SELDI-TOF MS profilovaní patogenních bakterií se zaměřením na Enterobacteriaceae

Hmotnostní spektrometrie (MS) je v klinické mikrobiologii rutinně využívaná technika pro identifikaci bakterií. Princip identifikace MS analýzou spočívá ve vygenerování unikátního hmotnostního spektra pro každý mikroorganismus. Hmotnostní spektrum (MS) zaznamenává proteiny exprimované bakterií na zá...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Frostová, Tereza (Autor práce)
Další autoři: Zdražilová Dubská, Lenka (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Čeština
Vydáno: 2013
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/239189/prif_m_b1/
Obálka
LEADER 05408ctm a22006737a 4500
001 MUB01000851560
003 CZ BrMU
005 20140211153343.0
008 130213s2013 xr ||||| |||||||||||cze d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-08-05 
035 |a (ISMU-VSKP)208231 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD004 
072 7 |a 579  |x Mikrobiologie  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 543.51  |2 MRF 
080 |a 579.842.1/.2  |2 MRF 
080 |a 615.33.015.8  |2 MRF 
100 1 |a Frostová, Tereza  |% UČO 239189  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
242 1 0 |a SELDI-TOF MS profiling of pathogenic bacteria focused on Enterobacteriaceae  |y eng 
245 1 0 |a SELDI-TOF MS profilovaní patogenních bakterií se zaměřením na Enterobacteriaceae  |h [rukopis] /  |c Tereza Frostová 
260 |c 2013 
300 |a 75 l. +  |e 1 vlepená příl. 
500 |a Vedoucí práce: Lenka Zdražilová Dubská 
502 |a Diplomová práce (Mgr.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2013 
520 2 |a Hmotnostní spektrometrie (MS) je v klinické mikrobiologii rutinně využívaná technika pro identifikaci bakterií. Princip identifikace MS analýzou spočívá ve vygenerování unikátního hmotnostního spektra pro každý mikroorganismus. Hmotnostní spektrum (MS) zaznamenává proteiny exprimované bakterií na základě jejich molekulové hmotnosti. Potenciální využití MS profilů pro stanovení antibiotické rezistence a biochemického fenotypu bylo předmětem této diplomové práce. Za použití SELDI-TOF MS, která je variantou MALDI-TOF MS techniky, a s použitím kovových čipů bez upraveného povrchu byly analyzovány kmeny Klebsiella pneumoniae a Escherichia coli. V případě K. pneumoniae shluková analýza identifikovala soubor píků u cefoxitinu, na jejichž základě je možné rozlišit citlivé kmeny od rezistentních. Dále byly identifikovány píky představující biomarkery pro stanovení citlivosti/rezistence k aztreonamu a cefotaximu v závislosti na jejich intenzitě. V případě E. coli byly identifikovány píky, jejichž intenzita charakterizuje citlivost/rezistenci k antibiotikům co-trimoxazolu a cefazolinu a dále píky, jejichž intenzita rozliší laktózový fenotyp. MS analýza umožňuje tuto identifikaci bez kultivace na selektivních médiích a bez kultivace s antibiotiky.  |% cze 
520 2 9 |a Mass spectrometry (MS) is in clinical microbiology technique routinely used to identify bacteria. The principle of identifying MS analysis is to generate a unique mass spectra for each microorganism. Mass spectrum (MS) records the expressed proteins of bacteria on the basis of their molecular weight. Potential use of MS profiles for the determination of antibiotic resistance and biochemical phenotypes was the subject of this thesis. Applying of SELDI-TOF MS, which is a variant of MALDI-TOF MS techniques, and using metal chips without the modified surface there were analyzed strains of Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli. In the case of Klebsiella pneumoniae cluster analysis identified a set of peaks with cefoxitin, on the basis of which it is possible to distinguish susceptible from resistant strains. To establish sensitivity/resistance to aztreonam and cefotaxime according to their intensity, peaks representing biomarkers were identified. In the case of Escherichia coli peaks whose intensity is characterized by sensitivity / resistance to the antibiotic co-trimoxazole, and cefazolin were identified as well as peaks whose intensity distinguish lactose phenotype. MS analysis enables this identification without cultivation on the selective media and without antibiotics.  |9 eng 
650 0 7 |a enterobakterie  |7 ph119947  |2 czenas 
650 0 7 |a hmotnostní spektrometrie  |7 ph120763  |2 czenas 
650 0 7 |a rezistence vůči antibiotikům  |7 ph311247  |2 czenas 
650 0 7 |a testy  |2 CZ-BrMU 
650 0 9 |a antibiotics resistance  |2 eczenas 
650 0 9 |a enterobacteriaceae  |2 eczenas 
650 0 9 |a Enterobacteriaceae  |2 eczenas 
650 0 9 |a mass spectrometry  |2 eczenas 
650 0 9 |a mass spectroscopy  |2 eczenas 
650 0 9 |a tests  |2 eCZ-BrMU 
655 7 |a diplomové práce  |7 fd132022  |2 czenas 
655 9 |a master's theses  |2 eczenas 
658 |a Experimentální biologie  |b Obecná biologie  |c PřF N-EXB SPBI (BIOB)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Zdražilová Dubská, Lenka  |7 xx0080373  |% UČO 16442  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav experimentální biologie  |7 mzk2008412438  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/239189/prif_m_b1/ 
CAT |c 20130213  |l MUB01  |h 0420 
CAT |a RACLAVSKA  |b 02  |c 20130215  |l MUB01  |h 1535 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20130304  |l MUB01  |h 1536 
CAT |a MENSIKOVA  |b 02  |c 20140211  |l MUB01  |h 1533 
CAT |c 20140911  |l MUB01  |h 1611 
CAT |c 20140912  |l MUB01  |h 1105 
CAT |c 20150703  |l MUB01  |h 1217 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1450 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1411 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0352 
CAT |c 20200805  |l MUB01  |h 1101 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1003 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1951 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1219 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-08-05 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-9617  |5 3145356915  |8 20130215  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20130130  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-9617  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD