Vztah mezi stabilitou DNA a její primární strukturou
Klinické laboratoře se v dnešní době často potýkají s problémem znehodnocení DNA při běžných laboratorních manipulacích. Tento problém často přispívá k nesprávné diagnostice patogenů v těle pacientů. Tato bakalářská práce je proto zaměřena na analyzování stabilních míst genomu 4 běžných lidských pat...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2013
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/269193/prif_b_a4/ |
| LEADER | 07025ctm a22012257a 4500 | ||
|---|---|---|---|
| 001 | MUB01000871282 | ||
| 003 | CZ BrMU | ||
| 005 | 20251120080455.0 | ||
| 008 | 130907s2013 xr ||||| |||||||||||cze d | ||
| STA | |a POSLANO DO SKCR |b 2020-10-19 | ||
| 035 | |a (ISMU-VSKP)247093 | ||
| 040 | |a BOD114 |b cze |d BOD035 | ||
| 072 | 7 | |a 577 |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika |2 Konspekt |9 2 | |
| 080 | |a 573.4:616-092 |2 MRF | ||
| 080 | |a 577.113.8 |2 MRF | ||
| 080 | |a 577.21 |2 MRF | ||
| 080 | |a 578 |2 MRF | ||
| 100 | 1 | |a Linhart, Jan |% UČO 269193 |* [absolvent PřírF MU] |4 dis | |
| 245 | 1 | 0 | |a Vztah mezi stabilitou DNA a její primární strukturou |h [rukopis] / |c Jan Linhart |
| 246 | 1 | 1 | |a Relationship between stability and structure of DNA |
| 260 | |c 2013 | ||
| 300 | |a 78 l. : |b il. | ||
| 500 | |a Vedoucí práce: Omar Šerý | ||
| 502 | |a Bakalářská práce (Bc.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2013 | ||
| 520 | 2 | |a Klinické laboratoře se v dnešní době často potýkají s problémem znehodnocení DNA při běžných laboratorních manipulacích. Tento problém často přispívá k nesprávné diagnostice patogenů v těle pacientů. Tato bakalářská práce je proto zaměřena na analyzování stabilních míst genomu 4 běžných lidských patogenů, která by mohla v budoucnu přispět k přesnějšímu a spolehlivějšímu diagnostikování nemocí způsobených těmito patogeny. Konkrétně se jedná o analýzu baktérií Borrelia burdgorferi a Mycobacterium tuberculosis a virů HSV-1 a HHV-4. Analýzu jednotlivých genomů jsem prováděl pomocí specializovaného softwaru GENOMATIX: GEMs launcher, MOBYLE@PASTEUR a NCBI: sequence analysis. Analýzu jsem zaměřil na místa s vysokým obsahem guaninu a cytosinu, která by mohla kódovat specifické geny jednotlivých mikroorganismů a následně přispět k jejich správnému diagnostikování pomocí PCR metody. Dosažené výsledky ukazují, že některá analyzovaná místa se jeví jako vhodné úseky pro navržení primerů pro PCR a n |% cze | |
| 520 | 2 | 9 | |a Nowadays clinical laboratories are exposed to DNA degradation during standard laboratory manipulations. This problem often causes inaccurate diagnosis of pathogens in patient’s bodies. This bachelor's thesis is focused on analyzing of stable places of genome 4 common human pathogens, which could lead to more accurate and more reliable diagnosis of the diseases caused by these pathogens. Analysis is performed on genome 2 bacteria: Borrelia burdgorferi and Mycobacterium tuberculosis and on 2 viruses: HSV-1 a HHV-4. I performed analysis on specialized software GENOMATIX: GEMs launcher, MOBYLE@PASTEUR and NCBI: sequence analysis. Analysis was aimed at places with high content of guanine and cytosine which could code specific genes for each microorganism and which could subsequently help to reach correct diagnosis by PCR. My achieved results show that some of the analyzed places could be appropriate sequences for PCR primers and some achieved results show that some of the analyzed places c |9 eng |
| 650 | 0 | 7 | |a Borrelia burgdorferi |2 czmesh |
| 650 | 0 | 7 | |a DNA (nukleová kyselina) |7 ph116977 |2 czenas |
| 650 | 0 | 7 | |a virus Epsteinův-Barrové |2 czmesh |
| 650 | 0 | 7 | |a lidský herpesvirus 1 |2 czmesh |
| 650 | 0 | 7 | |a Mycobacterium tuberculosis |2 czmesh |
| 650 | 0 | 7 | |a patogenní organismy |7 ph115693 |2 czenas |
| 650 | 0 | 7 | |a viry |7 ph116578 |2 czenas |
| 650 | 0 | 9 | |a deoxyribonucleic acid |2 eczenas |
| 650 | 0 | 9 | |a pathogenic organisms |2 eczenas |
| 650 | 0 | 9 | |a viruses |2 eczenas |
| 650 | 0 | 2 | |a Herpesvirus 4, Human |
| 650 | 0 | 2 | |a Herpesvirus 1, Human |
| 650 | 0 | 2 | |a Borrelia burgdorferi |
| 650 | 0 | 2 | |a Mycobacterium tuberculosis |
| 655 | 7 | |a bakalářské práce |7 fd132403 |2 czenas | |
| 658 | |a Biochemie |b Biochemie |c PřF B-BCH BCHM (BCHM) [pokus č.4] |2 CZ-BrMU | ||
| 700 | 1 | |a Šerý, Omar, |d 1972- |7 xx0060835 |% UČO 18120 |4 ths | |
| 710 | 2 | |a Masarykova univerzita. |b Ústav biochemie |7 ko2015866760 |4 dgg | |
| 856 | 4 | 1 | |u http://is.muni.cz/th/269193/prif_b_a4/ |
| CAT | |c 20130907 |l MUB01 |h 0422 | ||
| CAT | |a FOLTYNOVA |b 02 |c 20131003 |l MUB01 |h 1103 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20140424 |l MUB01 |h 0833 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20140430 |l MUB01 |h 1641 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20140430 |l MUB01 |h 1646 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20140507 |l MUB01 |h 0912 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20140507 |l MUB01 |h 0924 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20140507 |l MUB01 |h 0930 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20140513 |l MUB01 |h 0801 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20140513 |l MUB01 |h 0804 | ||
| CAT | |a NEDOMOVAX |b 02 |c 20140628 |l MUB01 |h 1820 | ||
| CAT | |c 20140911 |l MUB01 |h 1613 | ||
| CAT | |c 20140912 |l MUB01 |h 1107 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20140924 |l MUB01 |h 0738 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20140924 |l MUB01 |h 0742 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20141111 |l MUB01 |h 0806 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20141111 |l MUB01 |h 0809 | ||
| CAT | |c 20150703 |l MUB01 |h 1226 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20150804 |l MUB01 |h 1759 | ||
| CAT | |c 20150901 |l MUB01 |h 1451 | ||
| CAT | |c 20150921 |l MUB01 |h 1412 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20151226 |l MUB01 |h 0416 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20160802 |l MUB01 |h 0815 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20160802 |l MUB01 |h 0818 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20160905 |l MUB01 |h 1535 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20170822 |l MUB01 |h 1622 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20180801 |l MUB01 |h 1809 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20181107 |l MUB01 |h 1608 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20181107 |l MUB01 |h 1614 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20181107 |l MUB01 |h 1623 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190105 |l MUB01 |h 1816 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190105 |l MUB01 |h 2021 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190105 |l MUB01 |h 2033 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190105 |l MUB01 |h 2142 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190126 |l MUB01 |h 0147 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190126 |l MUB01 |h 0152 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190126 |l MUB01 |h 0208 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190307 |l MUB01 |h 0735 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190307 |l MUB01 |h 0739 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190307 |l MUB01 |h 0742 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190307 |l MUB01 |h 0746 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190307 |l MUB01 |h 0749 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190521 |l MUB01 |h 1138 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190521 |l MUB01 |h 1142 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190521 |l MUB01 |h 1155 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190521 |l MUB01 |h 1436 | ||
| CAT | |a FUKSOVAX |b 02 |c 20200804 |l MUB01 |h 1743 | ||
| CAT | |c 20201019 |l MUB01 |h 1726 | ||
| CAT | |c 20210614 |l MUB01 |h 1006 | ||
| CAT | |c 20210614 |l MUB01 |h 1954 | ||
| CAT | |a REPISOVA |b 02 |c 20210719 |l MUB01 |h 1640 | ||
| CAT | |a REPISOVA |b 02 |c 20210719 |l MUB01 |h 1642 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20240604 |l MUB01 |h 2355 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20240604 |l MUB01 |h 2359 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20240605 |l MUB01 |h 0003 | ||
| CAT | |a VASICEK |b 02 |c 20251120 |l MUB01 |h 0804 | ||
| LOW | |a POSLANO DO SKCR |b 2020-10-19 | ||
| 994 | - | 1 | |l MUB01 |l MUB01 |m VYSPR |1 KUK |a Knihovna univ. kampusu |2 SKLAD |b KUK - sklad |3 PřF-K-9191 |5 3285005897 |8 20131007 |f 71 |f Prezenční SKLAD |r 20131007 |s převod |
| AVA | |a MED50 |b KUK |c KUK - sklad |d PřF-K-9191 |e available |t K dispozici |f 1 |g 0 |h N |i 0 |j SKLAD | ||