Porovnání interakce tubulinu s různými kancerostatickými ligandy

V této bakalářské práci jsem se pokusil zjistit, které ze tří dobře známých vazebných míst tubulinu (Vinca, Taxanové a Kolchicinové) je vazebným místem pro tubulysin. Tubulysin je vysoce účinná antimitotická látka, která je schopná u dělících se buněk indukovat apoptózu svým působením na tubulin mik...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Jurásek, Miroslav (Autor práce)
Další autoři: Kubíček, Karel, 1977- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Čeština
Vydáno: 2012
Témata:
kolchicinová doména
tubulin
colchicine domain
anticancer drugs
Tubulin
bakalářské práce
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/324029/prif_b/
Obálka
LEADER 05314ctm a22007577a 4500
001 MUB01000722098
003 CZ BrMU
005 20130522084512.0
008 120703s2012 xr ||||| |||||||||||cze d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-05-07 
035 |a (ISMU-VSKP)208979 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD004 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 577.3  |2 MRF 
100 1 |a Jurásek, Miroslav  |% UČO 324029  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
242 1 0 |a Comparison of interaction between tubulin and various anti-cancer drugs  |y eng 
245 1 0 |a Porovnání interakce tubulinu s různými kancerostatickými ligandy  |h [rukopis] /  |c Miroslav Jurásek 
260 |c 2012 
300 |a 64 l. 
500 |a Vedoucí práce: Karel Kubíček 
502 |a Bakalářská práce (Bc.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2012 
520 2 |a V této bakalářské práci jsem se pokusil zjistit, které ze tří dobře známých vazebných míst tubulinu (Vinca, Taxanové a Kolchicinové) je vazebným místem pro tubulysin. Tubulysin je vysoce účinná antimitotická látka, která je schopná u dělících se buněk indukovat apoptózu svým působením na tubulin mikrotubulů. Avšak způsob, jakým se tubulysin váže na tubulin a jak vypadá struktura komplexu tubulin-tubulysin je stále nezodpovězenou otázkou. K nalezení odpovědi na tuto otázku jsem se rozhodl využít procesu molekulového dokování, který je schopen nalézt pravděpodobné způsoby interakce mezi receptorem (tubulin) a ligandem (tubulysin). Jako receptorové molekuly jsem využil struktury tubulinu z PDB a pro ligand jsem použil strukturu vázaného tubulysinu získanou za pomoci NMR. Jako výsledek dokování jsem získal soubor možných konformací tubulysinu interagujícího s tubulinem. Tyto pravděpodobné konformace komplexu tubulin-tubulysin jsem navzájem porovnal v diskusi, nejlepší výsledky a možnosti, jak je potvrdit, popisuji v závěru bakalářské práce.  |% cze 
520 2 9 |a In this thesis I have tried to figure out which of three common known binding sites of tubulin (Vinca, Taxane and Colchicine), is the binding site of tubulysin. Tubulysin is a highly potent antimitotic agent that induces apoptosis in dividing cells by interaction with tubulin in microtubules. However, the way in which tubulysin binds to tubulin and how the structure of tubulin-tubulysin complex looks like, it is still in question. In order to answer the question, I have decided to use a process called docking which is able to find out a suitable binding pose of a ligand (tubulysin) in the interaction with a receptor (tubulin). As receptors, I have used structures of tubulin from PDB and as a ligand I have used a structure of bound tubulysin derived from NMR. As the result of docking, I have obtained a set of possible conformations of tubulysin in the interaction with tubulin. These possible conformations of tubulin-tubulysin complexes have been compared in conclusion and the best results and ways how to prove them were described at the end of the thesis.  |9 eng 
650 0 7 |a kolchicinová doména  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a tubulin  |2 czmesh 
650 0 9 |a colchicine domain  |2 eCZ-BrMU 
650 0 2 |a anticancer drugs 
650 0 2 |a Tubulin 
655 7 |a bakalářské práce  |7 fd132403  |2 czenas 
658 |a Fyzika  |b Biofyzika  |c PřF B-FY BF (BF)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Kubíček, Karel,  |d 1977-  |7 mub2013762059  |% UČO 20563  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Přírodovědecká fakulta.  |b Fyzikální sekce  |7 kn20020321517  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/324029/prif_b/ 
CAT |c 20120703  |l MUB01  |h 0423 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20120712  |l MUB01  |h 1340 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20120718  |l MUB01  |h 0823 
CAT |a RACLAVSKA  |b 02  |c 20120720  |l MUB01  |h 1535 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20120726  |l MUB01  |h 1016 
CAT |a NOVAKOVA  |b 02  |c 20121003  |l MUB01  |h 0948 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20130304  |l MUB01  |h 1434 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20130522  |l MUB01  |h 0845 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20130522  |l MUB01  |h 0847 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20130730  |l MUB01  |h 0746 
CAT |c 20140911  |l MUB01  |h 1610 
CAT |c 20140912  |l MUB01  |h 1104 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1449 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1410 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0245 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180826  |l MUB01  |h 1454 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180826  |l MUB01  |h 1505 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190109  |l MUB01  |h 1226 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190129  |l MUB01  |h 0937 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190129  |l MUB01  |h 0941 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190129  |l MUB01  |h 0953 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190227  |l MUB01  |h 0752 
CAT |c 20200507  |l MUB01  |h 1115 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 0223 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 0959 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1948 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1215 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210819  |l MUB01  |h 1726 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230808  |l MUB01  |h 2127 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-05-07 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 PRIF  |a Přírodovědecká fakulta  |2 PRSFY  |b ÚK sklad - F  |3 K-12761  |5 3145355511  |8 20120720  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |q 20180809  |r 20120720  |s dar 
AVA |a SCI50  |b PRIF  |c ÚK sklad - F  |d K-12761  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j PRSFY 

Podobné jednotky