Evolution of holocentric chromosomes and karyotypes
Tradiční pojetí chromozómů jako monocentrických chromozómů s centromerou/kinetochorem lokalizovanými v místě primární konstrikce nelze uplatnit u všech eukaryot. U některých eukaryotických linií se totiž vyvinuly holocentrické chromozómy, které tvoří kinetochor po téměř celé své délce. Ukázali jsme,...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Angličtina |
| Vydáno: |
2013
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/67595/prif_d/ |
| Shrnutí: | Tradiční pojetí chromozómů jako monocentrických chromozómů s centromerou/kinetochorem lokalizovanými v místě primární konstrikce nelze uplatnit u všech eukaryot. U některých eukaryotických linií se totiž vyvinuly holocentrické chromozómy, které tvoří kinetochor po téměř celé své délce. Ukázali jsme, že základní funkční a strukturní charakteristiky holocentrických chromozómů značně ovlivňují evoluci genomů a karyotypů holocentrických organizmů (Články I, II, III a IV), což se na úzkých fylogenetických škálách projevuje zejména v negativní korelaci mezi počtem chromozómů a velikostí genomu a v obrovské divergenci v chromozómových počtech a velikostech. Rovněž jsme prokázali, že kromě fragmentací a fúzí může být velikost holocentrických chromozómů významně ovlivněna aktivitou transpozonů (Článek II). Příčiny a okolnosti vzniku holocentrismu jsou nejasné, ale je pravděpodobné, že se holocentrické chromozómy vyvinuly jako obrana proti centromerickému tahu (Články I a III). The traditional concept of monocentric chromosomes with their centromeres/kinetochores localized in the primary constriction cannot be applied to all eukaryotes. Some eukaryotic lineages have independently evolved holocentric chromosomes that assemble a kinetochore along most of their entire length. We showed that the basic structural and functional characteristics of holocentric chromosomes are largely reflected in the evolution of whole genomes and the karyotypes of holocentric organisms (Papers I, II, III and IV). Specifically, a negative correlation exists between chromosome number and genome size, and extreme divergence in chromosomal numbers and sizes are observed at fine phylogenetic scales. We provide evidence that, in addition to fission/fusion, transposable elements are another factor that can substantially influence the size of holocentric chromosomes (Paper II). |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Petr Bureš |
| Fyzický popis: | 23 l., [64]l. příl. |