě vazby na specifické sekvence DNA vyznačuje také strukturně selektivní vazbou na alternativní konformace DNA, která je zachována i mutantních proteinů p53. Kvadruplexy DNA jsou čtyřřetězcové struktury, jejichž existence v lidských buňkách byla již prokázána. V této práci byla pozorována vazba proteinu p53 a některých jeho oddělených funkčních domén na G-bohaté oligonukleotidy vytvářející kvadruplexy in vitro, které jsou odvozeny od sekvencí promotorových oblastí genů. Vazba na oligonukleotidy vytvářející kvadruplexy byla pozorována také u mutantních proteinů p53. Interakce standardní nebo mutantní formy p53 s kvadruplexy DNA v promotorových oblastech genů může být jedním s mechanismů ... In this diploma thesis the interactions of various forms of p53 proteins with quadruplex DNA were studied. p53 protein acts as a tumor suppressor which is involved in processes that prevent the formation and development of cancer. Mutations of TP53 gene are associated with oncogenic behavior of cells. Apart from sequence-specific DNA binding, wild type p53 protein can bind alternative DNA conformations in a structure-selective mode, mutant p53 proteins retained this ability. DNA quadruplexes are four-stranded structures whose presence in human cells has been detected. In this work we show that p53 protein and some of its isolated functional domains bind G-rich oligonucleotides forming quadruplexes in vitro, which are derived from the sequences of gene promoter regions. Binding of quadruplex-forming oligonucleotides by mutant p53 proteins was also observed. Interactions of wild type and mutant p53 proteins with DNA quadruplexes in gene regulatory regions may be one of the mechanisms ... |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Marie Brázdová |
| Fyzický popis: | 88 l. |