The role of DIS3L2 in the degradation of the uridylated RNA species in humans

Process degradace RNA představuje mechanismus nezbytný pro funkci a udržení vnitřní rovnováhy buněk. Tento proces je spojen s procesováním, metabolismem a kontrolou kvality RNA. V této části práce charakterizujeme in vivo a in vitro lidskou 3' - 5' exonukleáza u DIS3L2, která je spojena s...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Ustianenko, Dmytro (Autor práce)
Další autoři: Vaňáčová, Štěpánka, 1972- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2014
Témata:
bílkoviny
DIS3L2
let-7 miRNA
miRNA (nukleová kyselina)
RNA (nukleové kyseliny)
stabilita RNA
uridylace
microRNA
proteins
ribonucleic acids
uridylation
disertace
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/107230/prif_d/
Obálka
LEADER 07232ctm a22012737a 4500
001 MUB01000991082
003 CZ BrMU
005 20141103141930.0
008 140326s2014 xr ||||| |||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-12-14 
035 |a (ISMU-VSKP)161342 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 577.112  |2 MRF 
080 |a 577.113.8  |2 MRF 
080 |a 577.21  |2 MRF 
100 1 |a Ustianenko, Dmytro  |% UČO 107230  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
245 1 4 |a The role of DIS3L2 in the degradation of the uridylated RNA species in humans  |h [rukopis] /  |c Dmytro Ustianenko 
260 |c 2014 
300 |a 130 s. :  |b il. 
500 |a Vedoucí práce: Štěpánka Vaňáčová 
502 |a Dizertace (Ph.D.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2014 
520 2 |a Process degradace RNA představuje mechanismus nezbytný pro funkci a udržení vnitřní rovnováhy buněk. Tento proces je spojen s procesováním, metabolismem a kontrolou kvality RNA. V této části práce charakterizujeme in vivo a in vitro lidskou 3' - 5' exonukleáza u DIS3L2, která je spojena s tzv. Perlmanovým syndromem. Narozdíl od ostatních lidských homologních proteinů, DIS3L2 funguje nezávisle na jádru exosomu v cytoplazmě lidských buněk. Ukazujeme zde také, že DIS3L2 je zahrnuta v rozpoznávání uridylovaných typů pre-mRNA z rodiny let-7, která hraje důležitou roli během diferenciace lidských buněk. Kromě toho bylo identifikováno nové spektrum RNA molekul, které reprezentují cílovou skupinu proteinu DIS3L2. Ukazujeme, že zcela nová skupina molekul RNA může být rozpoznána a uridylována proteinem DIS3L2. Tato skupina zahrnuje mRNA, snRNA miRNA a uridylované molekuly tRNA, které nebyly zatím publikovány. Výsledky ukazují, ze exonukleáza DIS3L2 představuje nezbytný prvek v metabolismu a proc  |% cze 
520 2 9 |a The process of the RNA decay is an essential mechanism required for the function and maintenance of the cell homeostasis. It is closely connected with the RNA processing, metabolism and quality control. Here I characterized both in vivo and in vitro the Perlman syndrome associated human 3' to 5' exonuclease DIS3L2. I report that unlike its other human homologs, DIS3L2 is acting independently of the core exosome complex in the cytoplasm of human cells. I show that DIS3L2 is involved in targeting uridylated species of the pre-miRNA from the let-7 family which play a critical role during the cell differentiation. Besides this, I report on a novel repertoire of the RNA substrates which are targeted by DIS3L2. I show that DIS3L2 mediated RNA degradation is triggered by the 3' end uridylation of the RNA in vivo. We show that various classes of the RNA can be uridylated and recognized by DIS3L2. These include mRNAs, snRNAs, miRNA’s and previously unreported uridylated tRNA’s. Suggesting, that  |9 eng 
650 0 7 |a bílkoviny  |7 ph119082  |2 czenas 
650 0 7 |a DIS3L2  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a let-7 miRNA  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a miRNA (nukleová kyselina)  |7 ph716203  |2 czenas 
650 0 7 |a RNA (nukleové kyseliny)  |7 ph125167  |2 czenas 
650 0 7 |a stabilita RNA  |2 czmesh 
650 0 7 |a uridylace  |2 CZ-BrMU 
650 0 9 |a microRNA  |2 eczenas 
650 0 9 |a proteins  |2 eczenas 
650 0 9 |a ribonucleic acids  |2 eczenas 
650 0 9 |a uridylation  |2 eCZ-BrMU 
655 7 |a disertace  |7 fd132024  |2 czenas 
658 |a Biochemie (čtyřleté)  |b Biomolekulární chemie  |c PřF D-BCH4 BIOM (BIOM)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Vaňáčová, Štěpánka,  |d 1972-  |7 mub2010613414  |% UČO 105562  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Národní centrum pro výzkum biomolekul  |7 kn20100614011  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/107230/prif_d/ 
CAT |c 20140326  |l MUB01  |h 0420 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20140401  |l MUB01  |h 1457 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140417  |l MUB01  |h 1230 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140428  |l MUB01  |h 1333 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140428  |l MUB01  |h 1350 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20140829  |l MUB01  |h 1425 
CAT |c 20140911  |l MUB01  |h 1613 
CAT |c 20140912  |l MUB01  |h 1107 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20141103  |l MUB01  |h 1419 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141104  |l MUB01  |h 1320 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20150107  |l MUB01  |h 1127 
CAT |c 20150703  |l MUB01  |h 1236 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1451 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1412 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20151203  |l MUB01  |h 1045 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0449 
CAT |c 20160525  |l MUB01  |h 1552 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20161212  |l MUB01  |h 1547 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170829  |l MUB01  |h 0007 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180828  |l MUB01  |h 0911 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181106  |l MUB01  |h 0732 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 1433 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190228  |l MUB01  |h 1419 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190605  |l MUB01  |h 1343 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190620  |l MUB01  |h 0746 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 0849 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1211 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1218 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200123  |l MUB01  |h 1134 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200123  |l MUB01  |h 1137 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200323  |l MUB01  |h 1959 
CAT |a FUKSOVAX  |b 02  |c 20200924  |l MUB01  |h 1319 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 1125 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 1127 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201112  |l MUB01  |h 0515 
CAT |c 20201214  |l MUB01  |h 1118 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210217  |l MUB01  |h 2156 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210525  |l MUB01  |h 1148 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210525  |l MUB01  |h 1148 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1008 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1956 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1228 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210819  |l MUB01  |h 1812 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220324  |l MUB01  |h 2121 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220811  |l MUB01  |h 2150 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220929  |l MUB01  |h 2118 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221004  |l MUB01  |h 0159 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221220  |l MUB01  |h 0136 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230228  |l MUB01  |h 0105 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230314  |l MUB01  |h 2357 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2352 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2354 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2355 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230730  |l MUB01  |h 2154 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230910  |l MUB01  |h 2311 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231013  |l MUB01  |h 0910 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231110  |l MUB01  |h 0959 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231212  |l MUB01  |h 0014 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240313  |l MUB01  |h 0025 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240415  |l MUB01  |h 0036 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240415  |l MUB01  |h 0911 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240519  |l MUB01  |h 0019 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240613  |l MUB01  |h 2039 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240701  |l MUB01  |h 2141 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240729  |l MUB01  |h 2338 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-12-14 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-12356  |5 3285006910  |8 20141105  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20141105  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-12356  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD 

Podobné jednotky